Xueting Wang이 이 블로그 게시물을 작성했습니다. Xueting Wang은 이 추가 기능을 개발했습니다.생물통계학 학부 여름 인턴십(BUSI) 프로그램(노스캐롤라이나 대학교 채플힐 캠퍼스)
소개
여러 연구의 근거를 확인하고 체계적 고찰의 전반적인 결과를 해석할 때 어떤 데이터 시각화를 사용하시나요? 포레스트 플롯은 여러 신뢰 구간 또는 신뢰 구간을 컴팩트한 공간에 수직으로 표시하기 때문에 좋은 선택입니다. JMP 포레스트 플롯 추가 기능(JMP 17 이상 버전에서 사용 가능)은 포레스트 플롯을 생성하는 간편한 방법을 제공하며, 다양한 용도로 활용 가능하여 다음과 같은 다양한 결과를 제시하는 데 도움이 됩니다.
- 여러 연구에 대한 단일 종료점과 여러 연구 전체에 대한 해당 종료점의 전반적인 추정치입니다.
- 한 연구의 다중 종료점.
- 하위 그룹 내의 단일 종료점.
- 단일 종료 시점에 대한 기준선에서의 관찰된 결과나 변화입니다.
대화와 역할
Figure 1. Forest Plot Add-In dialog그림 1. Forest Plot 추가 기능 대화 상자
대화의 역할은 다음과 같습니다.
- 하위 그룹은 열을 하위 그룹 요인으로 지정하는 문자 열의 값입니다. 이 값이 적용되면 동일한 하위 그룹을 가진 개별 행이 함께 그룹화됩니다. Y축에는 레이블 값이 하위 그룹 값 내에 중첩되어 표시됩니다.
- 레이블 (필수)은 Y축에 표시되는 문자 열의 값입니다. 하위 그룹을 사용하지 않으면 레이블 열의 값은 데이터 테이블의 행 전체에서 고유한 것으로 간주되고, 하위 그룹을 사용하는 경우 각 하위 그룹 값에 대해 행 내에서 고유한 것으로 간주됩니다.
- 하한 (필수)은 추정치의 신뢰할 수 있는 구간이나 신뢰 구간의 하한 값을 나타내는 숫자 열의 값입니다.
- 중심값 (필수)은 신뢰할 수 있는 구간이나 신뢰 구간이 요약되는 추정치를 포함하는 숫자 열의 값입니다.
- 상한 (필수)은 추정치의 신뢰할 수 있는 구간이나 신뢰 구간의 상한값을 나타내는 숫자 열의 값입니다.
- 신뢰 구간 텍스트 는 오른쪽 축에 텍스트를 표시하는 문자 열의 값으로, 일반적으로 추정치와 신뢰 구간을 포함합니다.
- 크기는 중심 값에 대한 마커 크기를 수정하는 데 사용될 각 행의 샘플 크기를 포함하는 숫자 열의 값입니다.
대화 상자에는 몇 가지 다른 옵션이 있습니다.
이 상자를 선택하면 null 값을 기준으로 점선 수직 참조선이 추가되고 다음이 활성화됩니다.
- Null 값 위/아래 간격에 대한 색상 기본 설정: 간격 색상에는 세 가지 옵션이 있습니다. Null 값을 제외한 간격을 강조하는 데 도움이 될 수 있습니다. 간격에 Null 값이 포함되면 검은색으로 표시됩니다.
- Null 값: 이 상자는 Null 값을 사용자의 기본 설정으로 설정합니다.
- 데이터 테이블 순서
이 옵션을 선택하면 포레스트 플롯에서 행이 데이터 표에 있는 순서대로 표시됩니다. 그렇지 않으면 행이 데이터 표의 역순으로 표시됩니다.
- 전체 또는 총 라벨에 대한 신뢰 다이아몬드 추가
마지막 행의 레이블 값이 전체 또는 합계와 같으면 일반 마커 대신 다이아몬드가 신뢰 구간 또는 신뢰 구간을 나타냅니다.
사용 방법
- JMP 마켓플레이스에서 Forest Plot 추가 기능을 다운로드하고 두 번 클릭하여 설치하세요. 설치가 완료되면 추가 기능 메뉴에서 찾을 수 있습니다.
- 데이터 테이블을 엽니다. 그런 다음 추가 기능 > Forest Plot을 선택하여 대화 상자를 엽니다.
- 대화 상자에서 역할로 열을 끌어다 놓고 다른 적절한 옵션을 선택합니다.
- '실행'을 클릭하여 플롯을 생성합니다.
이제 의학 문헌의 여러 데이터 표와 함께 Forest Plot 추가 기능을 사용하는 방법을 보여드리겠습니다.
ForestPlotSample_HBV.jmp 는 만성 B형 간염 바이러스(HBV) 감염 환자를 대상으로 한 임상 시험의 1차 및 6차 이진 평가변수를 포함합니다. 이 파일에는 평가변수 유형(하위 그룹), 라벨, 엔테카비르와 라미부딘의 비율 차이, 95% 신뢰구간의 하한 및 상한 열, 그리고 추정값과 95% 신뢰구간을 텍스트로 포함하는 서식 있는 필드가 포함됩니다. 역할에 할당된 열이 포함된 기본 포레스트 플롯은 그림 2에 제시되어 있으며, Null 값은 0입니다.
Figure 2. HBV example그림 2. HBV 예
HBV 데이터를 사용하여 생성된 포레스트 플롯은 그림 3에 나와 있습니다. 참조선의 가장 오른쪽에 있는 신뢰 구간은 이 구간에 Null 값이 포함되지 않는다는 것을 시각적으로 나타내기 위해 파란색으로 표시됩니다.
Figure 3. HBV forest plot without Subgroup and Confidence Interval text그림 3. 하위 그룹 및 신뢰 구간 텍스트가 없는 HBV 포레스트 플롯
이 그림에 하위 그룹(종점 유형)과 신뢰 구간 텍스트 역할을 적용할 수 있습니다(그림 4). 이제 레이블은 왼쪽 축의 하위 그룹 내에 중첩되고, 신뢰 구간 텍스트는 오른쪽 축에 배치됩니다.
Figure 4. HBV forest plot with Subgroup and Confidence Interval text그림 4. 하위 그룹 및 신뢰 구간 텍스트가 포함된 HBV 포레스트 플롯
2형 당뇨병(T2DM) 환자의 메타 분석에 대한 크기 역할과 전체 또는 전체 레이블에 대한 신뢰도 다이아몬드 추가 옵션을 보여주기 위해 빈도 열과 "전체" 행이 포함된 데이터 테이블 ForestPlotSample_RosaMeta.jmp 를 사용합니다.
Figure 5. T2DM example그림 5. T2DM 예
그림 6은 크기 역할과 전체 또는 전체 레이블에 대한 신뢰도 다이아몬드 추가가 적용된 포레스트 플롯을 보여줍니다. 각 구간의 추정치를 나타내는 마커의 크기는 표본 크기를 나타내는 계수 열에 따라 달라집니다. 플롯 하단의 전체 행에는 메타분석 결과에 대한 신뢰도 다이아몬드가 그려져 있습니다.
Figure 6. T2DM forest plot with Size and Confidence Diamond그림 6. 크기 및 신뢰도 다이아몬드가 있는 T2DM 포레스트 플롯
이 새로운 추가 기능은 Forest Plot 추가 기능의 초기 버전에서 발견된 여러 문제를 해결합니다(자세한 내용은 여기 참조). 또한, 신뢰도 다이아몬드를 제외한 모든 요소는 기본 Graph Builder 기능을 사용하여 생성되므로 사용자는 추가 기능에서 처음 생성된 것 외에도 Forest Plot의 색상이나 기호 크기를 쉽게 수정할 수 있습니다. 간격을 강조하기 위해 파란색과 빨간색 색상 구성표가 마음에 들지 않으시나요? 이제 이러한 색상을 사용자 선호도에 따라 변경할 수 있으며, 수정된 프레젠테이션의 스크립트를 데이터 테이블에 저장하여 추가 기능 이후 수정 사항을 반영할 수 있습니다.
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