농업 작물 개량을 위한 JMP® Genomics의 연계 맵 최적화
Kelci Miclaus와 Rebekah Oliver, SAS Institute Inc.; 및 Eric Jackson, USDA-ARS
서로에 대한 유전적 마커를 배치하는 잘 구성된 연관 지도는 많은 식물 및 동물 종의 양적 형질 자리(QTL) 분석에서 중요합니다. DNA 마커를 유전적으로 물려받은 형질과 연관시키면 마커 지원 육종 접근 방식을 사용하여 질병 저항성 개선 및 수확량 증가와 같은 바람직한 형질을 가진 식물을 선택할 수 있으므로 농업 작물 연구의 효율성이 향상됩니다. 연관 지도는 알려진 혈통의 실험적 집단에서 채취한 샘플에 대한 DNA 마커 유전자형을 사용하여 구성됩니다. 마커는 재조합률로 측정한 대로 얼마나 밀접하게 연결되어 있는지에 따라 연관 그룹에 할당됩니다. 그룹 내 마커의 최적 순서는 가장 짧은 유전적 거리 지도를 계산하기 위해 결정됩니다. JMP Genomics 5.1의 새로운 기능은 연관 그룹을 계산하고 SAS/OR의 PROC OPTMODEL에서 최적화 루틴을 사용하여 최적으로 정렬된 마커 지도를 결정합니다. 우리는 Collaborative Oat Research Enterprise(CORE)의 진행 중인 연구의 일환으로 재조합 근친 교배 계통에서 유래한 귀리 식물의 DNA 마커 분석에서 이러한 새로운 기능을 강조합니다.
