JMP ® Genomics の Outcross Linkage Map Analysiss アドインは、交配された系統の連鎖地図作成と QTL 分析をサポートします。これらの分析は、Onemap R パッケージを使用して実行されます。このアドインには、OneMap インポート/エクスポート エンジンのほか、Outcross データ用の連鎖グループと組み換え、連鎖地図順序、QTL 遺伝子型確率データセット作成手順が含まれています。これらの処理の結果は、QTL 間隔マッピング、CIM、および MIM 法に使用できます。
Outcross Linkage Mapping Add-in は、 JMP File Exchangeからダウンロードできます (無料の SAS プロファイルが必要です)。
アドインに加えて、R ソフトウェア (バージョン 3.6.3 または 4.0.0) と OneMap パッケージ (バージョン 2.1.3) をインストールする必要があります。 インストール手順を参照してください。
場合によっては (たとえば、複数のバージョンの R がインストールされている場合)、次のいずれかのエラーが発生することがあります。
エラー: SAS は R 言語インターフェイスを初期化できませんでした
エラー: インストールされた R のバージョンが見つかりませんでした
この場合、Windows オペレーティング システム内の R_HOME 環境変数を、R がインストールされている場所を指すように設定する必要があります。
注意: JMP ファイル交換上の JMP アドインは、JMP テクニカル サポートによって正式にサポートされていません。
[以前の JMP ノート 52744]
