투여 전치 등의 공변량을 고려하여 투여 후 값에 대해 약제군 등의 군간 비교를 하는 경우에 공분산 분석이 널리 이용되고 있다. 전통적으로 공분산 분석을 적용 할 때 고려되는 공변량과 약물 그룹에 교호 작용이 없다고 가정합니다. 관측하는 반응에 하한이 있는 경우에, 공변량과 약제군에 교호작용이 나기 쉬운 것으로 알려져 있다. 정밀도가 높은 실험의 경우에는 약제간에 약간의 기울기의 차이가 있어도 통계적으로는 교호작용이 유의한 차이가 되기 쉽고, 정밀도가 낮은 실험의 경우에는 다소의 기울기의 차이가 하지만 통계적으로 유의한 차이가 되기 어렵다. JMP의 「모델의 적합」에서, 공변량과 약제군의 교호작용을 모델에 포함시키면 공변량에 대해서만 중심화가 자동적으로 행해져, 약제군에 대한 최소 제곱 평균을 출력할 수도 있다 . 그런데, 교호작용이 있는 경우의 최소 제곱 평균을 어떻게 해석하면 좋을까. 교락 변수가있는 경우에도 공분산 분석을 적용 할 수 있지만 분명한 교호 작용이 나기 쉽다. JMP의 교호작용에 중심화된 경우의 최소 제곱 평균의 활용 방법에 대한 새로운 지견을 얻을 수 있었기 때문에 보고한다.
