統計方法分析小鼠肌肉植入金屬顆粒的大規模、多治療、時間過程研究
SAS 的 Wenjun Bao、Russell D. Wolfinger 和 Tzu-Ming Chu；愛德華·珀金斯 (Edward Perkins)，美國陸軍工程研究與發展中心；戴斯蒙德·I·班農（Desmond I. Bannon），公共衛生研究所
在對小鼠進行單一植入顆粒（鎳、鎢/鎳/鈷合金、鉭或對照）效果的時間過程研究中，產生了超過 400 個 Illumina Sentrix MouseRef-8 v1.1 表達珠晶片陣列，以評估治療對基因表現譜隨時間的影響。我們針對與如此大的數據集相關的幾個數據分析挑戰提出了解決方案。首先，轉化：有大量基因具有負強度值。我們研究了移位對數和缺失值插補方法。第二，標準化：與微陣列樣品製備完成日期相關的批次效應明顯。我們探索了不同的標準化方法，包括分組批次設定檔 (GBP) 校正。第三，差異表達基因：我們採用混合模型變異數分析方法來檢驗它們的差異。
