Nivel: principiante
Título de la presentación: JMP como herramienta de análisis morfológico y de datos espaciales: intento de clasificar el carcinoma intraepitelial del tracto respiratorio superior y sus lesiones precursoras utilizando el análisis de conglomerados del método de distancia más corta
La mayoría de los tumores malignos de la mucosa del tracto respiratorio superior, como la cavidad bucal, la faringe y la laringe, son carcinomas de células escamosas que se desarrollan en la capa de células llamada epitelio escamoso estratificado que cubre la superficie de la mucosa. Además, es clínicamente conocido que las lesiones que se consideran en etapa previa o temprana se encuentran como placas blancas o rojas en la membrana mucosa, y la observación de muestras microscópicas de tejidos tomadas de pacientes revela displasia epitelial, displasia epitelial, y displasia epitelial, respectivamente. Se denomina carcinoma in situ. Además, la displasia se divide en tres grados, según las anomalías en la morfología celular y su proporción dentro de la capa epitelial: cambios leves, leves, moderados y graves. Aunque esta diferenciación se hace intuitivamente mediante la inspección de un patólogo y se cree que tiene cierto grado de reproducibilidad, no se han realizado muchos estudios objetivos. Esta vez, intentamos cuantificar la disposición de las células (núcleos) en la capa epitelial y examinar las diferencias entre no neoplásicos (normales), displasia y carcinoma in situ. Las coordenadas de los centroides de los núcleos celulares se extraen de la micrografía mediante análisis de imágenes digitales y se generan árboles de expansión mínima (MST) que conectan cada centroide mediante un análisis de conglomerados jerárquico utilizando el método de distancia más corta en JMP ver.15 cuando se obtienen los histogramas de las longitudes. Se compararon los resultados de cada rama, se encontraron diferencias entre cada grupo.
ryōji chiba
Ex profesor de la Universidad de Tohoku (Departamento de Investigación de la Construcción de Órganos Patológicos, Instituto de Envejecimiento y Envejecimiento). Doctor en Medicina. Ex investigador extranjero del Ministerio de Educación (medicina) (Universidad de Aarhus, Reino de Dinamarca).
En el campo de la patología humana, he estudiado el proceso de desarrollo patológico de las enfermedades utilizando la morfología cuantitativa aplicando la teoría de la probabilidad geométrica y la geometría integral, el análisis de imágenes digitales y el análisis estadístico multivariado. Hay artículos de investigación sobre cirrosis hepática, cánceres tempranos que ocurren en el epitelio alveolar, epitelio ductal pancreático y endometrio, sus lesiones precursoras y metástasis de cáncer en el hígado.
( https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7804428/ , https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7804429/ , https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8402446 / , https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8135625/ , https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7840839/ , https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ 10560494/)
Estoy interesado en métodos matemáticos que puedan aplicarse al análisis de los procesos de desarrollo del cáncer y su diagnóstico tisular, y estoy particularmente interesado en métodos de clasificación numérica como el análisis de conglomerados y el análisis discriminante. Como plataforma para análisis estadístico, he usado subrutinas estadísticas Fortran en mainframes, SPSS y SYSTAT en PC, y he estado usando JMP desde la versión 8, prestando atención a sus excelentes funciones de tabla de datos y su entorno de análisis flexible.
chiba-rui
Graduado del Departamento de Sistemas Complejos e Inteligencia, Facultad de Sistemas y Ciencias de la Información, Future University Hakodate. Mientras asistía a la universidad, me interesé por los fenómenos de sistemas complejos en reacciones fisicoquímicas y realicé experimentos e investigaciones sobre el mecanismo de formación de cápsulas de la polimerización térmica de aminoácidos en la fase líquida de alcohol. Actualmente estoy interesado en el análisis de imágenes digitales, la ciencia de datos y el reconocimiento y clasificación morfológica y de imágenes mediante redes neuronales.
