增强数据集成:在 JMP 中连接非数值数据和实验跟踪是什么激发了我提出这个愿望清单请求:在我的领域,电子笔记本 (ELN) 似乎无处不在。虽然它们带来了关键的好处,但我使用过的少数几个似乎并不适合实验设计的项目。首先是“你做了什么”,其次是数据。使用 DoE,要正确使用实验室笔记本,根据您拥有的软件,您可能必须为每个实验创建一个全新的条目,这是一个完全笨拙的前提,阻碍了人们正确使用 ELN。
另一方面,尤其是在项目中,JMP 会邀请您包含所有数据,因为它非常简单。然而,不足之处之一是,虽然我想在 JMP 中存储尽可能多的信息,但我无法存储非数值数据,至少不容易。目前,我有数百张实验中不同步骤的照片。我可以把它们放在数据表中,但这很快就会变得繁琐。除了必须处理比已有的 200 多个列更多的列的烦恼之外,在某些实验中,我为给定步骤拍摄一张照片,而在其他实验中,我拍摄了 5 张照片。鉴于我拍照没有组织原则,有些图片列很稀疏,而其他图片列很密集:这是对 JMP 强大列功能的未充分利用。
此外,也许更重要的是,知识的正确传递存在普遍问题,尤其是在学生流动率高的学术界。许多经验教训并非来自数据,而是来自实验时所记录的内容。但是,对于实验室笔记本,仅仅浏览几年前某个你从未见过的随机人员在你不认识的项目中提供的实验室笔记本,既令人生畏,有时又适得其反。根据我的经验,这种情况几乎从未发生过。ELN 可以使这个过程变得更容易,因为它们具有搜索功能、输入的统一性等。但是,前面提到的 ELN 的问题仍然存在,特别是它们通常针对“你做了什么”而不是数据和分析进行优化。JMP 几乎没有办法做到这一点,只能将实验室笔记本的图片上传到项目文件中,而这很可能会被看作是实验室笔记本中的物理页面。
您希望看到哪些改进:我认为有几件事对研究人员非常有用:
- 将照片与行和列关联:允许将一组图片与特定的列或列集关联,每张图片被分配到一行(或一组行,如果相同的设置用于多个实验,例如在裂区实验中)。符号甚至图像标记(例如,绘制指向仪器重要部分的箭头,或者,如果图像与多列关联,则将图像的各个部分分配给不同的列)在这里也有意义。
- 快速访问实验照片:这相当不言自明,但我不确定这是最好的方法。也许有一种视图模式,可以绘制与特定图像相关的区域的小轮廓?但如果有大量重叠区域,这将不起作用。然后可能有一个持久的悬停窗口,其中包含您感兴趣的照片,您可以从中拖出,调整大小和滚动浏览,您可以通过单击单元格、列或行来访问,如果使用 JMP 项目,可以选择弹出窗口或新文件。
- 保存带有元数据的笔记本页面图像:以可以在浏览数据时访问相关部分的方式存储笔记本页面图像。像 NVivo 这样的东西可能有点过头了,但只需单击并拖动实验室笔记本重要区域周围的框、多边形或自由线条,并与单个/一组单元格/行/列相关联即可。我设想了这样的事情:我正在查看某个实验的 JMP 表,在行 x 中看到一些奇怪的异常值,单击某个按钮或按下热键,实验室笔记本页面就会弹出,我可以阅读实验执行时写的内容,啊!那是我们发现用于此实验的仪器 Y 堵塞的前一天。现在我有理由怀疑这个异常值是由于仪器故障而不是真正的异常值造成的。这可以通过重新阅读物理实验室笔记本来完成吗?当然可以!如果我们不需要在纸质副本(可能包含跨多页的相关信息)和计算机屏幕之间来回切换,而是在屏幕上的数据旁边显示相关部分,那么这会不会容易一千倍?是的!
- 相关理念
- JMP 的问题之一是当您拥有数不清的列时。大量的行尚可管理,但大量的列很快就会让人感到困惑。虽然列分组非常有用,但更一般的概述更符合我上面所说的。流程图是一种常用工具,尤其是在商业领域。在 STEM 中,流程图可以总结各种各样的事情:制造过程、机制、实验程序。如果实施了流程映射,那么可以为非常复杂的 JMP 表提供概述,其中不同的列与图中的不同步骤相关联。例如,如果流程图代表化学反应的实验程序,则浓度、温度/压力、反应容器大小等可能与一个步骤相关联,而结晶条件列可能与第二步相关联,最终产量可能与第三步(分析)相关联。在我的脑海中,我设想从数据表中缩小,并且流程图淡入,并在地图的每个步骤下列出相关的列名,甚至可能是预先编写的分析,但我相信有更好的方法来做到这一点。
- 因为流程图是一个“相关想法”而不是主要想法,所以我将在这里说明“为什么这个想法很重要”:虽然 JMP 日志和仪表板在某些方面涉及这些想法,但以图形、交互式格式概述流程、实验程序,并与数据相连,无论是在数据表还是日志中,对于实验者的大脑空间(尤其是多列表格)和结果交流(尤其是与会议中不熟悉流程的人交流)都非常有帮助。
为什么这个想法很重要:由于其易于使用且功能丰富,JMP(理所当然!)邀请用户将 JMP 用作数据探索和分析的中心。但是,实验和数据收集过程与数据本身同样重要,因为糟糕的实验会产生糟糕的数据。对您所做的事情沟通不畅也会导致其他人进行糟糕的实验……从而产生糟糕的数据。添加功能以易于引用的方式存储您的非数字实验信息将非常有助于组织、分析和技术转让。
笔记:
这里有几项相关的愿望清单,读者应该点赞:
基础数据分析与建模内容组织数据访问数据探索与可视化分享和交流结果回复:增强数据集成:在 JMP 中连接非数值数据和实验跟踪将照片与行和列关联:
允许一组图片与特定的列 [或一组列] 相关联,每张图片分配到一行。
通过将“_pic”附加到图片列“variable_pic”,可以将其与列“variable”关联。
或者将一些列分组,并将带有图片的列添加到同一组中。
数据表中的图像和相关的 JSL 工具 (2020-US-30MP-585)
做个标记。是的!
-> 让我们对表变量使用更复杂的数据类型,而不仅仅是文本和数字
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