中国仓鼠卵巢细胞发酵代谢物数据的多元时间序列分析 中国仓鼠卵巢细胞发酵代谢物数据的多元时间序列分析
Florian Lipsmeier 博士，罗氏诊断有限公司制药研究和早期开发信息学部门科学家
中国仓鼠卵巢 (CHO) 细胞是现代生物技术中用于大规模生产治疗性蛋白质（如抗体）的“主力”之一。CHO 细胞群在发酵罐中在明确定义的培养基和明确定义的条件下生长。在 CHO 细胞发酵过程中，会不断记录一小组在线数据，并在整个过程中均匀分布一组离散样本。这些样本主要分析其代谢物含量，代表所谓的离线测量。尽管发酵过程中的条件几乎恒定，但细胞生长、过程稳定性和蛋白质产量可能会有很大的变化。这可能是由于产生的蛋白质不同、发酵前不同的预培养条件、突变或其他潜在的未知因素造成的。我们正在 JMP 中开发一个分析平台，以便通过分析我们的多元时间序列数据来解决围绕这些主题的不同问题。我们在此背景下使用的主要工具主要采用 JMP 提供的多元分析方法，例如主成分分析和聚类，以及建模方法，例如效应筛选、分区或神经网络。这些方法的补充包括，例如，使用 JMP 脚本语言实现当前文献中的不同时间序列相似性测量，以及通过 JMP 和 R 连接使用现有的 R 包。
