DoE con fattori nidificatiCiao a tutti,
Un mio cliente mi chiede informazioni sui fattori di nidificazione in DOE. Sì, ce ne sono già molti in circolazione, ma non riesco a trovare una risposta alla sua domanda.
Lui ha
- 3 tipi/linee cellulari (A, B, C)
- 3 Donatori per Cellula di tipo A
- 2 Donatori per Cellula di tipo B
- 2 Donatori per Cellula di tipo C
- alcuni fattori di trattamento.
Quindi, c'è una certa necessità naturale di annidare i donatori nel rispettivo tipo di cellula. Ma è qui che faccio fatica a capire come dovrebbe essere idealmente l'approccio.
Potrei semplicemente creare un design con un fattore categoriale "tipo di cella" con 7 livelli A1, A2, A3, B1, B2, C1, C2 e farlo apparire così:
Ma forse qualcuno qui ha un modo più appropriato per impostare un progetto del genere?
Come sempre, apprezzo il tuo aiuto e il tuo contributo:)
Migliore
Floriano
Re: DoE con fattori nidificatiPotresti includere donatore e tipo di cellula come fattori separati e rendere il tipo di cellula un fattore difficile da modificare. Ciò lo renderà un design split plot in cui i donatori sono assegnati casualmente all'interno del tipo di cellula. Quando analizzi, assicurati di includere donatore come effetto casuale.
Oppure i donatori sono inseriti in un tipo di cellula perché il donatore specifico ha quello specifico tipo di cellula e quindi non può essere assegnato casualmente al tipo di cellula?
Re: DoE con fattori nidificatiCiao @andreacoombs ,
grazie! Sì, il secondo caso. Stanno studiando 3 diversi tipi di cellule e hanno un numero diverso di donatori che trasportano ciascuno di questi tipi di cellule.
Re: DoE con fattori nidificatiChe ne dici di considerare il tipo di cellula come una covariata?
Dovrai creare una tabella con una riga per ogni tipo di donazione di cellule. I dati non devono essere bilanciati, ovvero non devi avere multipli di 3xA, 2xB e 2xC, anche se puoi. Forse uno dei donatori ha contribuito con altro materiale per il DOE. Nella tabella che ho allegato, non è bilanciato. La tabella non deve essere randomizzata, lo farà il Custom Designer. Aggiungi una colonna corrispondente al Donatore.
Vai al Custom Designer. Aggiungi le tue 2 risposte continue. Seleziona la tabella Covariate in modo che sia la tabella corrente. Aggiungi un fattore di tipo Covariate e scegli la colonna covariate. Crea il tuo modello e seleziona il numero di esecuzioni. A meno che tu non selezioni Allow covariate rows to be repeat, il Custom Designer utilizzerà solo fino a quanto è presente nella tabella. Quando crei la tabella, viene aggiunto il numero di riga corrispondente alla tabella covariate. In questo modo, sai quale Donor utilizzare per il tipo di cella.
Re: DoE con fattori nidificatiGrazie Don! Proporrò questa soluzione anche al cliente.
