JMP ® Genomics 的异交连锁图分析插件支持异交系的连锁作图和 QTL 分析。这些分析使用 Onemap R 包进行。此插件包括 OneMap 导入/导出引擎,以及针对异交数据的连锁组和重组、连锁图顺序和构建 QTL 基因型概率数据集程序。这些过程的结果随后可用于 QTL 区间作图、CIM 和 MIM 方法。
您可以从JMP 文件交换中心下载 Outcross Linkage Mapping 插件(需要免费的 SAS 配置文件)。
除了插件之外,您还必须安装 R 软件(版本 3.6.3 或 4.0.0)和 OneMap 包(版本 2.1.3)。请参阅安装说明。
在某些情况下(例如,安装了多个版本的 R 时),您可能会遇到以下错误之一:
错误:SAS 无法初始化 R 语言接口
错误:无法找到已安装的 R 版本
在这种情况下,您应该在 Windows 操作系统中设置 R_HOME 环境变量以指向安装 R 的位置。
注意: JMP 文件交换中的 JMP 插件未得到 JMP 技术支持的官方支持。
[先前的 JMP 说明 52744]