JMP® Genomics における連鎖地図の最適化による農作物の改良 JMP® Genomics における連鎖地図の最適化による農作物の改良
ケルシー・ミクラウス氏とレベッカ・オリバー氏（SAS Institute Inc.）、エリック・ジャクソン氏（USDA-ARS）
遺伝子マーカーを互いの相対的な位置に配置した適切に構築された連鎖地図は、多くの植物や動物種の量的形質遺伝子座 (QTL) 解析において重要です。DNA マーカーを遺伝的に受け継がれた形質に関連付けると、マーカー支援育種アプローチを使用して、耐病性の向上や収量の増加などの望ましい形質を持つ植物を選択できるようになり、農作物研究の効率が向上します。連鎖地図は、既知の血統の実験集団のサンプルの DNA マーカー遺伝子型を使用して構築されます。マーカーは、組み換え率で測定された連鎖の近さに基づいて連鎖グループに割り当てられます。グループ内のマーカーの最適な順序は、最短の遺伝距離マップを計算するために決定されます。JMP Genomics 5.1 の新機能は、連鎖グループを計算し、SAS/OR の PROC OPTMODEL の最適化ルーチンを使用して、最適に順序付けられたマーカー マップを決定します。私たちは、Collaborative Oat Research Enterprise (CORE) による進行中の研究の一環として、組み換え近交系に由来するオート麦植物の DNA マーカーの分析におけるこれらの新しい特徴に焦点を当てています。
