Domanda sul tasso di incidenza della distribuzione binomiale negativaCIAO:)
Vorrei sapere se qualcuno può aiutarmi con la mia domanda.
Ho un set di dati su un endoparassita negli stomaci dei pesci in un lago con quattro diversi fenotipi di pesci (Ab, Dw, Pi, Pl). I dati si adattano bene a una distribuzione binomiale negativa (vedi grafico).
Utilizzo una regressione generalizzata con distribuzione binomiale negativa per analizzare il numero (Y) di parassiti nei quattro fenotipi di pesce (x1) con la lunghezza del corpo (x2) come covariata.
Nei risultati (vedi output sotto) sia x1 che x2 sono significativi e voglio estrarre le "medie dei minimi quadrati" nei quattro fenotipi dei pesci dopo aver eseguito un confronto multiplo di Tukey (che mette a confronto x1 e corregge x2). Ciò che ottengo sono le stime del tasso di incidenza (con st.err). Come posso "eseguire un calcolo a ritroso" per ottenere numeri reali (ovvero medie) di parassiti nei quattro fenotipi dei pesci?
Numero (Y) di endoparassiti (X) nello stomaco dei pesci.
Output dall'analisi
Stime dei parametri:
Test multiplo di Tukey:
Analisi e modellazione dei dati di baseRe: Domanda sul tasso di incidenza della distribuzione binomiale negativaCiao @Kjartan ,
Sembra che tu stia chiedendo cose diverse.
Prima di tutto, sei sicuro che una distribuzione binomiale negativa sia quella giusta da usare per i tuoi dati? Certo, potrebbe andare bene, ma ha senso usarla? Secondo la guida online di JMP, la distribuzione binomiale negativa è buona per modellare un numero di successi prima di un numero specificato di fallimenti. I dati che stai guardando non sembrano seguire questo modello. In base alla tua descrizione, sembra quasi che una distribuzione di Poisson (o ZI Poisson) sarebbe più appropriata, in quanto si tratta dei conteggi dell'endoparassita all'interno di un certo fenotipo di pesce, o anche solo in generale.
Per quanto riguarda il modello, sembra che tu abbia due fattori, X1 (fenotipo del pesce) e X2 (lunghezza del corpo) -- sai se è presente un termine incrociato -- X1*X2, ovvero il fenotipo e la lunghezza del corpo hanno un'interazione. In caso contrario, lasciali separati e fattori individuali.
Per quanto riguarda le medie per fenotipo, potresti semplicemente eseguire un'ANOVA (o MANOVA) della risposta rispetto al fenotipo e osservare le medie per ciascun fenotipo.
Spero che questo aiuti,
S.S.
Re: Domanda sul tasso di incidenza della distribuzione binomiale negativaCiao DS:grinning_face:
Grazie mille per la risposta.
Ho testato quale distribuzione sarebbe la più adatta per y usando AIC per diversi modelli in cui la binomiale negativa era migliore della distribuzione di Poisson. Quindi sì, ha senso usare quella distribuzione sui conteggi dei parassiti. Tuttavia, non capisco ancora come trasformare all'indietro i tassi di incidenza in valori ordinari, ad esempio dopo aver ottenuto i numeri quadrati di Keast dai testicoli di Tukey post hoc.
