扬声器 | 脚本 |
| 彼得·波利托 | 你好,斯坦,你在吗? |
| 嘿,彼得。 |
| 彼得·波利托 | 你好吗。 |
| 我很好。 |
| 精彩的。 |
| 彼得·波利托 | 您今天做摘要感觉怎么样? |
| 是的,我感觉很好。 |
| 好吧,我觉得我不想再练习一周了。 |
| 彼得·波利托 | 现在确定了。 |
| 我一直认为完美是优秀的敌人。 |
| 是的,你是对的,是的,我点击了错误的链接。 |
| 哦,对此我很抱歉,是的,可以点击进入我正在录制的空间。 |
| 彼得·波利托 | 啊,我明白了。 |
| 你在哪里我们就在哪里。 |
| 彼得·波利托 | 很抱歉。 |
| 好吧,让我停下来。 |
| 在我们开始之前,您需要确认一些事情,而查看 Excel 文件并认为它会在 JMP 中是没有帮助的。 |
| 请稍等一下,你今天过得怎么样? |
| 到目前为止,一切都很好。 |
| 彼得·波利托 | 太好了,您是从哪里打来的? |
| 我是从印第安纳州的杰斐逊维尔打来的,它就在肯塔基州路易斯维尔的河对岸。 |
| 彼得·波利托 | 好的,我将于 11 月去列克星敦并居住。 |
| 哦,确实,这是参加其中一次会议。 |
| 彼得·波利托 | 知道这是我的荣幸。 |
| 姐夫40岁生日还有一堆。 |
| 大家要聚在一起品尝威士忌。 |
| 很好,他们现在有了波旁小道,你要去吗? |
| 彼得·波利托 | 这正是我们正在做的事情。 |
| 好的,斯坦,稍等片刻。 |
| 好的,当你完成后告诉我,我会给你我的手机号码。 |
| 彼得·波利托 | 好的,我们正在看。 |
| 心力衰竭患者的生存预测或您的其他摘要。 |
| 不,那是心力衰竭。 |
| 彼得·波利托 | 好的,标题只是使用 JMP 从有限的临床实验室数据中确认心力衰竭患者的生存预测。 |
| 就是这样。 |
| 彼得·波利托 | 好的,我必须在这里处理一些事情。 |
| 您没有正确的共同主持人。 |
| 正确,然后我需要口头确认这一点,您明白这是为 JMP 发现峰会会议录制的,并将在 JMP 用户社区中公开,您是否允许此录制及其使用。 |
| 我很好,非常感谢,你很好。 |
| 你能说几句话吗,我只是想确保音频传输清晰。 |
| 好的,嗯,让我先开始吧,我的名字是 itch 的斯坦·萨兰,我是 crucial connection llc 的首席分析师。 |
| 我位于印第安纳州的杰斐逊维尔,与著名的肯塔基州路易斯维尔隔俄亥俄河相望,今天我要和大家讨论心力衰竭预测。 |
| 彼得·波利托 | 非常好,声音很清晰。 |
| 好的。 |
| 彼得·波利托 | 让我来解释一下,我们需要做一些事情,以便视觉效果清晰地呈现,我们需要检查您的显示器是否在使用 Windows 机器。 |
| 我在一台 Windows 10 机器上,我将使用外置显示器来工作。 |
| 彼得·波利托 | 好的,如果您可以直接前往底部的搜索栏并输入显示。 |
| 搜索栏在最下方哦。 |
| 彼得·波利托 | 是的,如果您介意在您执行此操作时分享您的屏幕,我可以。 |
| 检查一下,是的。 |
| 是的,这个遇到了一些麻烦,不用说了。 |
| 我们共享屏幕,但我时不时就会丢失我的屏幕共享。 |
| 彼得·波利托 | 哦,你可以检查一下。 |
| 好的。 |
| 彼得·波利托 | 因此,在底部您会看到共享屏幕按钮哦,很抱歉,这是在我父亲身上。 |
| 好的,是的,点击放大镜。 |
| 并在显示中输入。 |
| 好的。 |
| 在哪里。 |
| 彼得·波利托 | 您可以直接开始输入,因为光标已经在原位。 |
| 噢,就在那儿。 |
| 彼得·波利托 | 哦,我想当您再试一次时您不会想按回车键。 |
| 好的。 |
| 彼得·波利托 | 所以去改变分辨率。 |
| 以及微软管理层。 |
| 彼得·波利托 | 说哦,你知道我敢打赌,它在你的另一台显示器上。 |
| 是的,它在我的另一台显示器上。 |
| 彼得·波利托 | 好的,您介意将其拖到这个吗? |
| 好的。 |
| 是的。 |
| 彼得·波利托 | 我暂时看不到它,我只能看到您的浏览器窗口。 |
| 就是这样。 |
| 彼得·波利托 | 因为他說。 |
| 是的,我们遇到了同样的问题。 |
| 彼得·波利托 | 那么您是否共享了整个屏幕,还是仅共享了一个。 |
| 窗口,我以为,一个共享整个屏幕的。 |
| 新分享。 |
| 问题是很多时候它会掩盖我的。 |
| 缩放会议的控制栏。 |
| 啊。 |
| 这就是我为何尝试这样做。 |
| 你能看到它的调度吗?也许看看它是怎么进入那里的。 |
| 彼得·波利托 | 我所看到的就是日程安排变得简单了。 |
| 是的,免费。 |
| 我可能正在考虑我的观点。 |
| 是的。 |
| 彼得·波利托 | 在我们开始之前,我们无论如何都要关闭 Outlook。 |
| 是的,是的,现在我们已经连接好了,我不需要任何额外的窗口,让我关闭,我打开所有的窗口。 |
| 好的,我们开始吧。 |
| 这就是我所需要的。 |
| 我将屏幕分享到新共享。 |
| 让我把它拖过来。 |
| 在这里,当我点击一个新的分享按钮时。 |
| 您看到的是我的桌面。 |
| 彼得·波利托 | 我看到一个绿色的帐篷。 |
| 带着美丽。 |
| 银河中的夕阳。 |
| 方式,是的,是的,让我来。 |
| 返回此处再次显示所有搜索内容。 |
| 您看到了我的搜索栏。 |
| 是的。 |
| 彼得·波利托 | 然后单击“更改显示器的分辨率”,然后选择“向下”。 |
| 好的。 |
| 彼得·波利托 | 现在,您已经到达 1920 年,但那没关系,非常完美,这正是我们想要的。 |
| 好的,然后你可以去关闭它。 |
| 好的。 |
| 彼得·波利托 | 然后右键单击底部的任务栏。 |
| 并转到任务栏设置。 |
| 点击它。 |
| 是的。 |
| 彼得·波利托 | 是的。 |
| 好的。 |
| 彼得·波利托 | 因此,这是第二个选项。 |
| 在那里自动进行测试,我们走吧。 |
| 好的,这里还有什么吗? |
| 一。 |
| 彼得·波利托 | 可以去关闭它。 |
| 然后我们要做的最后一件事就是下去。 |
| 你喜欢嗎。 |
| 通知标签或任何内容,以确保任何可能弹出的内容都已关闭。 |
| 是的,我登录之前关闭了所有内容。 |
| 好的,唯一的问题是我的控制栏仍然在我的笔记本电脑显示器上,而我仍然在看 yelp 板显示器上的测试栏,而这正是我想要演示的。 |
| 彼得·波利托 | 好吧,一个。 |
| 让我们回到那里看看它是否会自动改变。 |
| 好的,也许我只需要尝试单击桌面,也许这样就可以让它消失。 |
| 是的,我们走了。 |
| 我们去了那里,我们去了那里。 |
| 彼得·波利托 | 好的,所以一旦我们。 |
| 我们现在正在记录。 |
| 现在我要小心这一点。 |
| 彼得·波利托 | 是的,如果是的话。 |
| 如果它出现,那也并不是世界末日。 |
| 好的。 |
| 彼得·波利托 | 你会。 |
| 想要。 |
| 一旦你开始演讲,我就会静音,我的相机会关闭,我会变成一个鬼魂,你会认为你不仅仅是在自言自语。 |
| 如果你。 |
| 感觉就像你刚刚制造了一些灾难性的空气并且你想要从头开始,不幸的是这完全没问题。 |
| 他们让我们这样做的方式是,如果您在那里,我们实际上无法在中间编辑某些内容,基本上我们必须一次性完成,如果在将来,您完成了这个,然后您意识到哦,我真的想说这个,而不是那个。 |
| 当这些真正呈现时。 |
| 你可以选择直播,所以我们可以随时暂停视频,然后你可以说,好吧,你知道我在这里说错了,我真正想要传达的是 X、Y 或 Z,你将有机会实时地了解。 |
| 把事情说清楚,比如,如果你意识到明天或后天什么的,但如果你此刻觉得我想以完全不同的方式来表达,我们可以重新开始。 |
| 好的,希望我们不必这样做,我和莎伦无法说明,尼克立刻停了下来,我要求他们立刻停下来。 |
| 你知道,那部分内容会被编辑掉。 |
| 彼得·波利托 | 嗯,是的。 |
| 好的。 |
| 好的。 |
| 好的,我将把它交给负责制作此产品的同事继续进行这项工作。 |
| 为了您,让我们暂时暂停录音。 |
| 好的。 |
| 彼得·波利托 | 好的,我要关掉我的视频。 |
| 一秒钟。 |
| 在我们开始之前,我想检查一下屏幕共享。 |
| 完美好吧。 |
| 现在我想要调出任务栏。 |
| 彼得·波利托 | 不,没关系,没关系。 |
| 好的,问题是我们只想要最大值。 |
| 是啊是啊,好的。 |
| 彼得·波利托 | 平方英寸。 |
| 好的,这是我在周二和上周遇到的另一件事,当时我假装研究三角分析师,这有点像故事,但我不会不进行演示模式。 |
| 彼得·波利托 | 好的,没问题。 |
| 好的,我有这个,让我们看看你是否在那里看到我的 PowerPoint。 |
| 彼得·波利托 | 我确实看到了您的 PowerPoint。 |
| 好的,现在我过来怎么样? |
| 彼得·波利托 | 我看到了我的屏幕。 |
| 超级让我关闭这个并打开另一个工作屏幕。 |
| 快点。 |
| 你看,这是一个新的 JMP 屏幕。 |
| 脚本和脚本窗口。 |
| 我愿意。 |
| 好的,是的,演示进行到一半时我停止了分享,然后我不得不停止分享,然后重新分享,希望如此。 |
| 彼得·波利托 | 好的。 |
| 没关系,我现在要将麦克风静音。 |
| 你呢。 |
| 只要你做得对,祝你好运。 |
| 好的,谢谢。 |
| 大家早上好、下午好、晚上好。我叫斯坦·西拉诺维奇。我是 Crucial Connection LLC 的首席分析师。 |
| 我们的公司位于印第安纳州杰弗逊维尔,与历史悠久的肯塔基州路易斯维尔隔俄亥俄河相望。 |
| 正如您所看到的,今天我将在屏幕上与您讨论使用 JMP Pro 16 根据有限的临床实验室数据对心力衰竭患者的生存进行预测。 |
| 现在这些是什么, |
| 是医疗记录的集合。确切地说,是 299 份心力衰竭患者的医疗记录。这些记录是在 [听不清] 心脏病研究所和 [听不清] 收集的。 |
| [听不清] 巴基斯坦。这些资料收集于 2015 年 4 月至 12 月之间。现在,这些资料已经出版, |
| 最初由两位作者 Chicco 和 Jurman 于 2020 年在 BMC 医学信息学和决策制定杂志第 20 卷上发表。 |
| 作者想要做的是创建一个模型来评估因心力衰竭死亡的可能性。 |
| 而且该模型必须是相对简单的模型,希望能被医院和医生用来评估心血管疾病的各种严重程度。 |
| 现在他们稍微回顾一下历史,我也将这样做,但非常简短地说明这样做的原因,作者注意到了这一点。 |
| 他们所观察的数据以及从这些数据中得出的模型的可重复性都是最低的,而且在前五或前六名中也有许多不同的因素。 |
| 用于预测心力衰竭,但有两个指标不断出现,分别是射血量和肌酐。我要回顾一下 |
| 一旦开始分析,我们只需一两分钟就能知道这些是什么。现在作者们所做的是使用 10 种不同的先进机器学习方法来预测心力衰竭。 |
| 所以他们运行了 10 个机器学习脚本。他们使用了随机森林决策树、梯度提升,这些都是正常的。对不起。他们所做的是在七个不同的机器学习上对它们进行了评估 |
| 指标。他们发现,血清肌酐和射血量是重要的变量,这并不令人意外。他们设法排除了所有其他变量。 |
| 而当我们在 JMP Pro 16 中进行分析时,情况并非如此。因此,我们将对此进行研究,我将稍微讨论一下变量年龄,但是, |
| 在我们这样做之前,让我先提出一下 JMP。 |
| 这是我们要使用的 JMP 数据表。 |
| 如果您不熟悉 JMP,请让我在这里简单介绍一下,我的光标位于脚本窗口。后面是列窗口。您可以看到,我们有 13 列,但未选择任何内容,这是行窗口,有 299 行。 |
| 虽然我下载了。它的工作方式是我去了 Kaggle。他们将所有内容发布到 Kaggle, |
| 供其他人练习。在随后的几年里,一些州把它放在那里,有 177 份单独的提交。它们都是开源的,我看过的十几个都是 |
| 就像我们通常认为的那样,JMP 是两个最受欢迎的开源平台。他们还将原始分析放在那里,也就是用 R 统计编程语言完成的分析,并将所有代码发布到 GITHUB。那么,让我们看看我们能用 JMP 做什么。 |
| 现在,让我们回顾一下之前提到的变量。首先,我们有肌酸磷酸激酶。这是一种酶。 |
| 这是肌肉损伤的指标。我们还有血清肌酐,这是一种血液中的化学物质。 |
| 它是肌肉损伤和肾衰竭的指标,我们在这里讨论的是肌肉损伤,我们正在考虑心力衰竭。 |
| 我们还测量了射血分数,即离开心脏的血液百分比,必须加载的血液百分比是心肌损伤的指标。我们还测量了血清钠, |
| 这是血液检查的常规测量。这里的数值很低,可能是心力衰竭的征兆。 |
| 我们还应该注意到,我们拥有一个可以称为平衡的数据集。也就是说, |
| 我们有一个……嗯,不应该称之为阳性……32% 的病例死亡,68% 的病例存活。所以是的,一到两个 |
| 我们有三分之一的人患有心力衰竭,现在有三分之二的人患有心力衰竭。我们还应该提到,我们这里的数据集相对较小。 |
| 299 行。对于心脏记录来说太小了。那么让我们开始分析,让我调出另一个 JMP 数据表。 |
| 这就是这个数据表,让我把它删除。我会把它拖到另一个屏幕上。 |
| 好的,我们正在查看数据表,我已经做了一些工作,我重新排列了一些内容,您会注意到下面, |
| 贫血、糖尿病、高血压、性行为和吸烟。当我最初将其导入 JMP 时,它给出了连续 |
| 分布或连续 |
| 数据类型,我所做的就是改变它们。例如,如果你过来这里看看贫血,或者更好的是高血压。 |
| 高血压 - 我们有 0 和 1,他们并没有真正说明临界值在哪里,如果这里有一些连续的数据就好了 |
| 收缩压和舒张压。事实并非如此。这就是我们必须处理的,我改变了所有这些。你还会看到血小板 |
| 被隐藏。 |
| 而且,那是因为我已经隐藏和排除了,我应该说,那是因为我必须清理它们,而且还有另一件事我想做。 |
| 并且,向您展示如何故意这样做,没有这样做,我去这里年龄,我要隐藏它。 |
| 而且,我还要将它排除在外,也就是说,它从图形中隐藏起来,无法查看,它将被排除在任何计算之外,以防我不小心将它与其他东西拖在一起,稍后我会解释这样做的原因。所以, |
| 我们要做的是稍微不同的事情。对不起,我要先进行分析,然后等分析完成后,我会回过头来做一些清理工作,我会边做边解释。 |
| 所以我们来到这里 |
| 分析 |
| 和 |
| 继续讲其他内容。好的,顺便说一下,PowerPoint 演示文稿将发布在 Discovery Summit 网站上,我在其中提供了一些屏幕截图和一些说明,以便您可以自己跟进。 |
| 所以,我要做的第一件事就是进入“分析”菜单,单击它,然后进入“预测模型”。 |
| 这里有很多选择,包括模型比较和模型筛选。这里说的是模型筛选——“适合许多不同的预测模型,以便您可以选择最佳模型。” |
| 所以,这听起来就像我们想要做的,我们想要并行 |
| 原始分析。我们得到这个窗口,如果你注意到左边这里,我们有一个框 |
| 它里面有一些复选框,它告诉我们要运行哪些模型,这都是默认的。 |
| 例如,它会运行决策树、引导森林、提升树、拟合最小二乘法等所有这类东西。这些都是我们最喜欢的。里面有 11 个,JMP 会自动执行。所以,DEATH_EVENT, |
| 这就是我的 Y 响应。我要做的就是 |
| 单击拖动选择此处的所有变量,然后我将把它们作为 X 因子放入。 |
| 我将单击“确定”。 |
| 我们坐下来让 JMP 发挥作用。 |
| 就这样。这是我们得到的结果。 |
| 所以让我们从这个开始。以下是细节。我们可以看到各种 |
| 如果我们点击这个灰色三角形,就会看到我们正在运行的分析。 |
| 我们可以看到更多详细信息,窗口中显示的详细信息取决于特定的分析,然后是运行。如果我们想进一步了解,当然,我们可以点击红色热点,我们还有一些其他选择。 |
| 这就是我们在这里看到的,当它这样做时,它还会打开这个标记为训练的框。这是将所有数据作为训练集运行的结果。换句话说,没有任何训练。 |
| 没有任何测试集。抱歉,有一个训练集,但没有测试集。而且,没有任何验证集,那是因为我们没有做任何选择。 |
| 这只是筛选,它告诉我们哪个在训练中取得了最好的结果。好的,我们在这里看到列数,所以让我们 |
| 简单看一下。熵 R 平方是 |
| 只是一个 R 平方, |
| 嗯,这是一个与拟合模型的对数似然进行比较的测量方法,所以它是对数值。 |
| 我们有错误计算率,这里的曲线下面积,显然越高越好。 |
| 我们得到了 RASE,即预测率的平方均值根。所以,这是 1 和 p 概率之间的差值。 |
| 这是 JMP 得出的模型的拟合概率。我们有广义 R 平方,也就是大家所认为的 R 平方。它是 |
| 测量...它应用于回归模型,如果我们得到完美拟合,我们得到 1,如果我们不拟合,我们得到 0。它们在这里排名,所以她 Bootstrap Forest 排在首位。 |
| 让我们看看我还想说什么,请查看我的笔记。 |
| 我想就这样了,我们可以 |
| 再次上来 |
| 打开 Bootstrap Forest 并检查结果,我们可以看到下面训练集的混淆矩阵。它给了我们 |
| 这里的训练数据和我们看到的数据相同,但这仅用于引导森林,这里有我们预测计数的混淆矩阵。 |
| 下面我们得到了 Bootstrap Forest 的预测率。如果你不熟悉这个,或者你的记忆有点生疏,它的作用是向我们显示 |
| 死亡事件是实际死亡事件,其值为零,也就是说病人在这里活了下来,83, |
| 我们有死亡事件,其值为 1,这意味着患者没有存活下来。这是绝对计数,因此我们要查看从左上角到 |
| 右下角和从左下角到右上的对角线是错误的计数。因此,我们有 13 |
| 这里预测的存活时间,实际上并没有存活。而是死亡。第二个灰色框中,我们有相同的数据,但它处理的是死亡率。在我们的例子中,这是一个更好的衡量标准,因为我们的数据集确实不平衡,所以我将结束这个讨论。 |
| 接下来, |
| 我们要做的是进入分析和拟合模式。我们之所以要这样做,是因为我们要拟合一个回归模型,这对人们来说更容易理解,而且它会给我们 |
| 给我们机会展示 |
| 在 JMP 中交互的能力。所以我要做的是关闭它,然后我要到这里进行分析,在这里,我们 |
| 适合模型。 |
| 而且, |
| 我们知道现在的变量,首先让我来这里 |
| 会将 DEATH_EVENT 放入其中作为我们想要预测的内容。我们知道,我们看到肌酐,不,那是错误的。射血分数 |
| 它就在这里。 |
| 血清肌酐 |
| 是重要的变量。而且,年龄也出现在几项分析中。所以,如果我能找到的话,我会把它放进去。 |
| 不挂断。 |
| 让我重新开始,因为我遗漏了一些东西。 |
| 嘿,彼得,我们可以暂停一下吗? |
| 所以我要做的就是来这里分析一下, |
| 拟合模型。并且,Y 将是 DEATH_EVENT。 |
| 我要做的是,由于许多模型都发现年龄是一个重要变量,所以我要添加年龄。而且,我要输入 |
| 射血分数和血清肌酐。 |
| 现在作者没有发现年龄是一个重要变量,但我发现了,所以我认为其中可能存在相互作用,而 JMP 可以让我们非常轻松地处理这个问题。所以我点击年龄 |
| 和射血分数,而不是单击“添加”, |
| 我来到这里 |
| 单击“叉号”,我将转到年龄。 |
| 和 |
| 血清肌酐。 |
| 这就是控制点击。 |
| 我们将添加它,这样我们就得到了。 |
| 年龄、射血分数,等等。 |
| 我认为那只是手指太粗而已。 |
| 就这样。 |
| 现在它就在那里,所以它有两个交互,我们可以看到它在这里为我们提供了个性的选择。我们要做的就是接受默认设置,即名义逻辑。 |
| 我们这里还有其他一些选择,但我们会坚持下去。 |
| 然后我将点击运行。 |
| 这就是我们得到的结果。 |
| 好的。 |
| 我们必须在这里记录价值,它基本上是负数。 |
| 以 10 为底对数。我们这样做的原因是,这样更容易操作,对不起,更容易绘制图表,也更容易让人理解。所以,我们在列表中看到了数字 1。 |
| 是射血分数,抱歉,这是作者发现的。排名第二的是血清肌酐,但年龄仍排在第三位,而且非常重要。 |
| 我们观察了 |
| 相互作用,我们发现它们并不显著。顺便说一下,这里的蓝线表示 2 的值。是 2。 |
| 他们把它放进去只是为了更容易看。我选择 2 的原因是它是 .01 的对数,这是 JMP 默认选择的显著性水平。 |
| 但是我们来到这里,我们可以看到对数值或值和回归方程会相对较低,但我们在这里,0.05 可能在很多实验设计中被截断。它可能在很多实验设计中被截断。 |
| 分析工作所以我们会注意到这一点,即使我们在这里忽略它,因为它没有超过我们的 .01 的限制。 |
| 这可能引起临床医生的兴趣。这可能会给他们带来一些值得关注的东西,而且很可能在不同的数据集中具有重要意义。而且,我们这里有所有常用的数据。让我们看看我们能看什么,让我向下滚动好吗。 |
| 我们有卡方概率,我不会深入讨论,这里有估计值,也就是回归方程的系数。 |
| 这就是我们的发现。 |
| 所以让我尽量减少这种情况,我们现在要继续清理和探索,我这样做的原因,没有先清理,是因为在原始文章中,没有提到任何 |
| 清理和数据处理之类的工作。他们只是获取数据并在其上运行模型。 |
| 我喜欢先查看我的数据。那么,让我们来看看这里的几个事情。首先,如果我们来到这里, |
| 点击那个小图标,我们可以显示标题图表。我喜欢这样做。所以,让我们点击这里的 1,也就是 |
| 积极死亡事件,如果我可以使用这些术语的话。 |
| 这样做的目的是突出显示死亡事件为 1 的所有行。如果我们想仔细看看它,我们可以看看它是否与其他可能出现的变量存在任何关联,但那里并没有太多关联。 |
| 我的窗口,但我们注意到一件事,我们的分布非常非常不平衡 |
| 肌酐磷酸激酶和血清肌酐看起来有点奇怪。没有别的了,我们可以清除这些 |
| 点击图表中的任意位置,顺便说一句,如果你不熟悉,这些事情是 |
| 如果我们想扩展任何东西,就可以拖动。 |
| 现在让我们从那里转到图形生成器。 |
| 让我们来看看。 |
| 我会告诉你,因为我们关心的是选择该列,即肌酸酐磷酸激酶并按住 Shift 键点击。 |
| 检测血清肌酐,哦,我差点忘了 |
| 让我们右击 |
| 我们可以从这里直接进入分布,这与进入图形和分布时得到的结果相同。我们可以看到,两者的分布都高度倾斜。 |
| 这里有很多异常值,只是分位数,我会结束这个讨论。让我结束这个讨论。我们真的不需要它。 |
| 让我们看一下汇总统计。 |
| 我们来看看肌酸酐磷酸激酶,我们得到平均值 581,标准差为 970。这有点奇怪。这显然与理想情况相差甚远,而对于血清肌酸酐,我的意思是我们有一个平均值 |
| 我称其为 1.4,标准差为 1.0。所以这也不是理想的情况。它还为我们提供了其他一些信息,如果在这张图上看得有点困难,但如果你不 |
| 习惯于快速查看箱线图,晶须是四分位距的 1.5 倍,四分位距是第 25 个百分位数(箱线的底部)与第 75 个百分位数(箱线的顶部)之间的差值。 |
| 菱形表示平均值,直线表示中位数。为了更清楚地说明这一点,我可以将其展开,这样您就可以更清楚地看到,那里有很多异常值。 |
| 所以, |
| 请记住,血清肌酐是我们非常强的预测变量之一。我们还可以更详细地研究一下 |
| 通过进入 Graph Builder。 |
| 因此让我们进入图形、图形生成器。 |
| 这就是我们得到的窗口。 |
| 嗯,我们从研究中得知 |
| 一些主题知识,即使不是主题专业知识,肌酸磷酸激酶是由身体不断产生的。它对 |
| 它是血清肌酐的前体,所以两者之间可能存在某种关系,我们还想研究一下那些不太令人满意的分布。这里是肌酐磷酸激酶。 |
| 我们只需单击此处即可将其放在 X 轴上。 |
| 我们对 Y 轴上的血清肌酐进行同样的操作,结果如下。我们注意到 Y 轴上的血清肌酐从 0 变为 10,而 |
| 肌酸磷酸激酶,伙计,它在这里走得很远 |
| 几乎达到 8000。现在我们可以做一件事。 |
| 是点击拖动,我们可以将其扩展一点。但是,我们还可以做另一件事 |
| 双击我们的轴,我们就会得到这个窗口,我不会详细介绍这一点,但我们来到这里查看比例,一旦超过 8000,就会看到最大值。并且,通过查看下面的图表,让我将其拖出。 |
| 当然,我们的肌酸磷酸激酶大多数值都小于 1000。事实上,看起来其中很大一部分可能小于五六百。 |
| 所以, |
| 我没必要这么做。 |
| 将其更改为 |
| 我们就选800吧。 |
| 好的。 |
| 这样我们就得到了一张只包含这些数据点的图表。我们把其他数据点都去掉,结果发现它基本上是一条直线。它们之间没有真正的关系,而且这里也有一些离群值 |
| 血清肌酐,在这里高达 10。这看起来像是通过否定价值来体现的,所以我们可能需要回过头来再看看这些,也许可以摆脱一些异常值,看看我们是否进入并得到不同的结果。 |
| 这就是全部了,让我尽量简化这一点。 |
| 最后再看一下数据集。 |
| 哦,是的,血清肌酐。 |
| 我们把它作为一个连续的,但如果你看一下这里的列,我们的最小计数在这里,在小数点后一位,所以我们有可能有 10 个值,再加上另外 10 个值,其中大多数 |
| 看起来它们不到 2 或 3。因此,根据分析,我们可能会有一些关于如何处理这个问题的问题。 |
| 我们当然希望从分析中得到结果。我们将使用它。我们真的想把它看作一个连续变量吗?或者我们应该把它看作一个序数变量,也许, |
| 我不知道, |
| 序数变量有 20 个不同的值。20 或 25 或其他值,这在营销分析中很常见,但这里通常不这样做,但这是值得考虑的。所以,让我 |
| 回到这里查看摘要。返回 PowerPoint。 |
| 让我扩展一下,希望每个人都能看到,这就是我们所拥有的。 |
| 我们有 11 种不同的模型,这些模型是 JMP 默认选择的,我们得到了这 11 种不同的模型,只需转到“分析”、“预测建模”、“模型筛选”即可将它们全部带入。我们发现血清肌酐、年龄和射血分数都很重要。 |
| 我们发现年龄与射血分数之间的相互作用可能值得进一步的临床研究,尽管这对我们的研究来说并不重要 |
| 决定了值。而且,我们看到了一些高度倾斜的值,尤其是在肌酐分布中,这是我们在模型中使用的,并且数据集相当小且不平衡。现在我之前提到了年龄。让我回到原文。 |
| 把它拖走。这是年龄。 |
| 我们看到,我们的分布有些偏斜,我没有将其放入模型中,而我没有将其放入模型中的原因是数据收集的方式。 |
| 我们从文章中得知,当时的做法是,他们派一些医护人员去检查人们的情况。 |
| 原始数据是为研究而开发的。所以,当你看到 65 年时,他们回溯了 65 个月之后的数据。 |
| 哦,抱歉,我说的不是那个年龄,让我回到这里。转到那个我取消隐藏的时间。 |
| 还有时间。有点奇怪,让我稍微拉一下。 |
| 他们做了什么 |
| 他们在最初的研究之后回过头来。所以,当你看到 16 年时,他们在最初的研究之后 16 个月回过头来检查是否有死亡事件或没有死亡事件。也就是说,病人还活着还是已经不在了。 |
| 16个月后,这位第21号病人 |
| 还活着。现在,如果我们来谈谈死亡事件,让我强调一下。 |
| 然后过来。 |
| 我们看到时间是 20。 |
| 嗯,我们不知道死亡事件是否发生在前一天,他们检查了一周前、一个月前或两个月前的情况。发表论文并将其发布在 Kaggle 上的原作者确实查看了这些数据。 |
| 他们没有从中得出任何积极的结论。那个人可能在第一个月就死了,但没有人在第一个月检查。 |
| 我们不知道后续检查的频率。所以我才添加并包括了这一点,如果我们有更好的数据,我们就可以在这里进行分析, |
| 可靠性和生存力,我们可以做一个寿命分布或按X拟合寿命,这是很多方法都可以做到的,但在这个特殊情况下我们无法做到这一点。 |
| 所以基本上 |
| 演示结束后,我想回到 PowerPoint 演示文稿,它将再次发布在网站上,这里是原始期刊文章的链接。 |
| Kaggle。 |
| 页。Kaggle 数据集是 CSV, |
| 作者的 Github 存储库中包含 R 代码。希望大家喜欢。 |
| 就这样 |
| 我们将结束本次演讲。 |
| 彼得·波利托 | 现在的好工作非常有趣。 |
| 谢谢。 |
| 彼得·波利托 | 好的,那么,让我检查一下我的清单。 |
| 当然。 |
| 彼得·波利托 | 我不是。 |
| 我不相信有经纪人的时间。 |
| 拜托,拜托,把它抓住了。 |
| 彼得·波利托 | 是的,如果他们回来并说哦,我们不喜欢暂停,我们会做的是,当你还活着的时候,你可以和主持人交谈,你可以跳过那部分,只说这是发生的事情。 |
| 好的。 |
| 我认为他们不会要求我们重新录制。 |
| 出色地。 |
| 好的,是的,如果他们这样做的话,就没有什么大问题。 |
| 彼得·波利托 | 好的,我正准备做其他所有事情。 |
| 一旦我们停止录音,我们就可以开始了。 |
| 又好。 |
| 彼得·波利托 | 非常好,谢谢你让我观看。 |
| 是的,它的优点是,尽管我遇到了一些小失误,但他没有任何麻烦和软件。 |
| 现在一切看起来都很棒,是的,是的,把所有东西都拖过来并留在那里,这样很好。 |
| 彼得·波利托 | 好的,很好。 |
| 我或许会在探索峰会上与你相遇,祝你度过愉快的一天。 |
| 好的,你也是剧院。 |
| 彼得·波利托 | 好的,再见,站。 |
| 经过。 |