| Oratore |
Trascrizione |
| Pietro Polito |
Bene, sono nella riunione Zoom. |
| Brian T |
Ciao Peter. |
| Pietro Polito |
Ciao Brian. |
| Brian T |
Ecco fatto. |
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perfetto, giusto. |
| Pietro Polito |
Va bene. |
| Brian T |
Dammi una seconda X, ne ho bisogno. |
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Vicino, oh sì. |
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Esaminerò tutte queste cose. |
| Pietro Polito |
Prenditi il tempo che ti serve e fammi sapere quando sei pronto. |
| Brian T |
sì, quindi questo è leggermente. |
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Forse qualcosa di più complicato, non so cosa farò. Sto presentando il discorso insieme a Chris Gold, ma in realtà è in vacanza, quindi ha pre-registrato la sua parte perché io la riproducessi, e ha detto che avrei dovuto cambiare alcune impostazioni di Zoom affinché l'audio funzionasse sulla sua registrazione. |
| Pietro Polito |
Sì, quindi quando inizi il tuo. |
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Lasciatemi fare questo velocemente per ricordarmi che quando si avvia la condivisione si deve cliccare su Condividi audio, ma non si deve attivare l'opzione Ottimizza per il videoclip, che in realtà è così. |
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non aiuta, nonostante sembri opportuno. |
| Brian T |
Giusto, quindi devo riprovare, devo solo dire condividi. |
| Pietro Polito |
In basso a sinistra ci saranno due caselle di controllo, una delle quali dice "Condividi audio". |
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Ok, c'è scritto "ottimizzato per videoclip" e vuoi cliccare sul pulsante "Condividi suono". |
| Brian T |
Condividi semplicemente l'audio, ok? |
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Va bene, questo è tutto. |
| Pietro Polito |
perfetto e ciò che potrebbe andare bene è prima di iniziare. |
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Condividiamo quel video e assicuriamoci che funzioni. Okay, così, a metà del tuo discorso, quando lo farai, sapremo cosa è successo. |
| Brian T |
Sì, sì, assolutamente. E l'altra cosa è se imposto il mio set di diapositive in modalità relatore, il video vedrà la mia modalità relatore e le mie diapositive o sarà solo... |
| Pietro Polito |
Ehm, penso che dovrebbe mostrare solo le tue diapositive, ma, ripeto, non possiamo testarlo prima di iniziare. |
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lanciare per essere sicuri. |
| Brian T |
Ok, non preoccuparti perché sì. |
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Ok, fantastico. Per prima cosa proverò il video. |
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Va bene. |
| Brian T |
Quindi posso sentire il. |
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Riesco a sentire il video nelle mie cuffie. |
| Pietro Polito |
Non vedo ancora nulla. |
| Brian T |
Giusto, quindi penso che ciò di cui ho bisogno sia condividere. |
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Condividi ciò che hai detto. |
| Pietro Polito |
Vuoi condividere uno schermo, non solo un'applicazione. |
| Brian T |
Quindi condividerò l'intero schermo, ok? |
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Ecco fatto, mi dispiace, quindi questo è tutto e poi. |
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Ha detto che dovevo attivare l'audio. |
| Pietro Polito |
Alla fine, quando fai quella condivisione dello schermo, in basso a sinistra vedrai scritto "Condividi il nostro audio del computer", credo. |
| Brian T |
sto solo guardando adesso e. |
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Condividi l'audio. |
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Loro dicono sì, è nella sezione centrale, quindi suonerò bene, okay, andiamo. |
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provaci subito. |
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Grazie Brian, ora mostrerò l'analisi di queste quattro curve di risposte lineari prodotto prodotto impuro sì materiale di partenza. |
| Pietro Polito |
E ti sento molto meglio di quanto pensassi in questa analisi, mamma. |
| Brian T |
Il calcio è stato fatto forte. |
| Pietro Polito |
No, no, va bene fratello. |
| Brian T |
17 Elencherò queste cose man mano che andrò avanti e voglio ringraziare Clay per questo. |
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dedizione ok, torniamo subito all'inizio, pronti per. |
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fatto. |
| Pietro Polito |
Bene, e poi ci sono alcune impostazioni che ci hanno chiesto di fare. |
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ottimizzare. |
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Lasciatemi analizzare meglio. |
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E, prima di farlo, vorrei solo confermare che il tuo discorso sta combinando, lo vedi qui, combinando i primi principi, la scienza e il massimo per massimizzare la resa e minimizzare il periodo con la curva DOE, e poi ho solo bisogno di una piccola premessa qui. |
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Si riconosce che questa registrazione è destinata all'uso in occasione della conferenza Chump Discovery Summit e che sarà disponibile al pubblico nella community di utenti JMP. Si autorizza pertanto questa registrazione e questo utilizzo. |
| Brian T |
Quindi sì, quando sarà? |
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annunciato quando sarà disponibile per la comunità degli utenti indesiderati. |
| Pietro Polito |
Penso che li rilascino non più di una settimana prima. |
| Brian T |
Va bene. |
| Pietro Polito |
Ora, questo è certo. |
| Brian T |
Finché ne avrò l'opportunità, vorrei solo dire di andare avanti perché, beh, quello che devo fare è condividere questa registrazione o l'intera serie di diapositive per far sì che il materiale per cui ho ricevuto l'approvazione sia approvato. Ho già ricevuto una pre-approvazione. |
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Ecco perché posso registrarlo, ma poi, se ho due o tre settimane, riuscirò a farlo arrivare. |
| Pietro Polito |
E sì, quindi hai circa un mese. |
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Suppongo. |
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La prima settimana di ottobre e lo lascerò. |
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Sai che c'è un piccolo asterisco accanto al tuo e che lei deve confermare con te prima di condividerlo. |
| Brian T |
Sì, sì, per favore sì. |
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Va bene, ma non dovrebbero esserci problemi, sono solo processi interni alle aziende. |
| Pietro Polito |
No, lo capisco perfettamente, lavoro molto con l'industria petrolifera e. |
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Ottenere l'approvazione può richiedere molto tempo. |
| Brian T |
Sì, sì, fantastico. |
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Quindi ho ragione. |
| Pietro Polito |
Dobbiamo solo controllare velocemente le impostazioni del tuo schermo. |
| Brian T |
Se ti hanno sparato. |
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Volevo solo vedere se, quando andrò dal relatore,... |
| Pietro Polito |
vedo che continua a vendere il mio obiettivo e il mio presentatore. |
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Io e lui non vediamo l'intera modalità presentatore, i tuoi appunti e tutto il resto. |
| Brian T |
Giusto, va bene. |
| Pietro Polito |
C'è un modo per mostrare solo una diapositiva sull'altro monitor, magari invertendo le cose. |
| Brian T |
Al momento sono su un solo schermo, è abbastanza. |
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Uno schermo grande va bene, quindi se lo è va bene. |
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Io semplicemente... io semplicemente andrò via e stamperò alcune diapositive. |
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solo volantini. |
| Pietro Polito |
Giusto nel caso in cui questa avventura tre. |
| Brian T |
Okay, giusto, quindi non è, non è, non si può fare. Okay, lasciami. |
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scrivi ok, ok, mi dispiace tanto, vai avanti con il tuo. |
| Pietro Polito |
Sì, quindi in basso a sinistra se usi Windows 10 dovresti trovare un campo per cercare, se digiti semplicemente "Impostazioni schermo"... |
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Spettacolo. |
| Pietro Polito |
E ci sarà un cambiamento nella risoluzione, penso che da qui in poi passeremo alla risoluzione dello schermo. |
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Ti consente di avere molto. |
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più grandi degli altri, quindi scala. |
| Brian T |
sembra ma impostalo al 19 2010. |
| Pietro Polito |
1030 sì. |
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Ok, ora renderemo più facile la lettura per tutti. |
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Le tue diapositive e tutto quello che so probabilmente ti sembrano un po' strani. |
| Brian T |
Sì, va bene. Sì, è bello. Ho uno schermo da 34 pollici, il nostro adorabile. Sì, credo di sì. |
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Perché l'azienda mi sta fornendo il miglior schermo per la casa, ecco come funziona. |
| Pietro Polito |
Allora raccontaci come sei tornato in ufficio. |
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scopri dove si trova l'ufficio più adatto a te in quale città. |
| Brian T |
si tratta di cavi, dove vivo a Leeds, ma è un campo medico, quindi. |
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La città più grande sarebbe Manchester. |
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Sì. |
| Pietro Polito |
Conosco alcuni nomi importanti, per quanto imbarazzante, grazie agli WHO e al loro album dal vivo, ma non so molto altro oltre a questo. |
| Brian T |
Quindi se sai che abito a cinque minuti di distanza da dove si sono esibiti in modo imponente. |
| Pietro Polito |
OH. |
| Brian T |
In città. |
| Pietro Polito |
è fantastico. |
| Brian T |
Il posto in cui penso sia Roundhay Park, che è. |
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Okay, probabilmente è finita, la vita è solo all'aria aperta, è piuttosto bella, sì. |
| Pietro Polito |
Molto bello. |
| Brian T |
Sì, certo. Okay, quindi ho fatto quella roba. |
| Pietro Polito |
E poi è come se avessi spento il cellulare e sembrassi come se avessi già chiuso gli occhi su qualsiasi altra cosa che potrebbe fare strani rumori in sottofondo. |
| Brian T |
Sì, lo farò e basta. |
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Voglio solo ricontrollare tutto, quindi ho appena fatto lo zoom del videoclip e. |
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Sbarazzarsi di. |
| Brian T |
Questi. |
| Pietro Polito |
E poi mostrerai tutto in PowerPoint oppure utilizzerai sia PowerPoint che JMP? |
| Brian T |
So che molti dei video di Chris sono quasi degli screenshot di quello che farebbe e JMP, ma ne ho uno verso la fine, quindi inizio con un'introduzione, poi passo al video di Chris e poi torno indietro e finisco di parlare di alcune cose, e quando arrivo a quel punto. |
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Lo farò allora. |
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devono già aprire. |
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BENE. |
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Quindi aprirò questa discussione e poi spiegherò perché in realtà lo sto cercando. |
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Per parlarne. |
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Ok, profili, ne parlerò un po'. |
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E poi devo tornare di nuovo alle mie diapositive solo per concludere il riassunto. |
| Pietro Polito |
Va bene. |
| Brian T |
Quindi, essere circa. |
| Pietro Polito |
E con queste dimensioni tutto sembra a posto, sei libero di rendere quelle scatole un po' più grandi se vuoi sfruttare lo spazio in modo che la gente possa vederle molto più facilmente, ma possono vederle benissimo ora, se è così che ti piace tenerle. |
| Brian T |
Sì, beh sì, eccolo ingrandito sul mio schermo. |
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Oh sì, sì, intendo dire che puoi trascinare l'angolo delle caselle di quel profilo di produzione verso destra. |
| Pietro Polito |
Tutti più grandi. |
| Brian T |
Va bene, e. |
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Se lo sai, cercherò di ricordarmelo, probabilmente è meglio se mostro loro che in realtà proviene direttamente da qui. |
| Pietro Polito |
E poi capire. |
| Brian T |
E allora potrò. |
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sì, qualcosa del genere. |
| Pietro Polito |
E sto solo vedendo se non lo fai, quindi non voglio micro, sì, se lo fai, ma voglio solo essere sicuro che tu possa ancora vedere. |
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Il tag su quell'asse X. |
| Brian T |
Sì, esattamente, sì. |
| Pietro Polito |
Sì, va bene, lo farò. |
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Ti darò un 321 e poi diventerò muto, a meno che non stia succedendo qualcosa di importante di cui non ti accorgi. |
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Qualunque cosa io abbia in programma, non dirò una sola parola finché non avrai finito. Resterò qui e mi assicurerò che la registrazione venga effettuata correttamente e che tu mi dica quando hai finito. |
| Brian T |
Sì, non preoccuparti, quindi devo solo orientarmi. |
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Sicuro. |
| Pietro Polito |
Bene, io smetterò di parlare e tu potrai iniziare quando vorrai e bene. |
| Brian T |
Ok, grazie. |
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Voglio solo provare un paio di cose per un ragazzo. |
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combinando l'esecuzione di principi scientifici di base per massimizzare la resa e ridurre al minimo le impurità con la curva di adattamento DOE. |
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La conferenza affronterà vari argomenti e, se non li approfondiremo in modo sufficientemente dettagliato, potrete fare riferimento alle diapositive e al video in seguito. |
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AstraZeneca è un'azienda farmaceutica che si concentra su tre principali aree di ricerca terapeutica per fornire medicinali sfruttando una serie di capacità. |
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Lavoro in un reparto multidisciplinare di sviluppo chimico per sviluppare il processo di produzione del principio attivo farmaceutico in un medicinale. |
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All'interno delle attività ci occupiamo di tecnologia e sviluppo farmaceutico, ma a livello organizzativo ci troviamo nell'interfaccia tra la ricerca e la produzione di medicinali. |
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Di conseguenza, siamo coinvolti in numerose fasi del ciclo di vita di un medicinale. |
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Bene, passiamo al discorso. Per inquadrare il contesto, dobbiamo guardare al passato per capire perché ora sia necessario sviluppare approcci sperimentali. |
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Nei primi anni 2000, quando ho iniziato a lavorare in AZ, un esperimento di laboratorio consisteva solitamente in una singola reazione e in un paio di campioni prelevati nel tempo. |
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Tornando ai giorni nostri, un esperimento prevede l'esecuzione di più reazioni in parallelo, prelevando numerosi campioni da ciascuna reazione. Gli esperimenti sono molto più ricchi di dati e contengono utili spunti di riflessione sul processo, se si riesce a combinare approcci sperimentali, metodi di analisi e competenze specifiche. |
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A mia conoscenza, non esiste un approccio chiaro e innovativo su come analizzare i progetti sperimentali, in cui la risposta è il profilo della reazione chimica nel tempo. |
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Gli approcci attuali tendono ad analizzare sottoinsiemi di dati, anziché analizzare tutti i dati disponibili, e mi chiedo quale processo l'apprendimento abbia trascurato. |
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Il divario tra ciò che viene fatto attualmente e il modo in cui vorrei analizzare i dati solleva due domande: quale approccio di analisi può utilizzare tutti i dati relativi al profilo di reazione nel tempo? |
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Possiamo perfezionare l'analisi tenendo conto della conoscenza della materia? |
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Questo ci porta al titolo della nostra grande presentazione, che si traduce in ciò che facciamo in JMP, ovvero analizzare i profili di reazione DOE con la curva di adattamento e la curva DOE. |
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Il caso di studio DOE utilizzato è un pacchetto di lavoro da dove lavoro, sviluppo chimico, |
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Solo i dettagli resi anonimi per permettermi di condividerli. In questo caso, è stato impostato un disegno sperimentale a quattro fattori con campioni multipli prelevati da ciascuna reazione. |
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Ci sono dei criteri di risposta che ci interessa raggiungere e, idealmente, tutti, ma il più importante da rispettare è che l'impurità del prodotto rimanga al di sotto del 2%. |
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Inizialmente avevo preso in considerazione Functional Data Explorer come soluzione per analizzare i profili di reazione. |
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Le FDE sono molto flessibili, e questo può rappresentare un punto di forza e di debolezza, poiché i profili non realistici vengono approssimati. Man mano che queste approssimazioni dei profili vengono applicate all'analisi DOE, le previsioni di risposta possono risultare irrealistiche, superando i livelli massimi o minimi. |
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Lavorando con l'esperto in materia, sappiamo molto su cosa aspettarci da un profilo di reazione e su come le risposte potrebbero essere collegate. Ad esempio, |
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quando campioniamo una reazione, ci aspettiamo che il materiale di partenza, l'impurità del materiale di partenza, il prodotto e l'impurità del prodotto sommino al 100%, a patto che non si formi nient'altro. |
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Gli ingredienti in ingresso devono essere in equilibrio con i componenti in uscita. Il bilancio di massa deve essere mantenuto. |
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dall'impurità del materiale di partenza o formato dal prodotto. |
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Non è sempre garantito che l'impurità del materiale di partenza aumenti nel tempo e potrebbe ridursi se reagisce formando l'impurità del prodotto. La comprensione del processo contribuisce anche a determinare la forma che ci si aspetta da una risposta... il profilo di reazione di una risposta. |
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Ciò ha portato all'idea che, se accettiamo una riduzione della flessibilità nelle forme dei profili approssimate, possiamo adattare approssimazioni di curve più realistiche e più vicine alla comprensione del primo principio? |
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Il risultato dell'analisi è quindi in una forma più vicina al modo di pensare degli scienziati. |
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JMP dispone di una serie di formule precaricate, che possono essere abbinate ai profili di risposta previsti per la data sostanza chimica studiata. |
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risposte, fattori, tempistiche. |
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Adattiamo varie curve precaricate, le confrontiamo e selezioniamo quella più adatta, idealmente in base ad alcuni criteri che coinvolgono parametri di analisi e competenza in materia. |
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Curve DOE analizza i coefficienti dei parametri della formula della curva, che JMP converte automaticamente in risposte DOE originali da visualizzare nel profiler di previsione, insieme al DOE fattorizzato. Davvero interessante. |
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Chris ora illustrerà l'approccio, evidenziando gli ostacoli che abbiamo incontrato lungo il percorso e dove siamo arrivati con l'analisi. |
| Chris Gotwalt |
prodotto, impurità del prodotto, materiale di partenza e impurità del materiale di partenza. |
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Vorrei anche aggiungere che questa analisi è stata molto più impegnativa di quanto avessi inizialmente pensato. Alcuni di questi aspetti sono stati notevolmente semplificati da Clay Barker in JMP Pro 17. |
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Vi spiegherò queste cose man mano che andrò avanti e voglio ringraziare Clay per la sua reattività e dedizione nel rendere Fit Curve più facile da usare. |
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Per chi ha familiarità con il Functional Data Explorer, la curva DOE funziona in modo simile. Abbiamo una risposta a misure ripetute, come si vede qui a destra dello schermo. Per ciascuna delle curve di risposta, adattiamo un modello non lineare. |
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In questo caso, una curva logistica a due parametri. |
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Questo ci fornisce un parametro di posizione (theta) e una stima del parametro di scala (tau) per ogni curva di risposta nel DOE. Quindi modelliamo i theta e i tau estratti come risposte utilizzando la regressione generalizzata. |
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Di solito uso i minimi quadrati con selezione diretta, che è l'impostazione predefinita. Come vedremo, ci sono casi in cui è vantaggioso usare altre distribuzioni, come la lognormale, quando la distribuzione |
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I parametri devono essere rigorosamente positivi. Il risultato finale è un modello complessivo che incorpora sia il tempo che i nostri fattori DOE per un modello complessivo che prevede la curva di risposta. Ecco le quattro curve di risposta nei nostri dati. |
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Inizierò con l'analisi della risposta del prodotto. Una volta aperta la tabella dati, troviamo la piattaforma della curva di adattamento nel sottomenu di modellazione specializzata del menu Analizza di JMP Pro. |
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Carichiamo le colonne. Il prodotto è la risposta, il tempo di campionamento è la X, o variabile regressore, in questo caso. La nostra variabile di raggruppamento è il nome dell'esperimento. |
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E poi abbiamo i fattori DOE come variabili supplementari. Ora diamo un'occhiata alle curve della risposta del prodotto e vediamo |
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Quale dei modelli non lineari supportati dalla piattaforma di curve di adattamento si adatta a quel tipo di forma? Possiamo vedere che le curve logistiche si adattano abbastanza bene, |
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e un paio di altri. Quindi vai al menu del triangolo rosso. Sembrano curve sigmoidee, quindi andremo lì. |
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Curve logistiche...sceglieremo il modello logistico a tre parametri. Se premiamo Alt e poi clicchiamo con il tasto destro, possiamo effettivamente scegliere un sacco di modelli diversi e combinarli facilmente. |
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Il modello logistico a quattro parametri sembra funzionare meglio di qualsiasi altro modello che utilizza i criteri di selezione del modello AICc, ma si noti che i quadrati R per tutti i modelli |
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tendono ad essere piuttosto elevati, quindi il modello logistico a quattro parametri ha un R quadrato di 0,998, mentre il modello logistico a tre parametri non è molto indietro, attestandosi a 0,993. |
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E la crescita di Weibull è pari a 0,978, quindi forse questi tre sono tutti contendenti per il modello che useremmo. |
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Andiamo avanti e diamo un'occhiata alla logistica a quattro parametri. Inizialmente, qui vediamo il grafico complessivo di tutte le curve di risposta. |
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E poi vediamo le singole curve di risposta sovrapposte ai punti dati. Se osserviamo le stime dei parametri di questo modello logistico a quattro parametri, |
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vediamo che ci sono asintoti inferiori che sono valori negativi molto grandi. |
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Ciò è problematico perché indicherebbe che il valore iniziale della quantità di prodotto sarebbe uguale a questo grande valore negativo, non a zero, e quindi ciò è in conflitto con quanto sappiamo sul meccanismo che genera i dati. |
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Se clicchiamo sulla curva DOE e diamo un'occhiata all'analisi della curva DOE che collega i quattro parametri logistici ai fattori DOE, vediamo immediatamente che stiamo ottenendo |
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previsioni piuttosto folli, e quindi questo potrebbe non essere un buon modello da utilizzare. |
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Ecco alcuni altri esempi di adattamenti di modelli non lineari che inizialmente sembrano abbastanza buoni, ma quando li si guarda |
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Nelle valutazioni della formula di previsione tra i punti dati, vediamo che stanno succedendo cose folli, il che significa che probabilmente non dovremmo usare questi modelli per un'analisi della curva DOE. |
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Procediamo a semplificare un po' le cose e diamo un'occhiata al modello logistico a tre parametri. |
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Quindi il modello logistico a tre parametri ha un asintoto iniziale pari a zero, che in questo caso ha senso per i dati del prodotto qui, perché |
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la quantità di prodotto che avremmo all'inizio dell'interazione |
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Dovrebbe essere zero. E come possiamo vedere, l'adattamento sembra piuttosto buono se osserviamo la sovrapposizione del modello e i punti dati sulla destra. Procediamo a eseguire l'analisi DOE della curva andando al menu del triangolo rosso. |
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che richiama l'analisi della curva DOE e il profiler CDOE. Quando osserviamo il grafico effettivo e previsto dell'analisi della curva DOE, vediamo |
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le cose sembrano andare abbastanza bene lungo la linea a 45 gradi, ma osserviamo questi andamenti preoccupanti, dove sembra che alcune funzioni individuali si muovano a un angolo di 90 gradi rispetto alla linea a 45 gradi, il che indica che c'è un cattivo adattamento. |
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E quando osserviamo la curva del profiler DOE, se regoliamo alcune delle variabili di input ai loro estremi, |
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vediamo che ci sono previsioni di tracce temporali del prodotto che in realtà diminuiscono nel tempo, il che non ha assolutamente senso. |
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Dobbiamo approfondire un po' e capire cosa sta succedendo e come gestirlo. Quindi, quando analizziamo la regressione generalizzata per i singoli parametri del modello non lineare, |
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ne abbiamo uno per il tasso di crescita, uno per il punto di flesso e uno per l'asintoto del modello non lineare. |
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In questo caso, penso che il problema riguarderà il parametro del tasso di crescita, perché questo determinerà se i dati possano aumentare o diminuire. Analizzando più approfonditamente la regressione generalizzata per il tasso di crescita, |
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possiamo richiedere di adattare una distribuzione log-normale, |
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che forzerà il parametro del tasso di crescita |
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essere vincolati a essere positivi, che è ciò che vogliamo. Vorrei anche sottolineare che, all'interno delle opzioni dei controlli avanzati della regressione generalizzata individuale, possiamo anche attivare l'ereditarietà dell'effetto, un'opzione sensata quando analizziamo una curva DOE. |
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Clay Barker è andato avanti e l'ha impostato in modo che l'impostazione predefinita sia quella di avere effetti sull'ereditarietà per impostazione predefinita |
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In JMP 17, ma abbiamo dovuto farlo manualmente per ogni risposta e ogni parametro in questa analisi. Ora che abbiamo completato la modellazione log-normale del parametro del tasso di crescita, i nostri grafici diagnostici CDOE vengono aggiornati automaticamente. |
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E vediamo che quelle preoccupanti curve di risposta ora seguono molto più da vicino la linea dei 45 gradi nel grafico DOE effettivo rispetto a quello previsto e le nostre previsioni nel profiler CDOE hanno molto più senso. |
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Ora che siamo molto più soddisfatti di come il nostro modello si adatta alle curve del prodotto, possiamo salvare la nostra formula di previsione e passare alla risposta successiva. |
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Passando alla risposta delle impurità del prodotto, abbiamo scoperto che anche le curve logistiche a tre parametri la modellavano abbastanza bene, anche se non altrettanto bene quanto con le sole curve del prodotto. |
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In ogni caso, l'analisi è stata molto simile e quindi passerò al modello dei materiali di partenza. |
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Osservando le curve di risposta del materiale di partenza, vediamo che, a differenza delle curve del prodotto e delle impurità del prodotto, |
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Questi sono decrescenti in modo monotono. Questo suggerisce che una curva esponenziale o una curva logistica con un tasso di crescita negativo sarebbero un modello ragionevole per questi dati, quindi diamo un'occhiata a questi modelli. |
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Quindi, nel rapporto di confronto dei modelli, vediamo che il modello esponenziale a tre parametri è il migliore, seguito dal modello logistico a quattro parametri che usa l'algoritmo AICc. E l'R quadrato per questi due modelli è piuttosto simile. |
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Tuttavia, se osserviamo il grafico sovrapposto degli adattamenti del modello per la logistica a quattro parametri, è abbastanza chiaro che all'aumentare del tempo per alcune di queste curve, la previsione del materiale di partenza diventerà negativa. |
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Mentre per l'esponenziale a tre parametri, questo non accade. Quindi, in questo caso, useremo un esponenziale a tre parametri. |
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Quindi ci troviamo in una situazione in cui i criteri di selezione del modello e il nostro buon senso quando guardiamo i modelli |
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stanno suggerendo la stessa cosa. |
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Procediamo all'analisi della curva DOE del nostro modello esponenziale a tre parametri. |
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Come il modello di prodotto che abbiamo realizzato inizialmente, nel complesso il modello sembra buono, ma alcuni esperimenti stanno ottenendo previsioni che vanno completamente nella direzione sbagliata rispetto al nostro grafico effettivo rispetto a quello previsto. |
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E quando giochiamo con il profiler della curva DOE, scopriamo che ci sono combinazioni di impostazioni dei fattori che prevedono quantità di materiale di partenza in rapido aumento nel tempo, |
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il che non ha alcun senso. La causa è che abbiamo adattato un modello di tipo normale o dei minimi quadrati ai parametri del tasso di crescita, |
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Ma tutti i nostri parametri del tasso di crescita sono negativi. Il problema è che il nostro modello normale o dei minimi quadrati non può forzare il parametro del tasso di crescita a rimanere negativo. |
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E sfortunatamente nella versione 16 di GenReg non esiste una distribuzione che mantenga le previsioni sempre negative. Quindi, in questo caso, |
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Dovrò provarlo un po' fuoristrada per far funzionare questo modello, ma Clay Barker ha aggiunto una distribuzione logaritmica normale negativa a GenReg |
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in modo che sia più facile modellare dati rigorosamente negativi nella versione 17 Pro. |
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Per risolvere questo problema, ho deciso di salvare la formula di previsione per il modello CDOE complessivo, sapendo che avrei dovuto apportare una correzione al parametro del tasso di crescita. |
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Ho creato una tabella dati con i dati del fattore DOE e i tassi di crescita, quindi ho utilizzato la colonna formula per creare una nuova colonna per il tasso di crescita negativo. Modello |
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una distribuzione lognormale in GenReg per questo tasso di crescita negativo. |
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Salvare la formula di previsione, quindi sono andato avanti e ho fatto un po' di modifica delle colonne della formula, dove ho rimosso il modello dei minimi quadrati dalla curva di adattamento e l'ho sostituito con un modello GenReg per il tasso di crescita negativo, e in questo modo, |
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Sono riuscito a ottenere un modello che si adatta molto bene al materiale di partenza. L'ultima delle risposte che stavamo modellando riguardava l'impurità del materiale di partenza e questa si è rivelata in realtà la più difficile da gestire. |
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Ciò è dovuto al fatto che ha avuto un comportamento di tipo picco per un certo numero di esecuzioni. |
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E per alcuni degli altri, aveva questo comportamento monotono crescente. E quindi abbiamo avuto molto da fare con una singola risposta qui, e |
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nessuno dei modelli nella curva di adattamento funzionava davvero bene quando abbiamo iniziato ad applicare la curva DOE a quei modelli non lineari. |
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La cosa migliore che siamo riusciti a trovare sono stati i modelli esponenziali, che hanno portato a R quadrati molto elevati, per quanto riguarda la componente di modellazione non lineare dell'analisi. Ma quando è arrivato il momento di applicare il DOE della curva, |
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Abbiamo ottenuto previsioni folli, nell'ordine di migliaia, quando avrebbero dovuto essere molto, molto più piccole. E questi non erano modelli utili, per quanto ci sforzassimo di adattarci alla curva. Fortunatamente, |
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Possiamo usare l'esploratore di dati funzionale, che... usa spline, che sono molto più flessibili. E quando lo abbiamo fatto, |
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Le spline P hanno funzionato benissimo per l'adattamento delle curve. E poi ho applicato l'analisi DOE funzionale a quelle spline P. |
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ha portato a modelli che si sono rivelati davvero validi sia nei grafici effettivi che in quelli previsti. E alla fine abbiamo ottenuto un profiler DOE funzionale che ha svolto un buon lavoro e ha prodotto risultati credibili, anche ai margini dello spazio di progettazione. |
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Abbiamo quindi salvato la formula di previsione e ho creato un profiler per queste quattro risposte, per poi inviarlo a Brian, che ora ci racconterà cosa è riuscito a farne. |
| Brian T |
Grazie, Chris, per la dimostrazione e per aver evidenziato le sfide affrontate lungo il percorso. Abbiamo ancora del lavoro da fare per capire quale sia il metodo più efficace per selezionare il modello di curva più adatto quando ci sono diversi candidati ugualmente validi. |
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Chris è arrivato allo stesso modello logistico a tre P per il prodotto, l'imp del prodotto, un esponenziale a tre P per il materiale di partenza e uno spline p dell'esploratore di dati funzionali per l'imp del materiale di partenza. |
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Diamo un'occhiata al prodotto. Ci sono due buoni candidati modello, quindi quale scegliere? Ecco alcuni punti emersi quando ho parlato con l'esperto in materia. |
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L'esponenziale 3P è paragonabile all'equazione cinetica del primo ordine, ma le forme del profilo di reazione sono sigmoidi, il che suggerisce un comportamento più complesso della cinetica del primo ordine. |
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La 3P logistica è forse più appropriata, poiché approssima meglio la caratteristica della curva sigmoide. |
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Ma in futuro, prova a prelevare più campioni subito dopo il tempo zero per vedere se questo aiuta a distinguere meglio la bontà delle due formule nell'approssimare le curve di profilo tra il comportamento del primo ordine e quello sigmoide. Quindi non è semplice. |
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Ora, per il materiale di partenza imp, dove è stata inserita la spline p dell'FDE. Alcuni imp di materiale possono essere formati e consumati a velocità diverse, al punto che un percorso potrebbe essere disattivato. |
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I grafici a traliccio mostrano questo profilo, suggerendo che in alcuni esperimenti la formazione di improvvisi cambiamenti di materiale è appena iniziata, mentre in altri la formazione di improvvisi cambiamenti di materiale e il consumo sono già in corso. |
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Ci sono, di fatto, due curve da combinare ed esprimere in un'unica formula e nessuna delle formule precaricate è in grado di svolgere un lavoro adeguato. |
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L'adattamento della curva torna all'approccio FDE, quindi ci allontaniamo ulteriormente da un adattamento della curva guidato dal primo principio verso un adattamento puramente empirico per ottenere un buon adattamento del modello di approssimazione della curva. |
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Questa diapositiva evidenzia la curva di adattamento che forma una distribuzione predefinita del coefficiente del parametro logistico 3P, ovvero normale. |
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Ma questa è la più... ma è questa l'opzione più appropriata? Esistono distribuzioni con valori di R quadrato generalizzati migliori, quindi ecco alcune indicazioni su cui riflettere per il futuro. |
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JMP, in background, combina questi tre modelli di coefficienti dei parametri logistici adattati e li rappresenta nel profiler come risposte originali del DOE al variare dei fattori e al progredire della reazione nel tempo. Per ogni risposta viene creato un profiler. |
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Chris è riuscito a raggruppare questi quattro profiler di risposta in un unico grafico di profiler di gruppo. Questo è importante perché dobbiamo capire quale impatto abbia sulle altre risposte il tentativo di modificare i fattori per migliorare una risposta. |
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superiore al 95% e prodotto in...inferiore al 2%. |
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Prodotto e impatto prodotto sono stati considerati come risposte prioritarie e sono stati individuati modelli efficaci. Come si può osservare per il materiale di partenza e l'impatto del materiale di partenza, i modelli sono meno efficaci, producendo valori negativi non plausibili a livelli di fattore favorevoli per i valori target di prodotto e impatto prodotto. |
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Ciò che è chiaro è che il materiale di partenza, l'ammina, non influenza alcuna risposta. Presenta linee piatte, quindi non è rilevante nel controllo dei livelli di risposta. |
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La scelta di una base elevata riduce al minimo l'influenza del livello di solvente sulle prestazioni della reazione poiché aiuta ad appiattire le linee degli effetti del solvente. |
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Infatti, le condizioni per raggiungere i criteri target sia del prodotto che dell'impatto del prodotto sono limitate, a causa della sensibilità ai livelli di base e di catalizzatore. |
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Tuttavia, se troviamo condizioni fattoriali |
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che funzionano per quei due |
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criteri di risposta, allora esiste una finestra temporale di reazione. Anche in questo caso, si noterà che il profilo temporale del campione presenta una linea piatta. |
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Se ti mostro questo in JMP... Chris ha fornito gli script, questo è quello che ci interessa. |
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Quello che abbiamo qui, come ho detto, è il materiale di partenza che l'ammina non ha |
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un'influenza su questi numeri di risposta qui. |
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Modificandolo, i numeri di risposta non cambiano. Quindi è molto utile sapere che possiamo scegliere di impostare l'ammina a qualsiasi livello se c'è un altro motivo... un altro criterio di qualità di cui abbiamo bisogno per questa reazione. |
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La base, |
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ad alto livello, appiattisce le linee nere del solvente. |
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Come potete vedere, spostandoli verso la base più bassa, otteniamo pendenze e curve ripide. |
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Quindi, operando a una base più alta, minimizziamo l'influenza del solvente. |
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Ora, se guardiamo...queste sono le due zone ombreggiate realmente interessanti che stiamo cercando, e puoi vedere, per entrambe |
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catalizzatore e base, non c'è molto dei loro profili che si trovano |
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all'interno dell'area ombreggiata. Quindi ci sta dicendo che ci sono solo alcune... piccole aree di livelli fattoriali in cui rispetteremo i criteri target. E questo è particolarmente sensibile per la base; penso che possiamo ridurlo solo di circa un decimo o due. |
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finché non andiamo oltre l'imp del prodotto. |
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È un po' di più |
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per il catalizzatore, un paio di decimi. |
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Ma la sfida è cambiare entrambi allo stesso tempo, e la combinazione è molto limitata. Quello che si vede è che, se si trovano condizioni che funzionano, allora abbiamo |
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una finestra temporale molto ampia in cui la reazione rimane stabile entro i criteri di risposta accettabili, quindi qui si va da 300 a |
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poco meno di mezz'ora. |
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Bene, riassumiamo. Questa presentazione riguarda il nostro lavoro per creare un flusso di lavoro di analisi. La nostra esperienza ci ha portato a individuare opportunità di miglioramento o domande a cui rispondere, che sono state affrontate durante la presentazione, in particolare per quanto riguarda un miglioramento nella fase di analisi delle formule precaricate. |
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Ecco i miglioramenti per la fase di analisi della curva DOE. |
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Quindi, come sintesi finale, viene delineato un approccio di analisi in due fasi per l'analisi DOE dei profili di reazione. |
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Esiste la possibilità di integrare la conoscenza della materia nell'approccio analitico. |
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L'interazione dei fattori che influenzano le risposte nel tempo è complessa e un'immagine visiva è essenziale per comprendere come si comporta la loro reazione. |
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L'approccio ha del potenziale, ma è incompleto. L'utilizzo delle funzionalità disponibili di JMP ha evidenziato una lista di funzionalità aggiuntive che desideravo aggiungere e Chris ha scoperto alcune aree tecniche che necessitavano di ulteriore lavoro. |
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A livello personale, la collaborazione è stata immensamente gratificante e vorrei ringraziare Chris per tutti i suoi sforzi nel supportare il lavoro. |
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E infine, vorrei ringraziare alcuni colleghi di |
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AstraZeneca. Il loro lavoro è invisibile ma hanno |
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ha dato un grande contributo a questo discorso. |
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Grazie. |
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cioè. |
| Pietro Polito |
Perfetto Brian, ottimo lavoro. |
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Ok, va bene, come ti senti? |
| Brian T |
Sì, penso che sia andata bene. |
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Probabilmente è un po' macchinoso provare a lavorare partendo da uno. |
| Pietro Polito |
va bene. |
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ci siamo passati tutti, no, ho pensato che le transizioni fossero buone e hai parlato in modo molto chiaro e deliberato e penso che sia quello che hai fatto, è anche molto bello. |
| Brian T |
Grazie, no, grazie mille, va bene, non ho bisogno di altro, ti farò sapere di nuovo che hai ricevuto l'approvazione preliminare, ma ho bisogno dell'approvazione finale prima che vengano resi pubblici e di contattarti prima che ciò accada, sì, mostrandoli. |
| Pietro Polito |
Qualunque altra cosa. |
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Puoi contattarmi. |
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Puoi contattarmi. |
| Brian T |
Fantastico, e posso anche procurarmi una copia della registrazione? È semplicemente. |
| Pietro Polito |
Ehm, sì, penso che probabilmente la cosa più semplice da fare, una volta che il contenuto è pubblico, è semplicemente scaricarne una copia, se si desidera qualcosa prima di allora. |
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Lo invierò al team del Discovery Summit, che probabilmente effettuerà qualche ritaglio e... |
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Un po' di editing e quant'altro, e poi. |
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Se desideri quella versione, probabilmente Tony può fornirti un link. |
| Brian T |
Okay, è perfetto, davvero geniale. Ti ringrazio per aver perseverato nell'ottenere il. |
| Pietro Polito |
Sì, mi dispiace per il contrattempo. |
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Chissà se domani riceverai 10 email da te stesso. |
| Brian T |
Oh, ne ho sempre contattati alcuni in giro per cercare di contattarli, perché ovviamente me ne sono reso conto solo stamattina. |
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Che per te è proprio nel cuore della notte. |
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Che conversazione instancabile, hai appena iniziato a lavorare. |
| Pietro Polito |
Sì, nessun problema e alla fine tutto si è risolto. |
| Brian T |
Sì, va bene, per me va bene. |
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moltissimo. |
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saluti, arrivederci. |
