Miclaus Kelci
F&E-Manager für erweiterte Analytik
JMP Biowissenschaften
Abstrakt:
Von den 7,3 Milliarden Menschen auf dieser Erde leiden drei Milliarden an Unterernährung. Die Ernährung unserer wachsenden Bevölkerung ist eines der größten Probleme unserer Generation. Wie können wir unsere Nutzpflanzen verbessern, um höhere Erträge und eine bessere Krankheitsresistenz zu erzielen, sie in raueren Umgebungen wachsen zu lassen und gleichzeitig den Vitamingehalt zu erhöhen? Neue Prognosetools in JMP und JMP Genomics helfen Züchtern, die genomische Variabilität von Pflanzen zu nutzen, um Lösungen für diese komplexen Probleme mit mehreren Merkmalen zu finden. In dieser Präsentation zeigen wir, wie JMP Genomics, eine Lösung, die JMP mit SAS und umfangreichen benutzerdefinierten JSL-Anwendungen kombiniert, Vorhersagemodelle mit genomischen Markern erstellt, um die Eigenschaften zu optimieren. Scoring-Codes aus Modellen werden verwendet, um potenzielle Pflanzenkreuzungen zu erstellen und die prognostizierten Ergebnisse mehrerer Merkmale gleichzeitig zu bewerten. Interaktive JMP-Grafiken mit dominanter Zeilenauswahl zur Auswahl von Pareto-Grenzen ermöglichen Züchtern die Auswahl potenzieller Pflanzenkreuzungen für das Feld, die mehrere Merkmale basierend auf der genetischen Vererbung optimieren. Mithilfe analytischer Vorhersagetools und interaktiver Exploration können wir mehrjährige Züchtungsprogramme in wenigen Stunden in silico durchführen. Für die Demonstrationen werden Daten zur Maiszucht der brasilianischen Agrarforschungsgesellschaft (Embrapa) verwendet.
