Niveau : Débutant
Titre de la présentation : JMP en tant qu'outil d'analyse de données spatiales et morphologiques - Tentative de classification du carcinome intraépithélial des voies respiratoires supérieures et de ses lésions précurseurs à l'aide de l'analyse groupée par méthode de distance la plus courte
La plupart des tumeurs malignes de la muqueuse des voies respiratoires supérieures, telles que la cavité buccale, le pharynx et le larynx, sont des carcinomes épidermoïdes qui se développent dans la couche de cellules appelée épithélium pavimenteux stratifié qui recouvre la surface de la muqueuse. En outre, il est cliniquement connu que les lésions considérées comme étant au stade pré-stade ou à un stade précoce se présentent sous la forme de plaques blanches ou rouges sur la membrane muqueuse, et l'observation d'échantillons microscopiques de tissus prélevés sur des patients révèle une dysplasie épithéliale, une dysplasie épithéliale, et dysplasie épithéliale, respectivement. C'est ce qu'on appelle un carcinome in situ. De plus, la dysplasie est divisée en trois grades, en fonction des anomalies de la morphologie cellulaire et de leur proportion au sein de la couche épithéliale : changements légers, légers, modérés et sévères. Bien que cette différenciation soit faite intuitivement grâce à l'inspection par un pathologiste et soit considérée comme ayant un certain degré de reproductibilité, il n'y a pas eu beaucoup d'études objectives. Cette fois, nous avons tenté de quantifier la disposition des cellules (noyaux) dans la couche épithéliale et d’examiner les différences entre les dysplasies non néoplasiques (normales) et les carcinomes in situ. Les coordonnées centroïdes des noyaux cellulaires sont extraites de la micrographie à l'aide d'une analyse d'image numérique, et des arbres couvrant minimum (MST) sont générés qui relient chaque centroïde à l'aide d'une analyse de cluster hiérarchique en utilisant la méthode de distance la plus courte dans JMP ver.15 lorsque les histogrammes des longueurs. de chaque branche ont été comparés, des différences ont été constatées entre chaque groupe.
Ryōji Chiba
Ancien maître de conférences à l'Université du Tohoku (Département de recherche sur la construction d'organes pathologiques, Institut du vieillissement et du vieillissement). Docteur en médecine. Ancien chercheur étranger du ministère de l'Éducation (médecine) (Université d'Aarhus, Royaume du Danemark).
Dans le domaine de la pathologie humaine, j'ai étudié le processus de développement pathologique des maladies en utilisant la morphologie quantitative appliquant la théorie des probabilités géométriques et la géométrie intégrale, l'analyse d'images numériques et l'analyse statistique multivariée. Il existe des articles de recherche sur la cirrhose du foie, les cancers précoces qui surviennent dans l'épithélium alvéolaire, l'épithélium canalaire pancréatique et l'endomètre, leurs lésions précurseurs et les métastases hépatiques du cancer.
( https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7804428/ , https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7804429/ , https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8402446 / , https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8135625/ , https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7840839/ , https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ 10560494/)
Je m'intéresse aux méthodes mathématiques pouvant être appliquées à l'analyse des processus de développement du cancer et à leur diagnostic tissulaire, et je m'intéresse particulièrement aux méthodes de classification numérique telles que l'analyse groupée et l'analyse discriminante. En tant que plate-forme d'analyse statistique, j'ai utilisé les sous-programmes statistiques Fortran sur les mainframes, SPSS et SYSTAT sur PC, et j'utilise JMP depuis la version 8, en prêtant attention à ses excellentes fonctions de table de données et à son environnement d'analyse flexible.
Chiba Rui
Diplômé du Département des systèmes complexes et de l'intelligence, Faculté des systèmes et des sciences de l'information, Future University Hakodate. Pendant mes études universitaires, je me suis intéressé aux phénomènes de systèmes complexes dans les réactions physico-chimiques et j'ai mené des expériences et des recherches sur le mécanisme de formation de capsules de polymérisation thermique d'acides aminés dans la phase liquide alcoolique. Actuellement, je m'intéresse à l'analyse d'images numériques, à la science des données, ainsi qu'à la reconnaissance et à la classification morphologiques et d'images à l'aide de réseaux de neurones.
