Il componente aggiuntivo Outcross Linkage Map Analyses per JMP ® Genomics supporta Linkage Mapping e analisi QTL per linee incrociate. Queste analisi vengono condotte utilizzando il pacchetto Onemap R. Questo componente aggiuntivo include un motore di importazione/esportazione OneMap, nonché procedure Linkage Groups and Recombination, Linkage Map Order e Build QTL Genotype Probability Data Set per i dati Outcross. I risultati di questi processi possono quindi essere utilizzati per i metodi QTL Interval Mapping, CIM e MIM.
È possibile scaricare il componente aggiuntivo Outcross Linkage Mapping da JMP File Exchange (richiede un profilo SAS gratuito).
Oltre al componente aggiuntivo, è necessario installare il software R (versione 3.6.3 o 4.0.0) e il pacchetto OneMap (versione 2.1.3). Fare riferimento alle istruzioni di installazione .
In alcuni casi (ad esempio, quando sono installate più versioni di R), potresti riscontrare uno di questi errori:
ERRORE: SAS non è riuscito a inizializzare l'interfaccia del linguaggio R
ERRORE: Impossibile trovare una versione installata di R
In questo caso, dovresti impostare la variabile d'ambiente R_HOME all'interno del sistema operativo Windows in modo che punti alla posizione in cui è installato R.
Nota: i componenti aggiuntivi JMP su JMP File Exchange non sono ufficialmente supportati dal supporto tecnico JMP.
[In precedenza JMP Nota 52744]
