JMP® Genomics 中的連鎖圖優化可改善農作物
SAS Institute Inc. 的 Kelci Miclaus 和 Rebekah Oliver；以及美國農業部農業研究局的 Eric Jackson
建立良好的連鎖圖譜，將遺傳標記相對放置在適當的位置，對於許多植物和動物物種的數量性狀基因座 (QTL) 分析至關重要。將 DNA 標記與遺傳性狀聯繫起來，可以利用標記輔助育種方法來選擇具有所需性狀（如提高抗病性和增加產量）的植物，從而提高農作物研究的效率。使用已知譜系的實驗群體的樣本的 DNA 標記基因型來建立連鎖圖。標記根據其連接緊密程度（透過其重組率來衡量）被分配到連接組。確定群體內標記的最佳順序，計算最短遺傳距離圖。 JMP Genomics 5.1 中的新功能可以計算連鎖群，並使用 SAS/OR 的 PROC OPTMODEL 中的最佳化程式確定最佳排序的標記圖。作為燕麥合作研究企業 (CORE) 正在進行的研究的一部分，我們在對來自重組自交系的燕麥植物的 DNA 標記分析中重點介紹了這些新特徵。
