Niveau: Mittelstufe
Berufsfunktion: Analyst / Wissenschaftler / Ingenieur
Paul Fogel, Berater, Paul Fogel Berater
Jean-Luc Blachon, Leitender Statistiker, Präklinische Forschung, Ipsen
In klinischen Studien ist die explorative Analyse multivariater Längsschnittdaten entscheidend für die Identifizierung von Patientenuntergruppen mit ähnlichen zeitlichen Verläufen, die einige der untersuchten Merkmale, z. B. Biomarker, aufweisen. Im Kontext der Tumorentwicklungskinetik präsentieren wir ein neues JMP-Add-in, die nicht-negative Tensorfaktorisierung (NTF), das die Identifizierung solcher Patientenuntergruppen und die gleichzeitige Auswahl von Parametern mit einem prototypischen zeitlichen Verlauf ermöglicht. Wir zeigen, dass ausgewählte Merkmale anschließend zur Modellierung der Tumorentwicklung verwendet werden können. Dank unseres unüberwachten Ansatzes sind die resultierenden Schätzungen des Gesamtüberlebens zudem robust gegenüber Überanpassung. Das Add-in bietet dynamische Heatmap-Visualisierungen, die für Biologen und Kliniker aussagekräftig sind. Dank der JMP 14 Python-Interoperabilität wird ein schnelles NTF-Paket in Python 3.6 im Hintergrund ausgeführt. Abschließend werden die NTF-Ergebnisse mit denen der JMP 14-Funktionsanalyseplattform und eines R-Pakets zur Pfadmodellierung verglichen.
