JMP® Genomics 中的连锁图优化可改善农作物
SAS Institute Inc. 的 Kelci Miclaus 和 Rebekah Oliver；以及美国农业部农业研究局的 Eric Jackson
构建良好的连锁图谱，将遗传标记相对放置在彼此的位置，对于许多植物和动物物种的数量性状位点 (QTL) 分析至关重要。将 DNA 标记与遗传性状联系起来，可以提高农作物研究的效率，因为这样可以使用标记辅助育种方法来选择具有理想性状（如提高抗病性和增加产量）的植物。使用来自已知谱系的实验种群的样本的 DNA 标记基因型构建连锁图谱。标记根据其连接的紧密程度（以重组率衡量）被分配到连锁群。确定组内标记的最佳顺序以计算最短遗传距离图谱。JMP Genomics 5.1 中的新功能使用 SAS/OR 的 PROC OPTMODEL 中的优化程序计算连锁群并确定最佳排序的标记图谱。我们在分析来自重组自交系的燕麦植物的 DNA 标记时重点介绍了这些新功能，这是燕麦研究合作组织 (CORE) 正在进行的研究的一部分。
