| Conférencier |
Transcription |
| Anderson Mayfield |
Très bien tout le monde, merci de votre écoute. Je m'appelle Anderson Mayfield et je suis assistant scientifique à la NOAA ainsi qu'à l'Université de Miami. |
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Et aujourd'hui, je vais vous parler de certaines des recherches que j'ai menées au cours des 20 dernières années pour prédire le sort des coraux récifaux. |
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Et parce que je vais essayer de couvrir beaucoup de matière dans les 35 à 40 prochaines minutes, je veux commencer par remercier mes organismes de financement dès le départ, en particulier la NSF, la NOAA, |
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Fondation Living Oceans. Une grande partie du travail que j'ai eu la chance de réaliser au cours de ma carrière s'est déroulée dans des régions reculées. |
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des lieux utilisant des technologies assez nouvelles qui ont tendance à être coûteuses, j'ai donc eu beaucoup de chance de collaborer avec ces excellentes agences qui ont soutenu ce travail. |
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Je m'intéresse à toutes les facettes de la biologie corallienne, depuis la biologie cellulaire de base. Comment les cellules fonctionnent-elles au quotidien ? Comme je vais vous le montrer, elles sont très peuplées. |
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J'ai fait une période assez longue où je faisais essentiellement des études en aquarium où je mettais les coraux au défi avec différents facteurs de stress comme les températures et l'acidification des océans. |
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Niveaux de PCO2. Nous avons étudié ces données en microcosmes et en mésocosmes. C'est ce qu'on appelle la physiologie environnementale et… Je vais vous montrer quelques données à ce sujet aujourd'hui. |
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Ce qui m’a vraiment intéressé ces dernières années, et qui est en quelque sorte le cœur de cette présentation, ce sont les prédictions. |
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Je fais ici référence au diagnostic moléculaire. Comment savoir si un corail est malade ? On attend généralement qu'il soit presque mort pour le diagnostiquer. Ce que je veux faire, c'est essayer de… |
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Passer d'une approche diagnostique rétroactive à une approche plus proactive. Pouvons-nous détecter des baisses subtiles de la santé des coraux avant qu'ils ne commencent à tomber malades ? |
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Pouvons-nous faire des prédictions sur ceux qui réussiront le mieux dans les décennies à venir et ceux qui ne réussiront pas ? |
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C'est donc en quelque sorte le cœur de ce que je fais au quotidien, et c'est aussi celui dont je vais parler aujourd'hui. |
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Je m'excuse donc auprès de ceux d'entre vous qui ont déjà entendu certaines de mes conférences JMP ; vous allez voir beaucoup de répétitions, |
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mais je veux fondamentalement que tout le monde soit sur la même longueur d'onde avec une partie de la biologie des récifs coralliens qui sera essentielle à la compréhension |
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Pourquoi j'ai agi ainsi. Je vais aborder certains problèmes auxquels sont confrontés les récifs coralliens. Malheureusement, la plupart d'entre nous qui travaillons aujourd'hui dans ce domaine… |
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non seulement nous étudions les récifs coralliens parce qu'ils sont beaux et fascinants, mais aussi parce qu'ils meurent à un rythme très rapide. |
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Je vais ensuite aborder deux approches totalement différentes, mais potentiellement complémentaires, pour prédire le devenir des coraux. L'une d'elles consiste à analyser les tendances de la température mondiale à partir de données satellitaires. C'est sur elles que la plupart des gens se basent. |
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Je vous parlerai ensuite de nouvelles données et j'utiliserai JMP pour vous montrer la rapidité avec laquelle on peut obtenir des données d'analytes moléculaires directement depuis la machine. |
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et nous passons directement à l'élaboration de prédictions grâce à une approche cellulaire. Ainsi, au lieu d'observer les tendances de température globale pour prédire la santé des coraux, nous examinons l'intérieur des cellules coralliennes afin de déterminer si elles pourraient être affectées. |
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Comme je vais essayer de couvrir beaucoup de sujets en un temps relativement court, je vais naturellement survoler certains points. Si vous avez des questions, n'hésitez pas à me les poser. |
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Toutes les données que je vais vous montrer aujourd'hui contiennent des diapositives masquées. Vous pourriez donc me voir effectuer certaines opérations dans JMP sans que vous compreniez ce qui s'est passé. |
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Ils sont en fait intégrés à PowerPoint. Si vous le téléchargez, vous pourrez voir les détails analytiques détaillés, étape par étape. |
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Vous pouvez faire les deux. Je mets toutes les données en accès libre, le PowerPoint, alors envoyez-moi un e-mail. Vous pouvez consulter mon site web personnel, que j'ai répertorié ici. |
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Je serai ravi de répondre à vos questions. Je pense que ces données sont importantes. Elles ne sont pas encore publiées. Mais n'hésitez pas à les consulter à votre guise. |
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Je pense que la plupart des gens ont une idée générale de ce qu'est un récif corallien. Je voudrais juste donner la définition d'emblée : c'est une structure à base de carbonate de calcium. |
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Elle est le fruit d'une symbiose entre animaux et plantes. Ils apprécient les eaux chaudes. Mais, comme vous le verrez bientôt, pas trop chaudes. |
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Elles se situent généralement près de l'équateur et des tropiques, et présentent une biodiversité très riche en poissons et invertébrés. Comme vous pouvez le constater sur cette photo : |
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Il y a de nombreuses cachettes pour les petits organismes. Cela signifie qu'ils constituent des nurseries importantes pour les pêcheries commerciales et protègent littéralement le littoral. |
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des côtes, endommagées par les tempêtes et les vagues, qui fournissent de nombreux services écosystémiques aux humains. Franchement, ce n'est pas pour cela que j'étudie les récifs coralliens. Je les étudie parce que je pense |
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Ils sont magnifiques. J'adore la plongée sous-marine. Et je trouve que les organismes qui les construisent sont vraiment fascinants en eux-mêmes, tout comme le corail récifal. |
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En fait, un corail récifal n'est pas seulement un animal. Il possède des cellules végétales, notamment des algues dinoflagellées, dans environ la moitié de ses tissus. |
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Ces dinoflagellés, que je vous ai montrés ici et dont le nom de famille est « Symbiodiniaceae », sont photosynthétiques. Ils fixent le carbone de la lumière solaire, comme le ferait une plante, et transfèrent le carbone ainsi fixé à leur hôte. |
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Oui. Les coraux peuvent se nourrir ; ils possèdent des cellules urticantes spécialisées, appelées nématocystes, que possèdent tous les cnidaires. |
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Mais franchement, ils dépendent de leurs endosymbiotes pour la plupart de leurs besoins nutritionnels. Les endosymbiotes sont également touchés. |
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Ils récupèrent les déchets du corail pour leur métabolisme. Ils trouvent un abri. C'est un processus très complexe. |
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L'association mutualiste est au centre des études depuis plus de 50 ans, mais il existe encore de nombreuses facettes clés que nous ne comprenons pas. |
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En fait, ce que vous devez savoir pour cette conférence, c'est que le corail est composé de deux tiers d'animaux et d'un tiers de plantes d'un point de vue physiologique. |
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Du point de vue du physiologiste. Il s'agit donc d'un oxymore physiologique, dans le sens où il s'agit d'un animal capable de photosynthétiser grâce à une symbiose mutualiste avec les algues dinoflagellées. |
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Pour comprendre la santé d'un corail, il faut se concentrer non seulement sur le corail lui-même, mais aussi sur ses endosymbiotes dinoflagellés. Et cela va bien au-delà. |
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Les coraux abritent un mini-écosystème complet appelé microbiome. Une multitude de bactéries, de virus et de champignons vivent sur, dans, voire à l'intérieur du squelette corallien. |
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Je ne parlerai vraiment que des dinoflagellés et de l'hôte corallien aujourd'hui, mais il suffit de dire que si vous voulez vraiment avoir une compréhension holistique, vous devez considérer l'ensemble de ce que nous appelons un holobionte, qui est un amalgame d'hôte et de symbiote. |
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Je pense que la plupart d'entre vous le savent déjà. De nombreuses menaces pèsent sur les récifs coralliens à l'échelle mondiale. Le développement côtier, qui entraîne une pollution de l'eau de mer, est un facteur important. Il y a aussi la surpêche. |
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En Floride, nous sommes particulièrement préoccupés par les maladies. Actuellement, une maladie appelée « maladie de perte de tissus des coraux durs » ravage les récifs de Floride. |
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Mais à l'échelle mondiale, ce que je dirais, ce que la plupart des biologistes coralliens considéreraient comme la principale menace pour les récifs coralliens, c'est le changement climatique. La raison |
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Ces coraux vivent déjà pratiquement à la limite supérieure de leur thermotolérance. Si on pousse cette température un peu plus haut, |
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Au-delà de ce qu'ils peuvent supporter, ils vont blanchir. Vous allez donc voir ce que vous voyez sur cette photo. Cela signifie qu'ils ont perdu leurs dinoflagellés. |
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Soit ils les ont expulsés, soit ils les ont digérés. Les dinoflagellants sont peut-être encore présents dans le corail, mais ils ont perdu leur |
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ces coraux ne peuvent plus effectuer la photosynthèse, ce qui signifie qu'ils ne peuvent plus se nourrir. |
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S'ils ne parviennent pas à réacquérir rapidement des symbiotes, ou peut-être à obtenir une bouffée d'eau de mer riche en nourriture qui passe devant eux, ils vont mourir de faim et mourir. |
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En général, ce que l'on observe, c'est que lorsque l'on dépasse d'environ un degré Celsius la température moyenne maximale de l'année, on observe un blanchissement. |
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Et c'est connu depuis des décennies. Il y a une vingtaine d'années, la NOAA a lancé un programme appelé Coral Reef Watch. C'est un site web vraiment intéressant. Je vous recommande d'y jeter un œil. Son principe est très simple : exposer les coraux à une eau plus chaude que d'habitude. |
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Sur de longues périodes, c'est universellement mauvais. Ce concept est connu sous le nom de « semaine de chauffage par degrés », je vais donc essayer de l'expliquer. |
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Je m'excuse pour la faible résolution de l'image, mais c'est la version d'instructions incluse sur leur site web. Voyons donc cette image, car elle est importante. |
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Ainsi, sur l'axe des Y de gauche, vous avez la SST qui signifie température de surface de la mer, c'est-à-dire les données de température déduites par satellite. |
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À droite, nous avons une semaine de réchauffement en degrés, qui correspond à l'intégrale des degrés Celsius au-dessus de la normale multipliée par le temps. Dans ce cas, la ligne bleue hachurée à environ 29 degrés correspond à la moyenne mobile du mois le plus chaud de l'année, qui semble être environ |
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Je suppose que ce sera en été. |
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Vous commencez donc à accumuler du stress à partir d'un degré au-dessus de cette moyenne mensuelle. Cela donne donc 29 plus un, soit 30. |
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Donc, le temps que ces coraux passent au-dessus de 30 degrés, et cet exemple provient de l'atoll de Palmyra, |
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C'est à ce moment-là que vous cumulez ces semaines de réchauffement. Ainsi, si vous avez un degré Celsius au-dessus de la moyenne mensuelle maximale pendant quatre semaines, cela représente quatre semaines de réchauffement. |
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Il y avait deux degrés Celsius au-dessus de la moyenne mensuelle maximale, donc dans ce cas 31, pendant deux semaines, ce qui correspondrait également à quatre semaines de réchauffement. Donc, ceci… |
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Leur hypothèse sous-jacente est, vous savez, que deux degrés Celsius au-dessus de la température maximale mensuelle moyenne pendant deux semaines entraîneront en quelque sorte le même résultat de blanchiment. |
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comme un degré pendant quatre semaines. Du point de vue d'un physiologiste, cela pourrait poser quelques problèmes, mais je pense que dans l'ensemble, c'est plutôt bien. |
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Et leur point de référence sous-jacent est qu'une fois que vous dépassez les quatre semaines de réchauffement, une fois que vous entrez dans cette fenêtre de quatre à huit degrés, vous commencerez probablement à observer un blanchissement. |
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Donc, |
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Ils ont de très beaux GIF sur leur site web qui montrent les données passées. Il s'agit donc d'une analyse des données des trois ou quatre derniers mois, je crois. |
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Donc, on observe les Caraïbes, et là, en gros, là où on voit du rouge, c'est quand on connaît des semaines de réchauffement de quatre à huit degrés. C'est là qu'on prédit un blanchissement. |
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Ils ne le font pas... La NOAA elle-même ne fait pas vraiment de vérification sur le terrain, donc |
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ils comptent sur les individus pour, vous savez, envoyer des e-mails et des téléphones en disant : « Hé, vous savez que votre prédiction sur ce récif particulier que j'aime est fausse. |
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Ou alors c'était bien. Je pense, vous savez, et ces jours-ci, beaucoup d'entre nous restent à la maison. On ne peut pas plonger. |
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Ce type de recherche in silico est peut-être le meilleur que nous puissions faire. Et cet été, il s'agit simplement d'observer l'évolution des températures et d'espérer que les coraux résisteront à la tempête. |
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Et il existe une approche prédictive totalement différente, je dirais, pour examiner la santé des coraux. |
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et en fait, ce n'est pas une observation... donc le Coral Reef Watch regarde en quelque sorte dans un délai d'un an, vous montrant la progression du blanchissement |
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pendant la période la plus chaude de l'année. Et ils s'étendent en fait sur quatre mois. Leurs algorithmes tenteront donc de projeter |
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Comme pour la météo, ce qui va se passer sur ces récifs au cours des quatre prochains mois. Dans ce modèle, qui est en quelque sorte un |
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combinaison de Coral Watch de la NOAA avec certains modèles de l'ONU basés sur les projections de production du changement climatique de l'IBCC, |
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Il s'agit d'un phénomène légèrement différent. Ici, au lieu de voir les températures dans les cellules, on observe en fait l'année de début du blanchissement annuel sévère. |
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Qu'est-ce que cela signifie ? C'est l'année où, selon les prévisions, d'après les relevés de température et les mesures de protection… les semaines de réchauffement prévues, on va commencer à observer un blanchissement. |
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chaque année. Et c'est effrayant, car si les coraux blanchissent pendant un an, |
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Lors d'un été chaud, par exemple, on pourrait observer des morts, mais les coraux vont se rétablir. Certains vont s'acclimater. On pourrait même observer une adaptation. |
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Quand le blanchissement se répète sans cesse, sans répit, les coraux commencent à se dégrader. Et c'est inquiétant, car à l'échelle… |
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2015, c'est déjà passé. On prévoit déjà que certains récifs (voici une carte du sud de la Floride) blanchiront sur la totalité de ces pixels d'environ 25 kilomètres sur 25, et blanchiront déjà chaque année. |
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Ce qui m'intéresse, c'est que je suis physiologiste. Je ne veux pas contredire ces modèles, mais plutôt… |
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Il faut explorer chacun de ces carrés de 25 kilomètres sur 25, car nous savons qu'il s'agit de maquettes à l'échelle mondiale. Ils ne vous disent rien. |
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Chaque corail, chaque pixel, va blanchir. Nous savons qu'il y aura une hétérogénéité. Nous savons qu'il y aura des espèces plus fortes. Même au sein d'une même espèce, il y aura des génotypes plus forts. |
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C'est ce qui intéresse les gens comme moi. Pouvons-nous améliorer la résolution spatiale de ces modèles et peut-être même la résolution temporelle en prenant en compte |
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Des données sur les coraux eux-mêmes ? Il s'agit simplement d'observer la température. Comment pourrions-nous les intégrer à la santé des coraux eux-mêmes ? Avant mon arrivée à la NOAA, |
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Il y a un an et demi, un travail remarquable a été réalisé dans les Keys de Floride, ce qui est excellent pour moi. Nous avons déjà |
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Les récifs coralliens, on connaît tout de leur océanographie et de leur écologie depuis 20 ou 30 ans. Pour quelqu'un comme moi qui veut y aller |
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Prélever des échantillons, faire des analyses, faire des prédictions… c'est une excellente configuration. Je vais donc parler de quatre sites en particulier. Je vais parler de Cheeca Rocks, mais je veux juste vous montrer que nous avons ceci. |
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The Rocks et Cheeca Rocks sont nos sites récifaux côtiers préférés. Little Conch et Crocker Reef sont au large ; il y en a bien d'autres. |
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Mais nous savons, grâce à notre vaste ensemble de données des 20 ou 30 dernières années, que ces récifs côtiers sont plus résilients. |
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Les coraux sont plus forts, leur couverture corallienne est plus importante et ils résistent mieux aux maladies et aux températures élevées. Et cela est dû au stress. |
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Ces environnements sont épouvantables. C'est donc un paradoxe : ils vivent dans des conditions insalubres. |
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L'eau trouble des coraux… une eau riche en nutriments dans laquelle ils ne prospèrent normalement pas, mais ils s'y sont adaptés, voire acclimatés. Ainsi, face aux futurs facteurs de stress, ils sont mieux à même d'y résister. |
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même si les récifs au large sont peut-être ceux où vous souhaitez passer vos vacances, l'eau a ce magnifique aspect des Caraïbes, |
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Mais les coraux ressemblent à ceux que vous voyez à droite. Ce ne sont que de petites plaques de corail. La plupart ont été détruites par le blanchissement et les maladies. Sur les récifs côtiers, on peut encore voir ces grands |
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D'immenses colonies de coraux. L'espèce que vous voyez ici est Orbicella faveolata, et c'est celle que je présenterai dans cette conférence. |
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On peut obtenir de très belles images de Cheeca Rocks, en particulier. Sur certains sites web de la NOAA, notamment celui-ci, vous pouvez faire une plongée virtuelle dans certains sanctuaires marins nationaux. |
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Alors regardons les données de température de Cheeco Rocks et considérons-les dans le contexte de ce que je vous disais plus tôt à propos de ces semaines de réchauffement en degrés et |
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Prévisions de surveillance des coraux de la NOAA. En fait, j'ai créé ces prévisions dans Graph Builder. Je précise que lorsque j'utiliserai JMP plus tard, je les utiliserai. |
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une version bêta de 16. Mais comme je ne vais pas présenter d'outils qui ne sont pas déjà disponibles pour les utilisateurs de JMP 15. |
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Ce seront des choses très basiques. Je ne vous montrerai donc rien de spécifiquement lié à JMP 16 dans cette présentation. |
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J'utilise ici Graph Builder. J'ai essayé d'imiter le graphique de surveillance des coraux de la NOAA, mais en me concentrant uniquement sur Cheeca Rocks. La température de surface de la mer est donc affichée sur l'axe des Y de gauche. |
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Les semaines de réchauffement en degrés à droite. Voici la température moyenne à Cheeca Rocks : la température la plus élevée de l'année se situe en juillet et août. Il fait 31 degrés, ce qui est déjà très chaud pour un récif corallien. |
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Si l'on applique la recommandation de la NOAA de l'ONU, qui fixe la moyenne mensuelle maximale plus un, cela correspondrait à 32 degrés. On pourrait donc s'attendre à ce que les coraux commencent à subir un stress. |
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au-dessus de 0 °C. Vous calculeriez vos semaines de chauffage en degrés en fonction du temps où la température était supérieure à 0 °C. Or, nous savons que c'est en fait trop chaud. Si vous |
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Si vous avez fait vos semaines de chauffage en degrés sur la base de 32, vous n'atteindrez jamais ce seuil de semaines de chauffage de quatre degrés, que vous pouvez voir sur la ligne rouge hachurée la plus basse ici. |
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Au lieu de cela, ce que j'ai fait dans ce graphique, c'est que j'ai réinitialisé le calcul du degré de chauffage par semaine dans JMP à 31,3. C'est |
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C'est en quelque sorte notre seuil de blanchissement. Nous savons, pour avoir visité ces sites si souvent, que 32 est trop élevé. Une fois que ces coraux dépassent 31,3 |
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Pendant quatre à huit semaines, c'est à ce moment-là qu'ils commencent à blanchir. Cela ne veut pas dire que les modèles de surveillance des coraux de la NOAA sont mauvais ; c'est juste que, dans certains endroits, ils pourraient nécessiter quelques ajustements grâce à vos propres observations sur le terrain. |
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Il s'agit donc d'examiner en détail les années pendant lesquelles nous avons étudié Cheeca Rocks. Comme vous pouvez le constater, nous avons commencé à observer un blanchissement en 2014, ainsi que des semaines de réchauffement de 15 degrés au cours de ces années, d'après nos données de 31,3 degrés. |
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le seuil, qui est la ligne rouge continue, était supérieur à 10, ce qui est beaucoup. |
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On s'attend donc à un blanchissement ces années-là. L'anomalie se situe en 2016. 2016 est un peu masquée sur le graphique, mais on peut en voir le haut, la partie rouge la plus haute. |
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La température moyenne oscille autour de 9 à 10 degrés cette semaine. Les récifs auraient dû blanchir cette année-là, mais ce ne fut pas le cas. |
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Cela pourrait donc être, vous savez, une acclimatation ou simplement une récupération en général, mais c'est l'année anormale. 2017 a été une année plus fraîche même si nous avons vu des semaines de réchauffement de huit degrés, les récifs n'ont pas blanchi, mais ensuite le blanchissement de 2018, le blanchissement de 2019. |
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Et puis ce matin, j'ai mis à jour ceci pour zoomer sur 2020 et malheureusement, lorsque j'ai fait cette présentation pour la première fois il y a quelques semaines, |
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vous savez, nous n'avons pas eu de menaces de blanchissement, mais maintenant vous pouvez voir les barres rouges grimper au-dessus de quatre car la température a été supérieure à 31,3 ces dernières semaines, donc malheureusement nous allons probablement avoir une autre année de blanchissement. |
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L'avantage de travailler avec les coraux, c'est qu'ils sont sessiles, donc immobiles, sauf pendant la période de larve. Sur ces sites, |
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non seulement nous pouvons aller voir, vous savez, le blanchiment |
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D'année en année, nous avons des colonies marquées. Nous pouvons les échantillonner à différents moments et observer l'évolution de leur physiologie en fonction des variations de température. |
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Et puis, on pourrait vraiment se permettre ce luxe, puisque nous savons ce qui se passe chaque année en matière de blanchiment, et on peut faire des prévisions rétrospectives. On sait, hé, j'ai prélevé l'échantillon en mars ; |
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Ce corail a blanchi en août. On pourrait peut-être examiner les biopsies réalisées plus tôt pour voir si on peut détecter un quelconque stress. |
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Ce que je veux vraiment faire, ce n’est pas tant regarder la chronologie du processus de blanchiment, car je pense que Coral Watch le fait assez bien, |
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Plus de blanchiment en été. On ne pourra pas faire mieux. Peut-être pourriez-vous mieux planifier. Ce que je veux vraiment savoir, c'est… |
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pourquoi dans ce cas particulier, voyez-vous partiellement blanchi (c'est le PB), blanchi (c'est le BL), ou le NB (non blanchi), pourquoi voyez-vous |
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Cette hétérogénéité ? Ce n'est pas aussi évident, sauf peut-être si on regarde en bas à droite : on voit des colonies qui pâlissent. On voit des colonies qui ne pâlissent pas. |
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Pourquoi certains coraux sont-ils plus résistants que d'autres ? Les informations recueillies auprès de ces colonies peuvent-elles servir à réaliser un test permettant de créer une signature protéomique ou moléculaire d'une colonie stressée ? |
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par rapport à une solution résiliente. C'est ce qui me semble le plus utile. Ça pourrait ne pas être possible. |
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...de savoir à l'avance quels coraux blanchiront en premier ou en second. Mais on pourrait peut-être le savoir, d'après mes calculs. |
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biopsie, basée sur mon analyse moléculaire et basée sur mon modèle prédictif résultant, ce corail, je le prédis, va pouvoir mieux résister au blanchissement de celui-ci. |
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C'est en quelque sorte mon objectif. Et j'essaie de m'y attaquer depuis que je suis doctorant à Hawaï. |
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Il s'agit principalement de faire des recherches sur l'expression des gènes, pour voir si nous pouvons trouver un gène qui augmente son expression dans les coraux qui sont plus sensibles au stress. |
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Et peut-être qu'ils ne sont pas du tout utilisés chez les coraux résilients, ou peut-être que c'est l'inverse. Peut-être y a-t-il des gènes qui ne sont utilisés que par les coraux robustes. Ce sont des choses que nous pouvons mesurer. |
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J'ai découvert plus tard qu'il n'y avait vraiment aucune corrélation entre l'expression des gènes et les concentrations de protéines. |
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chez les coraux. On pourrait donc toujours utiliser les données génétiques pour l'analyse des biomarqueurs. Les données d'expression génétique pourraient être très utiles pour prédire la santé des coraux. |
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Mais si vous voulez comprendre ce qui se passe simultanément dans les cellules, si vous voulez connaître le comportement cellulaire, vous devez observer les protéines. On ne peut pas en déduire |
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Les niveaux de protéines sont différents des niveaux d'expression génétique, car le R² des coraux est quasiment nul, tout comme celui de leurs symbiotes. J'ai donc opéré un changement radical dans mes recherches en protéomique il y a deux ou trois ans. |
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Donc ce que je voulais vous montrer aujourd'hui à l'origine, lorsque j'ai écrit ce résumé pour la première fois, c'était |
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données de terrain de nos colonies marquées pour montrer comment leurs signatures protéiques évoluent au fil du temps |
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Pour les coraux sensibles au stress et les coraux résilients. Et ce sera ma priorité à la réouverture de nos laboratoires. Malheureusement, |
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Nous ne sommes pas autorisés à faire des travaux en laboratoire pour le moment à cause de la COVID. Nous ne sommes pas non plus autorisés à travailler sur le terrain. Je vais donc vous montrer des données expérimentales qui, selon moi, pourraient être utiles. |
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Pour répondre à certaines de ces questions, voici notre corail préféré, Orbicella faveolata. |
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Voici une photo pâle des Keys de Floride. Nous l'avons prise sur les quatre sites que je vous ai montrés plus tôt. |
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Nous avons réalisé une expérience simple : une étude de cinq jours à une température contrôlée de 30 °C, contre une température très élevée de 33 °C. Ces valeurs seront codées en rouge. |
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Dans les figures, ou peut-être avec un V pour « très élevé ». Nous avons ensuite réalisé une étude plus réaliste avec une exposition de 31 jours à la même température témoin, mais à une température élevée plus pertinente sur le plan environnemental, soit 32 °C. |
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Vous vous souvenez que le 32 pénètre dans cette zone où la plupart des coraux ne peuvent pas résister à une exposition au 32 sur une période prolongée. |
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Alors ce que j’ai fait… eh bien, ce que je voulais faire, c’était examiner les cellules de ces coraux et voir s’il y avait des protéines que l’on ne trouve que dans les coraux qui blanchissent. |
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Y en a-t-il qui se trouvent uniquement chez les individus résilients capables de s’acclimater ? |
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J'ai donc adopté une approche protéomique « shotgun ». C'est une façon élégante de dire que j'ai simplement séquencé toutes les protéines présentes dans cet échantillon par spectrométrie de masse. |
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En réalité, ce n'est pas si simple si l'on entre dans le vif du sujet des analyses moléculaires et du spectromètre de masse. Je n'entrerai pas dans les détails aujourd'hui, je tiens simplement à préciser que nous utilisons ce spectromètre. |
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Le spectromètre de masse Thermo Fisher, appelé Q Exactive, est l'un des meilleurs instruments d'analyse jamais développés. Ses performances et sa sensibilité sont impressionnantes. |
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Mais je tiens à souligner que, lorsque l'on effectue ce type d'analyses sur le corail, on obtient des protéines coralliennes et des protéines dinoflagellées. Il est très important d'examiner les deux. Vous pourriez… |
