Livello: Intermedio
Thomas Walk, responsabile del database del pipeline di breeding di grandi dimensioni, North Dakota State University
Ana Heilman Morales, responsabile del database del pipeline di breeding delle grandi piante, North Dakota State University
Richard Horsley, Capo Dipartimento, Professore, North Dakota State University
JMP fornisce una serie di strumenti utili non solo per analisi stand-alone, ma anche per l'integrazione in sistemi di analisi e gestione dati esistenti. Nel corso degli anni, sono stati sviluppati strumenti specializzati di analisi e gestione dati per i coltivatori che gestiscono numerosi esperimenti che coinvolgono migliaia di linee di allevamento sperimentali coltivate in più sedi per molti anni. Qui, segnaliamo un set di componenti aggiuntivi JMP che sono stati sviluppati per interrogare un database MS SQL Server di allevamento vegetale e quindi analizzare i dati grezzi in modelli misti creati in JMP o ASReml, un pacchetto specializzato per la ricerca sull'allevamento. In questi componenti aggiuntivi, ogni query DB viene eseguita tramite una nuova query SQL, con caselle dell'interfaccia utente fornite per selezionare i parametri di ricerca pertinenti. I risultati possono essere eseguiti tramite analisi di modelli misti direttamente in JMP o sottoposti ad analisi più specializzate in ASReml, che, in questo caso, viene avviata da JMP tramite RunProgram. Durante tutto il processo, le tabelle vengono divise o altrimenti gestite per velocizzare l'analisi e preparare gli aggiornamenti DB. L'output da ASReml viene letto nelle tabelle JMP tramite Parse XML. I componenti aggiuntivi sono separati in funzioni JSL per funzionalità modulari in un design orientato agli oggetti. Nel complesso, grazie alla gamma di metodi disponibili, alla capacità di standardizzare le attività in JSL e nei componenti aggiuntivi e alla facilità di creazione di interfacce utente, JMP è diventato un elemento centrale nella ricerca sulla riproduzione vegetale presso la NDSU. Ci auguriamo che la funzionalità dimostrata in questa presentazione aiuti altri a capire come JMP potrebbe essere utilizzato al meglio nelle loro situazioni.
