王雪婷撰寫了這篇文章。 Xueting Wang 開發了此插件,作為生物統計學大學部學生暑期實習(BUSI)北卡羅來納大學教堂山分校的計畫。

介紹
當您想要查看來自不同研究的證據並解釋系統性回顧的整體結果時,您會使用什麼數據視覺化?森林圖是一個不錯的選擇,因為它在緊湊的空間中垂直顯示幾個置信區間或可信區間。 JMP 森林圖插件(適用於 JMP 17 及更高版本)提供了一種生成森林圖的簡單方法,並具有多種應用程序,可幫助您呈現各種結果,包括:
- 多個研究的單一終點,以及跨研究的該終點的總體估計。
- 一項研究的多個終點。
- 子組內的單一端點。
- 單一終點隨時間觀察到的結果或相對於基線的任何變化。
對話和角色
Figure 1. Forest Plot Add-In dialog圖 1. 森林圖插件對話框
對話框的角色包括:
- 子組是字元列的值,指定某列為子組因子。當應用它時,具有相同子組的各個行將被分組在一起。它將顯示於 Y 軸上,標籤值會嵌套在子組值中。
- 標籤(必需)是顯示在 Y 軸上的字元列的值。如果未使用 Subgroup,則認為 Label 欄位的值在資料表的各行之間是唯一的;如果使用了 Subgroup,則認為 Label 資料列的值在各行中都是唯一的。
- 下限(必需)是數字列的值,表示估計的可信度或信賴區間的下限值。
- 中心值(必需)是包含可信或置信區間正在匯總的估計值的數字列的值。
- 上限(必需)是數字列的值,表示估計的可信度或信賴區間的上限值。
- 信賴區間文字是在右軸上顯示文字的字元列的值,通常包括估計值和信賴區間。
- 大小是包含每行樣本大小的數字列的值,將用於修改中心值的標記大小。
對話框中還有其他幾個選項:
選取此方塊將根據空值新增虛線垂直參考線並啟用:
- 高於/低於零值的區間顏色首選項:區間顏色有三個選項。它有助於強調排除空值的區間。如果間隔包含空值,則它將為黑色。
- 空值:此方塊會根據您的偏好設定空值。
- 資料表順序
選取此選項後,森林圖將依照資料表中的順序顯示行。否則,行將按照資料表的相反順序排列。
當最後一行的標籤值等於「總體」或「總計」時,將以菱形(而非常規標記)來表示信賴區間或可信區間。
如何使用
- 從 JMP Marketplace 下載森林圖片插件並雙擊安裝。安裝後,可以在插件選單中找到它。
- 開啟數據表。然後選擇“插件”>“森林圖”開啟對話框。
- 將列拖曳到對話方塊中的角色中並選擇其他適當的選項。
- 點擊“運行”即可產生圖表。
現在我們將展示如何使用 Forest Plot Add-In 和來自醫學文獻的幾個資料表。
ForestPlotSample_HBV.jmp包含慢性B型肝炎病毒 (HBV) 感染患者的臨床試驗的主要二元終點和六個次要二元終點。它包括終點類型(子組)、標籤、恩替卡韋和拉米夫定之間的比例差異、95% 置信區間的下限和上限,以及包含估計值和 95% 置信區間文字的格式化欄位。圖 2 顯示了分配了角色的列的基本森林圖,其中 Null 值 = 0。
Figure 2. HBV example圖 2. HBV 範例
圖 3 顯示了使用 HBV 資料產生的森林圖。參考線右側的置信區間被標為藍色,以視覺提示這些區間不包含零值。
Figure 3. HBV forest plot without Subgroup and Confidence Interval text圖 3. 不包含子群組和信賴區間文字的 HBV 森林圖
我們可以將子組(端點類型)和信賴區間文字角色套用到此圖(圖 4)。現在,標籤嵌套在左軸的子群組中,而置信區間文字位於右軸上。
Figure 4. HBV forest plot with Subgroup and Confidence Interval text圖 4. 包含子群組和信賴區間文字的 HBV 森林圖
我們使用資料表ForestPlotSample_RosaMeta.jmp ,其中包含頻率列和「總體」行,以演示針對 II 型糖尿病 (T2DM) 患者的薈萃分析的「大小」角色和「為總體或總計添加置信度菱形標籤」選項。
Figure 5. T2DM example圖 5. 2 型糖尿病範例
圖 6 展示了具有「大小」角色的森林圖,並應用了「總體」或「總標籤」的「添加置信度菱形」。每個區間估計值的標記大小依計數列而不同,代表樣本大小。在圖的底部的「總體」行中,為統合分析結果繪製了一個置信菱形。
Figure 6. T2DM forest plot with Size and Confidence Diamond圖 6. 具有大小和置信度菱形的 T2DM 森林圖
這個新插件解決了 Forest Plot 插件早期版本中發現的幾個問題(詳情請見此處)。此外,除了「置信度」菱形之外,所有元素都是使用原生圖形產生器功能產生的,這使得使用者可以更輕鬆地修改森林圖的顏色或符號大小,使其超出插件最初生成的大小。討厭用藍色和紅色來強調間隔的配色嗎?現在可以根據使用者喜好更改這些顏色,並且可以將修改後的簡報的腳本儲存到資料表中以反映任何新增後的修改。
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