Question sur le taux d'incidence de la distribution binomiale négativeSalut:)
Je me demande si quelqu'un peut m'aider avec ma question ?
J'ai un ensemble de données sur un endoparasite dans les estomacs de poissons d'un lac avec quatre phénotypes de poissons différents (Ab, Dw, Pi, Pl). Les données correspondent bien à une distribution binomiale négative (voir graphique).
J'utilise une régression généralisée avec une distribution binomiale négative pour analyser le nombre (Y) de parasites dans les quatre phénotypes de poissons (x1) avec la longueur du corps (x2) comme covariable.
Dans les résultats (voir la sortie ci-dessous), x1 et x2 sont tous deux significatifs et je souhaite extraire les « moyennes des moindres carrés » dans les quatre phénotypes de poissons après avoir effectué une comparaison multiple de Tukey (qui contraste x1 et corrige pour x2). Ce que j'obtiens, ce sont les estimations du taux d'incidence (avec st.err). Comment puis-je « effectuer un calcul inverse » pour obtenir des nombres réels (c'est-à-dire des moyennes) de parasites dans les quatre phénotypes de poissons ?
Nombre (Y) d'endoparasites (X) dans les estomacs des poissons.
Résultat de l'analyse
Estimations des paramètres :
Test multiple de Tukey :
Analyse et modélisation de données de baseRé: Question sur le taux d'incidence de la distribution binomiale négativeSalut @Kjartan ,
Il semble que vous posiez plusieurs questions différentes.
Tout d'abord, êtes-vous sûr qu'une distribution binomiale négative est la bonne distribution à utiliser pour vos données ? Bien sûr, elle pourrait convenir, mais est-il judicieux de l'utiliser ? Selon l'aide en ligne de JMP, la distribution binomiale négative est bonne pour modéliser un certain nombre de succès avant un nombre spécifié d'échecs. Les données que vous examinez ne semblent pas vraiment suivre ce modèle. D'après votre description, il semble presque qu'une distribution de Poisson (ou ZI Poisson) serait plus appropriée car elle correspond au nombre d'endoparasites dans un certain phénotype de poisson, voire même simplement dans son ensemble.
En ce qui concerne le modèle, il semble que vous ayez deux facteurs, X1 (phénotype du poisson) et X2 (longueur du corps) – savez-vous s’il existe un terme croisé présent – X1*X2, c’est-à-dire que le phénotype et la longueur du corps ont une interaction. Si ce n’est pas le cas, laissez-les comme des facteurs distincts et individuels.
Concernant les moyennes par phénotype, vous pouvez simplement faire une ANOVA (ou MANOVA) de la réponse par rapport au phénotype et examiner les moyennes pour chaque phénotype.
J'espère que cela aide,
DS
Ré: Question sur le taux d'incidence de la distribution binomiale négativeSalut DS:grinning_face:
Merci beaucoup pour votre réponse.
J'ai testé quelle distribution serait la plus adaptée à y en utilisant l'AIC pour différents modèles où le binôme négatif était meilleur que la distribution de Poisson. Donc oui, il est logique d'utiliser cette distribution pour compter les parasites. Cependant, je ne comprends toujours pas comment retransformer les taux d'incidence en valeurs ordinaires, par exemple après avoir obtenu des mens carrés de Keast à partir de testicules de Tukey post hoc.
