データ管理および分析プラットフォームの中心コンポーネントとして JMP(R) を組み込む (2019-US-EPO-203)レベル: 中級
トーマス・ウォーク、ノースダコタ州立大学、大規模植物育種パイプライン DB マネージャー
アナ・ハイルマン・モラレス、ノースダコタ州立大学、大規模植物育種パイプライン DB マネージャー
リチャード・ホースリー、ノースダコタ州立大学学部長、教授
JMP には、スタンドアロン分析だけでなく、既存のデータ管理および分析システムへの統合にも役立つツールが多数用意されています。長年にわたり、複数の場所で何年にもわたって栽培された何千もの実験育種系統を含む多数の実験を管理する作物育種家向けに、専用のデータ管理および分析ツールが開発されてきました。ここでは、植物育種 MS SQL Server データベースを照会し、JMP または育種研究用の専用パッケージである ASReml で構築された混合モデルで生データを分析するために開発された JMP アドインのセットについて報告します。これらのアドインでは、各 DB クエリは新しい SQL クエリを通じて作成され、関連する検索パラメータを選択するためのユーザー インターフェイス ボックスが用意されています。結果は、JMP で直接混合モデル分析を実行するか、ASReml でより専門的な分析にかけることができます。この場合、ASReml は JMP から RunProgram を通じて起動されます。プロセス全体を通じて、テーブルは分割されるか、または分析を迅速化し、DB 更新に備えるために管理されます。ASReml からの出力は、Parse XML を通じて JMP テーブルに読み込まれます。アドイン コンポーネントは、オブジェクト指向設計のモジュール機能のために JSL 関数に分割されています。全体として、利用可能なメソッドの範囲、JSL とアドインでのタスクの標準化機能、およびユーザー インターフェイスの作成の容易さにより、JMP は NDSU の植物育種研究の中心的な要素となっています。このプレゼンテーションで紹介された機能が、他のユーザーが自分の状況で JMP を最も効果的に使用する方法を理解するのに役立つことを願っています。
