Come creare curve di sopravvivenza (regressione non lineare) utilizzando il modello lineare-quadratico?Sono completamente nuovo su JMP e voglio usare il modello lineare-quadratico della morte cellulare per radiazioni per adattare i miei dati di sopravvivenza (frazione di sopravvivenza) alla dose applicata.
La funzione è la seguente: Y = exp(-1*(A*X + B*X^2))
Y = frazione di sopravvivenza
X = dose (di radiazioni)
A = la componente lineare rappresenta la morte cellulare dovuta a un singolo colpo letale al DNA
B = la componente quadratica rappresenta la morte cellulare che avviene solo con due colpi.
Qualcuno ha qualche spunto o qualche consiglio? Grazie
Modellazione statistica avanzataEsplorazione e visualizzazione dei datisistema operativo macOSRe: Come creare curve di sopravvivenza (regressione non lineare) utilizzando il modello lineare-quadratico?Salve, no, non ho una curva diversa per i 12 campioni. Ho 12 campioni e quindi 12 frazioni di sopravvivenza per punto di dose (asse x) e queste sono tracciate e visualizzate come media del modello quadratico lineare. Nell'allegato ho aggiunto la curva di sopravvivenza che ho ottenuto da prisma e le barre di errore che indicano la deviazione standard delle 12 frazioni di sopravvivenza.
Re: Come creare curve di sopravvivenza (regressione non lineare) utilizzando il modello lineare-quadratico?Ciao @JGru . Per essere sicuro di aver capito bene, hai una curva diversa per ognuno dei 12 campioni? È corretto?
Re: Come creare curve di sopravvivenza (regressione non lineare) utilizzando il modello lineare-quadratico?Grazie mille. Mi è di grande aiuto.
Ho un'ulteriore domanda. In totale ho n=12 campioni per punto di dose, quindi ciò significa che per dose ho 12 frazioni di sopravvivenza. Come posso includerlo nella formula / nell'analisi?
Grazie
Re: Come creare curve di sopravvivenza (regressione non lineare) utilizzando il modello lineare-quadratico?Ciao @JGru e benvenuto. Il modo più semplice sarebbe linearizzare:
Y = exp(-1*(A*X + B*X^2)) è lo stesso di:
- ln(Y) = -1*(A*X+B*X^2)
- ln(1/Y) = A*X+B*X^2
Quindi, se questo è il tuo modello, puoi usare Adatta modello e assicurarti che sia selezionata l'opzione "Nessuna intercettazione".
Basta creare una nuova colonna chiamata Y2 (o qualsiasi altro nome che ti piace) e mettere la funzione Ln(1/Y) in quella colonna. In Fit Model, metti Y2 come "Y", e X e X*X come "Model Effects".
Inoltre, deselezionare "Centrali polinomi" utilizzando la barra di scorrimento rossa accanto a Specifica del modello.
Re: Come creare curve di sopravvivenza (regressione non lineare) utilizzando il modello lineare-quadratico?Ciao @JGru : OK, da quanto ho capito hai diverse frazioni osservate a ogni punto di dose. Ci sono alcuni modi per ottenere ciò che vuoi. Se sei interessato principalmente alla stima dei parametri (stima di A e 
, puoi fare proprio come ho suggerito nel mio post precedente. Quindi, una volta che conosci A e B, puoi tracciare separatamente ciò che vuoi. Tuttavia, se vuoi stime e tracciati ecc. simili a quelli che hai prodotto prima, tutto in un'analisi, allora l'opzione più diretta e flessibile potrebbe essere la piattaforma di regressione non lineare. Torna se hai domande.
Regressione non lineare
