Das Add-In „Outcross Linkage Map Analyses“ für JMP ® Genomics unterstützt Linkage Mapping und QTL-Analysen für gekreuzte Linien. Diese Analysen werden mit dem Onemap R-Paket durchgeführt. Dieses Add-In enthält eine OneMap-Import-/Export-Engine sowie Verfahren für Linkage Groups und Recombination, Linkage Map Order und Build QTL Genotype Probability Data Set für Outcross-Daten. Die Ergebnisse dieser Prozesse können dann für QTL Interval Mapping, CIM- und MIM-Methoden verwendet werden.
Sie können das Outcross Linkage Mapping-Add-In vom JMP File Exchange herunterladen (erfordert ein kostenloses SAS-Profil).
Zusätzlich zum Add-In müssen Sie die R-Software (Version 3.6.3 oder 4.0.0) und das OneMap-Paket (Version 2.1.3) installieren. Bitte beachten Sie die Installationsanweisungen .
In einigen Fällen (z. B. wenn mehrere Versionen von R installiert sind) kann einer der folgenden Fehler auftreten:
FEHLER: SAS konnte die R-Sprachschnittstelle nicht initialisieren
FEHLER: Eine installierte Version von R konnte nicht gefunden werden
In diesem Fall sollten Sie die Umgebungsvariable R_HOME im Windows-Betriebssystem so einstellen, dass sie auf den Speicherort verweist, an dem R installiert ist.
Hinweis: JMP-Add-Ins im JMP File Exchange werden vom technischen Support von JMP nicht offiziell unterstützt.
[Vorheriger JMP-Hinweis 52744]
