このブログ記事はXueting Wangが執筆しました。Xueting Wangはこのアドインを生物統計学部夏季インターンシップノースカロライナ大学チャペルヒル校の (BUSI) プログラム。
導入
様々な研究のエビデンスを視覚化し、システマティックレビューの全体的な結果を解釈する際に、どのようなデータ可視化ツールを活用されていますか？フォレストプロットは、複数の信頼区間または信用区間をコンパクトなスペースに縦に表示できるため、優れた選択肢です。JMPフォレストプロットアドイン（JMP 17以降のリリースで有効）は、フォレストプロットを簡単に作成できるだけでなく、様々な結果を提示するのに役立つ様々な用途を備えています。例えば、以下のような様々な結果を提示できます。
- 複数の研究に対する単一のエンドポイント、および研究全体にわたるそのエンドポイントの全体的な推定値。
- 1 つの研究に複数のエンドポイントがあります。
- サブグループ内の単一のエンドポイント。
- 時間の経過に伴う単一のエンドポイントの観察された結果またはベースラインからの変化。
対話と役割
Figure 1. Forest Plot Add-In dialog図1.フォレストプロットアドインダイアログ
ダイアログの役割は次のとおりです。
- サブグループは、文字列の値であり、列をサブグループ要素として指定します。これを適用すると、同じサブグループを持つ個々の行がグループ化されます。Y軸には、ラベルの値がサブグループの値にネストされた状態で表示されます。
- ラベル（必須）は、Y軸に表示される文字列の値です。ラベル列の値は、サブグループが使用されていない場合はデータテーブルの行全体で一意であるとみなされ、サブグループが使用されている場合は、各行内でサブグループごとに一意であるとみなされます。
- 下限値(必須) は、推定値の信頼できる区間または信頼区間の下限値を表す数値列の値です。
- 中心値(必須) は、信頼できる区間または信頼区間が要約される推定値を含む数値列の値です。
- 上限(必須) は、推定値の信頼できる区間または信頼区間の上限値を表す数値列の値です。
- 信頼区間テキストは、右側の軸にテキストを表示する文字列の値であり、通常は推定値と信頼区間が含まれます。
- サイズは、センター値のマーカーのサイズを変更するために使用される各行のサンプル サイズを含む数値列の値です。
ダイアログには他にもいくつかのオプションがあります。
このボックスをチェックすると、null 値に基づいて破線の垂直参照線が追加され、次の機能が有効になります。
- NULL値の上/下の区間の色設定：区間の色には3つのオプションがあります。NULL値を含まない区間を強調表示するのに役立ちます。区間にNULL値が含まれる場合は黒になります。
- NULL 値:このボックスでは、NULL 値を好みに応じて設定します。
- データテーブルの順序
このオプションをオンにすると、フォレストプロットはデータテーブル内の行の順序で表示します。オフにすると、行はデータテーブル内の順序と逆の順序で表示されます。
- 全体または合計ラベルに信頼度ダイヤモンドを追加する
最後の行のラベルの値が全体または合計に等しい場合、通常のマーカーの代わりにダイヤモンドが信頼区間または信用区間を表します。
使い方
- JMPマーケットプレイスからフォレストプロットアドインをダウンロードし、ダブルクリックしてインストールしてください。インストールが完了すると、「アドイン」メニューに表示されます。
- データテーブルを開きます。次に、 「アドイン」>「フォレストプロット」を選択してダイアログを開きます。
- ダイアログ内のロールに列をドラッグし、他の適切なオプションを選択します。
- 「実行」をクリックしてプロットを生成します。
ここでは、医学文献のいくつかのデータ テーブルで Forest Plot アドインを使用する方法を説明します。
ForestPlotSample_HBV.jmpには、慢性B型肝炎ウイルス（HBV）感染患者を対象とした臨床試験における主要エンドポイントと6つの副次的バイナリエンドポイントが含まれています。エンドポイントの種類（サブグループ）、ラベル、エンテカビルとラミブジンの割合の差、95%信頼区間の下限値と上限値の列、そして推定値と95%信頼区間のテキストを含む書式設定されたフィールドが含まれています。図2は、列に役割を割り当てた基本的なフォレストプロットで、Null 値が 0 の場合を示しています。
Figure 2. HBV example図2. HBVの例
HBV データを使用して作成されたフォレスト プロットを図 3 に示します。参照線の右端にある信頼区間は青色で表示され、これらの区間に Null 値が含まれていないことを視覚的に示します。
Figure 3. HBV forest plot without Subgroup and Confidence Interval text図3. サブグループと信頼区間のテキストなしのHBVフォレストプロット
このプロットに「サブグループ（エンドポイントタイプ）」と「信頼区間」のテキストロールを適用できます（図4）。これで、ラベルは左軸の「サブグループ」内にネストされ、「信頼区間」のテキストは右軸に沿って配置されます。
Figure 4. HBV forest plot with Subgroup and Confidence Interval text図4. サブグループと信頼区間のテキストを含むHBVフォレストプロット
頻度列と「全体」行を含むデータ テーブルForestPlotSample_RosaMeta.jmpを使用して、2 型糖尿病 (T2DM) 患者のメタ分析のサイズ ロールと全体または合計ラベルの信頼度ダイヤモンドの追加オプションを説明します。
Figure 5. T2DM example図5. 2型糖尿病の例
図6は、「サイズ」ロールと「全体または合計ラベルに信頼度ダイヤモンドを追加」を適用したフォレストプロットを示しています。各区間の推定値を示すマーカーのサイズは、サンプルサイズを表すカウント列に応じて変化します。プロット下部の「全体」行には、メタアナリシス結果の信頼度ダイヤモンドが描画されています。
Figure 6. T2DM forest plot with Size and Confidence Diamond図6. サイズと信頼度ダイヤモンド付きT2DMフォレストプロット
この新しいアドインは、フォレストプロットアドインの初期バージョンで特定されたいくつかの問題に対処しています（詳細はこちら）。さらに、信頼度ダイヤモンドを除くすべての要素はネイティブのグラフビルダー機能を使用して生成されるため、アドインによって最初に生成されたものを超えて、フォレストプロットの色やシンボルサイズを簡単に変更できます。間隔を強調するための青と赤の配色が気に入らない場合は、これらの色をユーザーの好みに合わせて変更できるようになりました。また、変更したプレゼンテーションのスクリプトをデータテーブルに保存して、アドイン適用後の変更を反映できます。
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