El complemento de análisis de mapas de ligamiento de cruces externos para JMP ® Genomics admite el mapeo de ligamiento y los análisis de QTL para líneas cruzadas externas. Estos análisis se realizan utilizando el paquete Onemap R. Este complemento incluye un motor de importación/exportación de OneMap, así como procedimientos de grupos de ligamiento y recombinación, orden de mapas de ligamiento y creación de conjuntos de datos de probabilidad de genotipo de QTL para datos de cruces externos. Los resultados de estos procesos se pueden utilizar para los métodos de mapeo de intervalos de QTL, CIM y MIM.
Puede descargar el complemento Outcross Linkage Mapping desde JMP File Exchange (requiere un perfil SAS gratuito).
Además del complemento, debe instalar el software R (versión 3.6.3 o 4.0.0) y el paquete OneMap (versión 2.1.3). Consulte las instrucciones de instalación .
En algunos casos (por ejemplo, cuando se instalan varias versiones de R), puede aparecer uno de estos errores:
ERROR: SAS no pudo inicializar la interfaz del lenguaje R
ERROR: No se pudo encontrar una versión instalada de R
En este caso, debe configurar la variable de entorno R_HOME dentro del sistema operativo Windows para que apunte a la ubicación en la que está instalado R.
Nota: Los complementos JMP en JMP File Exchange no cuentan con soporte oficial del soporte técnico de JMP.
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