Il y a
a
étrange
lieu
que
s'assoit
entre le analytique outils que toi serait utiliser à faire
analyse avec connu physique modèles et avec simple courbes
et le analyses que toi serait faire, dire, avec fonctionnel données explorateur,
où toi avoir familles de courbes que avoir complexe formes,
et tu es moins intéressé dans le réel physique nature de le formes eux-mêmes
comme toi sont dans juste relatif eux dos à observé phénomène.
Ce étrange,
Non l'homme atterrir de analyse dans JMP est où a parcelle de d'abord principes techniques s'asseoir.
Des choses comme X- rayon diffraction, des choses comme HPLC,
où nous avoir connu physique méthodes et connu équations que aidez-nous décrire
très fondamental phénomènes de a molécule ou cristal ou a système.
Tous nous avoir à faire est prise culminer postes dans
ou zone sous le courbe information dans
et nous peut obtenir quelques très sophistiqué analyses dehors de assez simple données points
parce que de ces d'abord principes méthodes.
À d'abord rougir, il serait sembler comme JMP devrait être capable à poignée que.
Il semble comme c'est a obtenu tous le outils mais,
quand nous toi dans faire ceux types de analyses nous soudainement réaliser que
t il problème est a peu plus complexe que quoi nous serait attendre.
Aujourd'hui quoi I vouloir à faire est se concentrer sur quelques techniques et stratégies
à accord avec quelques de ceux plus simple cas
et alors introduire quelques outils que nous peut utiliser
rationaliser ceux plus grand plus complexe problèmes.
Allons-y aller devant et allons se déplacer dans JMP et avoir a regarder à que.
À commencer désactivé, allons aller devant et avoir a regarder à a très simple cas,
a célibataire culminer sur a arrière-plan.
Comment serait nous aller devant et tirer le information dehors de ce culminer?
Comment serait nous obtenir c'est centre position?
Comment serait nous obtenir c'est complet largeur à moitié max ou c'est standard déviation
ou même le zone sous le courbe?
Comment serait nous obtenir que information?
Bien, la plupart de nous que avoir fait ce pour a alors que, nous serait dire,
Oh, toi savoir quoi, Je suis en allant à aller dans Courbe d'ajustement
et Je suis en allant à dire, voici mon et, et Je suis en allant à dire, voici mon x.
Alors Je suis en allant à aller devant et Je suis en allant à aller ajuster a culminer modèle de quelques gentil.
Allons-y juste dire le gaussien culminer et toi regarder à que et toi aller Hé,
98% R² , c'est génial, c'est super.
Allons-y voir si nous peut faire a petit mieux.
Juste à sauter devant juste a petit peu ici
nous pourrait regarder à le Lorentzien culminer forme et le gaussien culminer forme
et nous peut voir que ceux les deux donner assez bien R²,
ils donner assez bien culminer convient.
Nous pourrait même viens dans le valeurs
dessous chaque et nous peut tirer en haut le zone sous le courbe pour eux.
Mais comment bien sont ceux convient en fait?
Allons-y prendre a regarder à eux a différent chemin.
Quoi I vouloir à faire est prendre et Bien aller devant et tirer en haut graphique constructeur sur ces
et Bien regarder à comment le modèles se rapporter à le résidus pour ceux sommets.
Nous peut voir a très différent histoire
que quoi nous scie dans Courbe d'ajustement avec ces deux culminer formes.
Nous peut voir que il y a a systématique erreur construit dans ces culminer formes.
Le raison nous peut voir que avec le Gaussienne,
nous peut voir que c'est gentil de sous-estimer à le centre.
C'est faire d'accord sur le épaules, mais dehors dans le queues c'est vraiment manquant des choses.
Nous peut voir presque le inverse pour le Lorentzien.
Pourquoi donc?
Bien, le vérité est que dans spectroscopie particulièrement,
là sont a parcelle de différent culminer formes.
C'est pas juste Gaussienne, c'est pas juste Lorentzien.
Il y a en fait a entier famille de culminer formes que sont dehors là
à poignée tous le différent physique phénomènes
que résultat dans le pics que nous voir dans spectroscopie.
Comment faire nous accord avec ceux dans JMP?
Bien, c'est en fait vraiment assez facile.
Allons-y commencer avec regarder à
quoi le résultats de en utilisant le correct culminer forme est.
Ici J'ai a obtenu le gaussien encore, le résidus pour le gaussien culminer ajuster
et le bleu doubler dans ce cas est Non plus long le Lorentzien.
C'est appelé a Pseudo Voigt,
lequel est un approximation de a culminer forme appelé a voix fonction.
Avis que le résidus pour le Voigt fonction sont mort plat.
Nous sont en fait faire beaucoup mieux.
Avant, si nous étaient à essayer à faire
quantification avec le Lorentzien ou le Gaussienne,
nous serait courir dans a situation où nous pourrait sur ou sous-estimer
le quantité de a matériel dans a échantillon.
Avec le Voigt dans ce cas, parce que ce est a voix culminer forme,
étaient en fait en allant à obtenir le précis quantification de que.
C'est le important chose.
Maintenant comment a fait I faire ce?
Bien, il y a a peu manières à faire il.
Le le plus simple est à viens dans le modèle
viens dans le données tableau et créer a modèle.
Le modèle est vraiment facile à faire.
Ce est le voix culminer forme.
Apparence a petit effrayant, mais c'est juste le nature de le mathématiques.
Ici J'ai a obtenu a paramètre pour le ligne de base et ce entier désordre.
Ici est le voix culminer forme.
Nous peut viens dans le paramètres paramètres
et définir départ points pour chaque de notre valeurs.
Alors en allant dans
étaient pas en allant à utiliser Courbe d'ajustement, étaient en allant à viens vers le bas à non linéaire.
Nous peut utiliser que comme a départ indiquer pour un analyse.
Je suis en allant à développer dessous 40 minutes.
C'est en fait a bien habitude à obtenir dans dans ce cas.
I a fait que faux.
Allons-y aller dos et refaire que.
Devrait être le compte.
Là nous aller.
Que apparence mieux.
Maintenant si I aller devant et cliquez Aller,
il fait mon culminer convenable pour moi et tout.
C'est super.
Ne peut pas obtenir le zone sous le courbe ici très facilement.
Mais I peut obtenir juste à propos chaque autre paramètre que I besoin.
Le bon chose à propos a parcelle de ces culminer formes
est ils aussi avoir Bien défini intégrales.
Une fois toi avoir le standard déviation et le signifier et ceux information,
toi peut généralement obtenir le intégral assez facilement,
le zone sous le courbe assez facilement.
C'est un chemin de manutention que.
Mais il présente a grand montant de erreur possibilités dans ce culminer forme.
Nous avons donné nous-mêmes a parcelle de potentiel problèmes.
Quoi nous vraiment serait comme est quelque chose que apparence a peu plus comme ce,
où nous avons a obtenu a prédéfini fonction appelé le PseudoV oigt.
Nous donner il tous de notre convenable paramètres
et il y a notre convenable paramètre pour notre ligne de base.
C'est le même mathématiques,
mais nous masqué il dans un facile à comprendre fonction où nous sont juste
fournir le paramètres que nous vouloir à ajuster.
Il travaux le même dans non linéaire.
Comment faire I faire que?
Bien, là sont a peu des choses que nous peut faire.
Nous peut définir dans et il y a a parcelle de code droite ici.
Mais le grand des choses que nous vouloir à payer attention à
sont le fait que étaient définir a fonction,
que étaient définir quelques paramètres.
À le très bas de ce, ce est a famille de paramètres.
I suis en utilisant le Ajouter coutume fonctions opérateur
à mettre ceux dans le mémoire de JMP, donc que JMP sait que J'ai a obtenu
ces coutume fonctions et sait quoi ils regarder comme et sait comment ils se comporter.
Faire il que chemin fournit quelques vraiment puissant outils.
Si I viens dans le scripts indice,
une fois J'ai défini mon fonctions, ils montrer en haut dans le scripts indice.
I n'a pas vraiment donner a parcelle de descriptions ici,
mais toi pourrait donner assez détaillé descriptions et exemples
ici comme toi serait comme.
Le autre chose que nous peut faire, encore à venir dos dans notre
Ajuster modèle est quand nous définir ces fonctions,
nous obtenir notre propre entrée dans le formule éditeur,
lequel permet nous juste cliquez sur un de ces et utiliser eux
juste comme nous serait n'importe lequel autre fonction dans le formule éditeur.
Encore, ces sont en fait assez facile à définir.
Le exemples dans le scripts indice faire il très facile à faire.
Juste recherche pour Ajouter coutume fonction
et toi peut juste utiliser le modèle standard là à construire désactivé de que.
Il y a aussi a super blog poste sur comment à faire que.
C'est un répondre à un question que nous avoir.
Allons-y continuer sur et allons regarder à a différent question,
peut être a légèrement plus complexe problème.
Quoi ça arrive si nous avoir deux des pics ?
Donc soudainement Courbe d'ajustement est Non plus long sur le tableau.
Étaient en allant à avoir à utiliser Ajustement non linéaire
et que aussi suggère comment nous pourrait travail avec ce.
Étaient en allant à essentiellement avoir à casser dehors
notre équation, notre modèle que nous avait avant.
I casser il dehors colonne par colonne
juste à gérer tous de ceux morceaux et pièces que nous scie avant.
I avoir un pour mon ligne de base,
I avoir un pour mon pics, et alors I avoir un pour mon spectres.
Allons-y avoir a regarder à quoi tous ceux regarder comme vraiment rapide.
Allons-y commencer avec le ligne de base
parce que c'est a obtenu a petit peu de a je t'ai eu que nous avoir à inquiétude à propos de.
Le ligne de base juste a le ajuster paramètre pour le ligne de base,
mais il aussi a ce x terme fois zéro.
C'est parce que non linéaire s'attend à chaque équation que va dans a formule
à cravate dos à le x axe que tu es fournissant.
Nous mettre x fois zéro dans là juste à avoir il être d'accord avec traçage que.
C'est juste a petit je t'ai eu que toi avoir à accord avec.
C'est un morceau, culminer 1 apparence juste comme nous serait attendre avec c'est paramètres.
Culminer 2 apparence juste le même,
sauf c'est a obtenu différent paramètre noms donc nous ne le faites pas avoir n'importe lequel collisions.
Culminer un était 1, 2, 3, 4 et culminer 2 est B 1, 2, 3 , 4, 5, 6, 7, 8.
C'est le seulement chose nous avoir à faire.
Alors le spectres elle-même, le chose que étaient en allant à ajuster,
le des choses que étaient en allant à mettre dans pas le Ajustement non linéaire plate-forme,
est étaient juste en allant à dire mon ligne de base courbe plus mon culminer 1 plus mon culminer 2.
Juste comme I a montré toi avant faire que dans Ajustement non linéaire,
voici mon spectres que va dans le prédiction équation.
Je suis en allant à souviens-toi à mettre mon compte dans et pas mon x courbe.
Juste comme I dit avant, Je suis en allant à développer mon intermédiaire
formules et c'est en allant à dire JMP à toi dos dans depuis que d'abord formule
dans tous le formules que sont dans le individuel colonnes.
Nous cliquez D'accord, Hé, nous voir quoi nous attendre à voir.
Maintenant nous peut cliquez aller
et il va à travers et convient tout juste comme nous serait attendre.
Nous obtenir a bon ajuster et nous avoir le capacité à obtenir confiance
intervalles et tout autre épouser comme désactivé de que.
Deux pics est raisonnable et possible.
Mais le problème que nous courir dans est
quoi ça arrive quand nous avoir quelque chose que apparence comme ce.
À a rugueux compter, il y a probablement a douzaine pics là
plus a complexe ligne de base c'est pas en fait a droit doubler c'est
probablement a obtenu quelques parabolique comportement à il.
Nous avons a obtenu a complexe ligne de base, nous avons a obtenu multiple sommets.
Étaient en allant à avoir à faire un formule pour chaque de ceux.
Il y a a parcelle de travail de terrain à construire dans quelque chose comme ce.
Si toi obtenir dans X- rayon diffraction, le problème obtient même pire.
Il y a confortablement 30, 40 pics dans ce spectres droite ici
que nous serait avoir à travail avec.
Le d'abord question que nous besoin à demander est,
peut non linéaire poignée que a problème?
Bien, il tours dehors que il peut
si nous juste utiliser non linéaire et Je suis en allant à faire quelque chose sauvage et fou.
J'ai a obtenu il convenable a Lorentzien culminer
et Je suis en allant à viens dos et Je suis en allant à en fait avoir il ajuster il dans réel temps.
Toi peut montre que comme il va à travers.
Il clous chaque culminer dans près réel temps comme I se déplacer à travers ce assez rapidement.
C'est frappe le grand culminer dans chaque groupe.
Que dit que le Ajuster moteur
peut probablement poignée le traitement que étaient transaction avec.
C'est bien. Ce vraiment devient plus de
a problème de logistique que a problème de réel fonctionnalité dans JMP.
Il vraiment est a réel problème.
Si nous étaient à regarder à, allons juste dire étaient regarder à convenable Voigt culminer formes
et nous pourrait parler à propos Lorentzien et nous pourrait parler à propos Gaussienne,
nous pourrait parler à propos le Pearson Sept, tous ceux différent types de culminer formes.
Mais le voix culminer forme a cinq paramètres,
le x axe et alors le perdre paramètres.
Que à peu près équivaut à à à propos six souris clics par culminer.
Même si tu es faire il dans a célibataire formule, c'est six souris clics par culminer.
Que dit que pour a dix culminer formule, pour a dix culminer spectres,
étaient en allant à avoir à faire 88 souris clics.
Cependant long que prend toi par souris cliquez est dépendant sur beaucoup, beaucoup facteurs.
Mais si nous étaient à faire quelque chose comme que radiographie diffraction modèle,
étaient parler dans le gamme de 300 souris sommets.
Si c'est en fait en haut autour 40, c'est en fait autour 300 souris clics.
C'est a parcelle de en cliquant autour que nous ne le faites pas vouloir à avoir à faire.
Nous serait comme notre interaction avec le spectres
à être quelque chose le long de le lignes de un cliquez par culminer.
Que suggère que nous besoin quelques automation construit- dans.
Allons-y avoir a regarder à comment J'ai fait que.
J'ai pris a outil et construit a outil à poignée ce.
J'ai en fait pris a nombre de différent solutions ici.
D'abord désactivé, allons regarder à le bibliothèque de pics que J'ai généré.
Spectriss.
Le titre de ce parler comprend dans il a nombre de différent culminer formes.
Nous inclure a famille de gaussien pics que avoir a diviser gaussien
que donne toi a différent standard déviation pour le x et y paramètre
pour un côté de le culminer depuis le autre.
Le même avec Lorentziens, le Pearson et alors le PseudoV des oigts.
Ces tous aussi avoir versions que sont
accordé à donner toi le zone plutôt de le intensité comme a ajuster paramètre.
C'est le zone terme dans tous de ces.
C'est un morceau.
Quand nous charger dans le spectres, ajouter dans, nous obtenir que pour gratuit.
C'est automatique.
Maintenant allons regarder à le autre défi.
Allons-y prendre que olive huile spectres.
Quoi nous vraiment vouloir est a outil
où nous peut viens dans et dire, voici mon X- axe, voici mon ET- axe.
I juste vouloir à être capable à faire quelques culminer découverte.
Voici mon quatre principal sommets.
Il trouvé eux automatiquement.
Peut être I vouloir à faire a d'abord dérivé ou peut être I vouloir à faire a quantile.
I peut aussi retirer le arrière-plan ici donc I peut cliquez fini.
C'est trouvé ceux d'abord trois pics pour moi.
Je suis en allant à aller devant et changement mon arrière-plan à a linéaire un.
Maintenant I peut viens dans aussi et faire quelques manuel culminer sélection.
Derrière le scènes,
c'est prise soins de en écrivant tous de ceux culminer paramètres pour toi
donc que tout est bon et rangé.
Il y a probablement un droite là.
Probablement un droite là. Il y a un droite là.
Chaque temps toi ajouter a culminer, toi peut viens dans et sélectionner le culminer
dans le liste de pics, et ça va donner toi le information calculé à que temps.
Toi peut voir droite ici, ces pics sont pas Bien défini.
Ils sont pas convenable le données très Bien.
Vraiment nous vouloir à aller sur dans non linéaire.
J'ai pris dans piraté non linéaire
donc que il volonté courir ce dans réel temps et regarder bon et joli.
Toi peut montre le culminer formes changement.
De façon réaliste, I pourrait avoir choisi a quadratique plutôt de a linéaire pour ce,
mais juste pour le saké de intérêt.
Ici, J'ai courir dehors de itération.
Je vais augmenter le itération et Je vais aussi dos désactivé juste a touche
sur mon pente donc que I peut essayer et obtenir ce chose à converger a petit plus rapide.
D'accord, Bien prendre que comme bien assez pour le moment.
Nous peut dire que nous vouloir à accepter le ajuster,
et il y a mon ajuster paramètres.
Alors I peut dire fait.
Il apporte il dos sur dans spectres pour moi à travail avec.
I peut maintenant dire, affiner mon ASC paramètres
et I peut viens dans et obtenir mon nouveau approximatif zone sous le courbe.
C'est super et grandiose, mais quoi I vraiment vouloir est un sortir tableau
que a tous ceux paramètres et leur information ci-joint à eux.
C'est spectres dans a coquille de noix.
Le but avec ce projet était à prendre, comme I dit avant,
nous vouloir à avoir le capacité à poignée physique pics, multiple pics,
avec un facile à utiliser interface que poignées ceux courbes
où nous besoin le zone sous le courbe,
le physique paramètres ci-joint à chaque culminer.
Mais nous vraiment ne le faites pas soit avoir assez données à utiliser dans ajuster modèle
ou dans a fonctionnel données explorateur, ou
c'est juste pas le problème où nous vouloir à travail avec que particulier outil.
Le outil est en haut encore.
Le QR code ici volonté prendre toi à le ajouter dans sur le communauté
où toi peut travail avec il.
Spectres est en haut maintenant et prêt à aller.
