Comment créer une courbe de survie (régression non linéaire) en utilisant le modèle linéaire-quadratique ?Je suis complètement nouveau sur JMP et je souhaite utiliser le modèle linéaire-quadratique de la mort cellulaire par rayonnement pour adapter mes données de survie (fraction de survie) à la dose appliquée.
La fonction est la suivante : Y = exp(-1*(A*X + B*X^2))
Y = fraction de survie
X = dose (de rayonnement)
A = la composante linéaire représente la mort cellulaire due à un seul coup mortel sur l'ADN
B = la composante quadratique représente la mort cellulaire qui ne se produit qu'avec deux coups.
Quelqu'un a-t-il des idées ou des conseils ? Merci
Modélisation statistique avancéeExploration et visualisation des donnéesmacOSRe : Comment créer une courbe de survie (régression non linéaire) en utilisant le modèle linéaire-quadratique ?Bonjour, non, je n'ai pas de courbe différente pour les 12 échantillons. J'ai 12 échantillons et donc 12 fractions de survie par point de dose (axe des x) et celles-ci sont tracées et affichées comme la moyenne du modèle quadratique linéaire. Dans la pièce jointe, j'ai ajouté la courbe de survie que j'ai obtenue à partir de Prism et les barres d'erreur indiquant l'écart-type des 12 fractions de survie.
Re : Comment créer une courbe de survie (régression non linéaire) en utilisant le modèle linéaire-quadratique ?Bonjour @JGru . Pour être sûr de bien comprendre, vous avez une courbe différente pour chacun des 12 échantillons ? Est-ce correct ?
Re : Comment créer une courbe de survie (régression non linéaire) en utilisant le modèle linéaire-quadratique ?Merci beaucoup. Cela aide beaucoup.
J'ai une question supplémentaire. Au total, j'ai n=12 échantillons par point de dose, ce qui signifie que par dose, j'ai 12 fractions de survie. Comment puis-je inclure cela dans la formule / dans l'analyse ?
Merci
Re : Comment créer une courbe de survie (régression non linéaire) en utilisant le modèle linéaire-quadratique ?Bonjour @JGru et bienvenue. Le moyen le plus simple serait de linéariser :
Y = exp(-1*(A*X + B*X^2)) est identique à :
- ln(Y) = -1*(A*X+B*X^2)
- ln(1/Y) = A*X+B*X^2
Donc, si c'est votre modèle, vous pouvez utiliser Ajuster le modèle et vous assurer que l'option « Aucune interception » est sélectionnée.
Créez simplement une nouvelle colonne appelée Y2 (ou tout autre nom de votre choix) et placez la fonction Ln(1/Y) dans cette colonne. Dans Fit Model, placez Y2 comme « Y » et X et X*X comme « Effets du modèle ».
De plus, vous souhaiterez désélectionner « Polynômes centraux » à l'aide du bouton rouge à côté de Spécification du modèle.
Re : Comment créer une courbe de survie (régression non linéaire) en utilisant le modèle linéaire-quadratique ?Bonjour @JGru : OK, si je comprends bien, vous avez plusieurs fractions observées à chaque point de dose. Il existe plusieurs façons d'obtenir ce que vous voulez. Si vous êtes principalement intéressé par l'estimation des paramètres (estimer A et 
, vous pouvez faire comme je l'ai suggéré dans mon article précédent. Ensuite, une fois que vous connaissez A et B, vous pouvez tracer séparément ce que vous voulez. Cependant, si vous voulez des estimations et des tracés, etc. similaires à ceux que vous avez produits auparavant, le tout dans une seule analyse, l'option la plus directe et la plus flexible pourrait être la plateforme de régression non linéaire. Revenez si vous avez des questions.
Régression non linéaire
