816103_it-IT

liliconcom

Configurazione DOE complessa: necessaria guida

CIAO

questo è probabilmente qualcosa di cui parlare, potresti dire, tuttavia poiché è anche di mio interesse personale, faccio comunque questa domanda. Credo che questo potrebbe non essere così insolito in situazioni di upstreaming, quindi potrebbe essere utile saperlo per il futuro.

Situazione generale

Ho una situazione speciale per un'impostazione DOE in cui non sono sicuro di come impostare facilmente il design. Ecco la sfida:

• Ho 6 AMBR disponibili, ognuno con 20 reattori (su 24), quindi è possibile eseguire 20 prove sperimentali contemporaneamente per un AMBR
• Ho 3 DS (Dilution Themes, livello L0, L1, L2), ma il livello L0 deve essere eseguito solo in AMBR 1 e 2

Potrei impostare facilmente questo vincolo con un design di covariate. Un altro approccio sarebbe un fattore di blocco, ma poi abbiamo avuto problemi con il vincolo del livello DS L0 solo su AMBR 1 e 2. Oltre agli altri vincoli seguenti:

Vincoli per la conduzione della progettazione

1.

• Un fattore continuo, diciamo che FX avrà un livello inferiore, superiore e centrale (poiché anche gli effetti quadratici sono di interesse)
• In un AMBR possono essere eseguiti solo due livelli FX diversi
  • quindi entro le 20 corse in un AMBR, sono consentite solo le combinazioni di livello 0/-1, 0/1, -1/1
  • ad esempio 10 run FX livello 0 e 10 run FX livello -1 --> sono consentiti tutti e tre i livelli che compaiono in quelle 20 run

2.

• Un fattore continuo, chiamiamolo Durata dell'Espressione Cellulare (CED) avrà 3 livelli (-1, 0, 1) (poiché anche gli effetti quadratici sono interessanti)
  • I livelli CED possono essere combinati con i livelli DS solo in un massimo di 6 combinazioni entro le 20 esecuzioni in un AMBR
  • ad esempio 20 corse in un AMBR ma solo combinazioni L0/-1, L0/1, L2/1, L3/-1, L3/0, L3/1, e nel successivo AMBR altre fino a 6 combinazioni, e così via

Informazioni aggiuntive

3. oltre a questi fattori ho altri 12 fattori continui con 2 livelli

• Nota:
  • hanno fatto 120 prove (6 AMBR moltiplicati per 20 reattori)
  • hanno termini modello con interazione ed effetti quadratici
  • MA hanno rimosso diversi effetti che non ritengono interessanti (vedi Design-01, se vuoi vedere a quali effetti sono interessati
  • Ai fini della creazione di questo progetto gli effetti sono secondari, è necessario che la struttura sia realizzata.

In allegato è

• una tabella di covariate per le combinazioni AMBR/DS consentite.
• una tabella degli effetti del modello per gli effetti di interesse nel progetto di blocco generato (non riflette i vincoli)
• un progetto di blocco iniziale (il fattore di blocco imita AMBR) Design-01.jmp che non soddisfa i vincoli sul numero di combinazioni CED-DS né i vincoli DS-AMBR per L0
• una tabella dei fattori per la progettazione iniziale

@Ryan_Lekivetz e il team

Re: Configurazione DOE complessa: necessaria guida

Per completezza:

Ho provato un approccio per costruire la struttura del DOE Setup e dopo che il design è stato generato ho usato un design per tutti gli altri parametri e li ho usati come covariate (tuttavia, per soddisfare i requisiti, questo è stato un approccio manuale per renderlo in qualche modo casuale ma mantenendo i requisiti. Niente da consigliare con così tanti parametri;)

Il cliente ha ridotto i requisiti (dopo aver discusso la situazione) per riuscire a trovare un progetto.

Esaminando le restrizioni di progettazione, la più difficile è stata quella di avere determinati temi di diluizione solo nelle prime due ambre. Perché questo avrà anche un impatto enorme sulle informazioni che otterrai a causa di poche variazioni e nessuna informazione dalle altre ambre su questi temi.

Re: Configurazione DOE complessa: necessaria guida

Ok, che ne dite di fare un DSD per i 14 fattori per ogni livello del tema della diluizione?
Eseguire tutte le prove per ogni DS sull'AMBR appropriato.

Le corse dovranno essere divise in due blocchi.

Re: Configurazione DOE complessa: necessaria guida

Grazie Byron per il suggerimento. Tornando ai requisiti di progettazione originali, questo funzionerebbe se non ci fossero stati i vincoli per le restrizioni di combinazione del tema CED/diluizione per avere in ogni AMBR solo un massimo di 6 combinazioni (su 9). Si potrebbe sostenere che solo 2 combinazioni per AMBR soddisferebbero questo requisito e, infine, una morte deve morire;)

Alla fine, anche con l'enorme potenza di cui dispongono oggi i generatori di progettazione, limitare un progetto con troppi requisiti ha i suoi limiti, quindi potrebbe essere necessario accettare di rilasciarne alcuni e seguire un percorso più iterativo con meno requisiti.