Pourquoi la qualité des données HTS est importante : les pharmacophores de l'éphrine et les corrélations statistiques dépendent de la méthode de distribution
Sean Ekins, consultant principal, Collaborations en chimie ; Joe Olechno, chercheur principal, Labcyte Inc. ; Antony J. Williams, vice-président du développement stratégique, ChemSpider, Royal Society of Chemistry.
Les procédés de distribution et les outils utilisés ont une influence considérable sur les estimations de l'activité des composés. Des chercheurs ont montré que les lixiviats provenant de matériel de laboratoire en plastique peuvent considérablement affecter les analyses biologiques (1, 2). Les données obtenues à l'aide d'une dilution et d'une distribution en série à embouts jetables ont montré une réduction de l'inhibition par rapport à la distribution acoustique, certains composés apparaissant des centaines de fois plus actifs avec le procédé acoustique (3-6). De plus, aucune corrélation n'a été observée entre l'activité des composés et les deux procédés. Les études de criblage à haut débit (HTS) présentent des résultats confondants susceptibles d'influencer le jugement scientifique et de favoriser des décisions erronées. Certains chercheurs ont montré que les différences d'activité biologique pouvaient varier de trois ordres de grandeur ou plus (3-6). Nous examinons comment ces erreurs peuvent affecter les modèles informatiques et les données présentes dans des bases de données externes. Nous démontrons que les procédés de distribution ont un impact sur les résultats informatiques et statistiques.