Pregunta sobre la tasa de incidencia de la distribución binomial negativaHola:)
¿Me pregunto si alguien puede ayudarme con mi pregunta?
Tengo un conjunto de datos sobre un endoparásito en estómagos de peces en un lago con cuatro fenotipos de peces diferentes (Ab, Dw, Pi, Pl). Los datos se ajustan bien a una distribución binomial negativa (ver gráfico).
Utilizo una regresión generalizada con distribución binomial negativa para analizar (Y) el número de parásitos en los cuatro fenotipos de peces (x1) con la longitud corporal (x2) como covariable.
En los resultados (ver la salida a continuación) tanto x1 como x2 son significativos y quiero extraer "medias de mínimos cuadrados" en los cuatro fenotipos de peces después de realizar una comparación de Tukey múltiple (que contrasta x1 y corrige x2). Lo que obtengo son las estimaciones de la tasa de incidencia (con st.err). ¿Cómo puedo "calcular a la inversa" para obtener números reales (es decir, medias) de parásitos en los cuatro fenotipos de peces?
Número (Y) de endoparásitos (X) en estómagos de peces.
Resultado del análisis
Estimaciones de parámetros:
Prueba múltiple de Tukey:
Análisis y modelado de datos básicosRe: Pregunta sobre la tasa de incidencia de la distribución binomial negativaHola @Kjartan ,
Parece que estás preguntando sobre algunas cosas diferentes.
En primer lugar, ¿está seguro de que una distribución binomial negativa es la correcta para utilizar en sus datos? Seguro, podría ser adecuada, pero ¿tiene sentido utilizarla? Según la ayuda en línea de JMP, la distribución binomial negativa es buena para modelar una cantidad de éxitos antes de una cantidad específica de fracasos. Los datos que está viendo realmente no parecen seguir este modelo. Según su descripción, casi parece que una distribución de Poisson (o ZI Poisson) sería más apropiada, ya que se trata de los recuentos de endoparásitos dentro de un determinado fenotipo de pez, o incluso solo en general.
En cuanto al modelo, parece que tienes dos factores, X1 (fenotipo del pez) y X2 (longitud corporal). ¿Sabes si hay algún término cruzado presente, X1*X2, es decir, el fenotipo y la longitud corporal tienen una interacción? Si no es así, déjalos separados y como factores individuales.
Respecto a las medias por fenotipo, puedes simplemente hacer un ANOVA (o MANOVA) de la respuesta vs. fenotipo y observar las medias para cada fenotipo.
Espero que esto ayude.
DS
Re: Pregunta sobre la tasa de incidencia de la distribución binomial negativaHola DS:grinning_face:
Muchas gracias por tu respuesta.
Probé qué distribución sería la más adecuada para y usando AIC para diferentes modelos donde la distribución binomial negativa era mejor que la distribución de Poisson. Entonces, sí, tiene sentido usar esa distribución en los recuentos de parásitos. Sin embargo, todavía no entiendo cómo transformar de nuevo las tasas de incidencia a valores ordinarios, por ejemplo, después de obtener el cuadrado de Keast de los testículos de Tukey post hoc.
