Niveau : Intermédiaire
Thomas Walk, responsable de la base de données sur les grands pipelines de sélection végétale, Université d'État du Dakota du Nord
Ana Heilman Morales, responsable de la base de données sur les grands pipelines de sélection végétale, Université d'État du Dakota du Nord
Richard Horsley, chef de département, professeur, Université d'État du Dakota du Nord
JMP propose une multitude d'outils utiles, non seulement pour l'analyse autonome, mais aussi pour l'intégration aux systèmes existants de gestion et d'analyse de données. Au fil des ans, des outils spécialisés de gestion et d'analyse de données ont été développés pour les sélectionneurs de cultures gérant de nombreuses expériences impliquant des milliers de lignées expérimentales cultivées sur plusieurs sites pendant de nombreuses années. Nous présentons ici un ensemble de modules complémentaires JMP développés pour interroger une base de données MS SQL Server de sélection végétale, puis analyser les données brutes dans des modèles mixtes intégrés à JMP ou à ASReml, un progiciel spécialisé pour la recherche en sélection. Dans ces modules complémentaires, chaque requête de base de données est effectuée via une nouvelle requête SQL, avec des boîtes d'interface utilisateur permettant de sélectionner les paramètres de recherche pertinents. Les résultats peuvent être analysés par modèle mixte directement dans JMP ou soumis à une analyse plus spécialisée dans ASReml, qui, dans ce cas, est lancée depuis JMP via RunProgram. Tout au long du processus, les tables sont fractionnées ou gérées afin d'accélérer l'analyse et de préparer les mises à jour de la base de données. Les résultats d'ASReml sont lus dans les tables JMP via Parse XML. Les composants complémentaires sont divisés en fonctions JSL pour une fonctionnalité modulaire dans une conception orientée objet. Globalement, grâce à la diversité des méthodes disponibles, à la possibilité de standardiser les tâches en JSL et dans les compléments, et à la simplicité de création d'interfaces utilisateur, JMP est devenu un élément central de la recherche en sélection végétale à la NDSU. Nous espérons que les fonctionnalités présentées dans cette présentation aideront d'autres utilisateurs à déterminer comment utiliser au mieux JMP dans leur situation.
