Bonjour, tout le monde. Mon nom est Tom Witkos, et aujourd'hui étaient ensemble avec Hadley Myers de JMP. Bien être présentation à toi à propos excès de vitesse en haut essai développement avec automatisé flux de travail pour évaluer plaque biais de microtitration plaque essais. D'abord, I serait comme à commencer avec remerciements de plusieurs équipe membres depuis AstraZeneca, Deepika, et Barbara, OMS a aidé nous avec expliquant certain concepts et aussi essai le JMP plugin.
Pendant le présentation, I serait brièvement introduire à toi quoi le puissance essai de produits biologiques signifier, comment nous utiliser plaques de microtitration dans notre travail, et aussi statistique analyse tel comme plaque biais et uniformité que sont très important pour essai développement. U finalement, nous volonté présent à toi le JMP Complément que Hadley et I avoir écrit que permet nous à effectuer ce analyse dans a beaucoup plus rationalisé et plus puissant manière.
D'abord, I serait aimer à mettre puissance dosages dans médicament R&D perspective. Là sont a nombre de biologique dosages utilisé les deux à le pré- clinique, clinique, et commercial étapes. Tout d'abord, nous typiquement avoir dépistage et sélection dosages à le pré- clinique scène. Ceux types de type de dosages sont essayer à répondre le question, lequel molécule a a biologique activité ? Je identifier candidats pour drogues.
Quand le candidat médicament a a été déjà identifié, nous serait se déplacer à quelque chose lequel nous serait appel puissance essais. Ici nous seulement travail avec a certains médicament candidat, seulement un. Nous fabrication beaucoup différent beaucoup de ce molécule que sont aller à être utilisé dans clinique essais et finalement comme Bien, beaucoup que serait être fait post- approbation de le médicament dans le commercial paramètre. H aussi, le question que nous demandent est, est le biologique activité à a similaire niveau entre beaucoup? A ll nous soins à propos est le parcelle- à- parcelle cohérence, si c'est conservé ou pas.
A s tel, puissance essai est a critique propriété de le médicament, et c'est partie de quelque chose lequel Bien appel CMC, Chimie Fabrication Processus et Contrôles. Analytique essai, tel comme le biologique activité tests que notre équipe est dans charge de développement, sont assez important à alimentation dans le optimisation de le fabrication processus à joli beaucoup chaque scène. B aut à le en amont et en aval étapes. W poule le produits biologiques sont être fabriqué et alors plus loin purifié, comme Bien comme à le étapes de développement formulation et aussi conditionnement pour ces médicament molécules.
Dépistage et puissance dosages les deux mesure biologique activité, mais ils faire il dans a légèrement différent manière. Dans le dépistage était essais, nous avoir assez a peu composés que sont pas en allant à avoir n'importe lequel biologique activité ou très petit. Quelques avec modéré et également a peu composés avec assez haut biologique activité. Parce que nous sont se concentrer sur identification de candidat médicament molécules, le différences que nous voir dans le biologique activité sont en allant à être très haut.
Essentiellement, notre dosages besoin à résoudre verrouillage échelle différences entre différent drogues concernant leur biologique activité. Pour le CMC puissance essais, nous déjà avoir le candidat médicament nommé. W hile fabrication différent beaucoup de le même molécule, nous serait attendre quand le fabrication processus est Bien optimisé et contrôlé, que le différences que nous observer dans le biologique activité sont en allant à être petit. W e besoin à assez précisément résoudre petit différences dans le double changement entre différent beaucoup de le même médicament.
Là sont a nombre de différent puissance dosages ensemble hauts. Sans en allant dans aussi grand détails, finalement, quoi nous essayer à faire est mesure biologique activité par quantifier le cible reliure, m ainly le protéine que notre drogue interagit avec. T a peut être soit comme partie de le recombinant protéine ou être présenté par le cellules que exprimer a certain cible sur le surface, comme Bien comme quantification de effet de que cible reliure. Je n ceci cas, que volonté être finalement cellule- basé rapport essais où nous volonté être regarder à le activation ou incubation de certain signalisation voies exigible à le interaction de le médicament avec a certain récepteur.
A s toi peut voir, indépendamment de de le essai types, dans tous de ces paramètres, nous utiliser micro titre plaques. La plupart communément, nous utiliser 96- Bien plaques, mais a plus haut nombre de Bien plaques sont aussi possible à être utilisé. Dans un essai courir, donc dans un expérience, nous utiliser soit un ou multiple plaques, et que serait dépendre sur dans la plaque et lieu- à- plaque variabilité. Finalement, dans un microtitration plaque, chaque célibataire Bien peut être vu comme a séparé mini réaction.
Dans ce particulier cas, nous avoir a très commun protéine cible où notre médicament interagit à. T poule le montant de le lié médicament est détecté avec le secondaire anticorps. Dans ce exemple comme Bien, chaque composant est le même à travers tous le puits. Le seulement différence être a pente dans le concentration de notre donné molécule. T a volonté être livré dans quelque chose lequel nous appel dilution série. O n chaque plaque, Bien avoir dilution série de référence matériel et aussi de notre testé échantillons de inconnu biologique activité.
Par ayant a dilution série, nous serait attendre à voir a dose- réponse courbe. W a toi peut voir ici dans cas de le obligatoire, quoi nous serait attendre est que le plus médicament nous mettre, le plus haut le réponse nous devrait être capable à observer. Nous serait alors ajuster que données dans a modèle. La plupart probable c'est aller à être a non linéaire- 4PL modèle. T poule nous serait travail avec ces convient, et nous faire a par paires comparaison de convient entre le référence standard et notre testé molécules, où nous serait partager le inférieur et supérieur asymptotes et le croissance taux, donc le pente de ceux courbes.
Donné que le courbes regarder similaire à chaque autre, nous serait être capable à calculer le inflexion indiquer. Dans ce cas, c'est en allant à être soit CE 50 ou CI 50, selon si nous sont regarder à le activation ou inhibition. Et que différence dans le CE 50 ou CI 50 entre ces deux courbes serait alors peut être mathématiquement converti dans quelque chose nous terme % relatif puissance. T chapeau notre ultime lire à haute voix. Dans puissance essai développement, là sont a nombre de expériences que nous besoin à effectuer dans commande à atteindre un essai que peut être utilisé pour produits biologiques essai et peut finalement être validé.
Pour exemple, ici nous serait commencer avec dépistage réactifs et essai conditions, les deux fait dans le un facteur à le temps et le Dépistage Biche mode. Alors nous serait établir a preuve de concept dose- réponse courbe. Nous serait regarder à le plaque mise en page et alors verrouillage il ensemble avec c'est expérimental conditions. A ll de ces mesures peut être analysé dans JMP. F ou d'aujourd'hui présentation, Je suis en allant à se concentrer sur assez crucial partie de ce essai développement étape, lequel est établissement le plaque mise en page. L cuisiner à quelques temps à travers le terme plaque uniformité et plaque biais.
D'abord, allons parler à propos plaque biais. Allons-y étape dos pour a moment et pense de a situation où nous avoir avoir chaque célibataire Bien être identique. Signification que nous même avoir a constante concentration de notre drogues à travers les deux rangées et colonnes. I n idéal monde, nous serait attendre à voir Non variabilité entre le puits, comme toi peut voir ici sur le plaque carte généré par JMP. Dans réalité, nous savoir que quelques variabilité est inévitable. Cependant, nous vraiment besoin à comprendre c'est sources et le variabilité besoins à être contrôlé dans commande à avoir a précis et précis mesures de le biologique activité.
Échelle vraiment importe dans ces types de plaque cartes que peut être très facilement généré en utilisant JMP. H aussi I créé deux différent données ensembles et alors visualiser eux en utilisant JMP. A s toi peut voir, juste par regarder à le plaque cartes, toi pourrait voir a très aléatoire modèle dans réponse les deux à travers colonnes et puits. Ici Je suis montrant toi un analyse par le plaque rangée, mais alors le moment toi échelle il en haut, toi peut clairement voir que le supérieur essai est beaucoup plus précis et précis et avoir inférieur variabilité comparé à quoi nous pourrait voir dans le inférieur partie exemple.
JMP offres vraiment ce super graphique et statistique outils que quand combiné ensemble sont très utile pour ce taper de analyse. Motifs de variabilité peut vraiment être non- aléatoire comme Bien. Ici, suivant dans notre exemple, nous toujours avoir a constante concentration de notre médicament, et nous peut voir le changements dans les deux soit moyenne réponses ou dans variabilité. Dans le haut exemple, toi peut voir a dérive dans le moyenne réponse quand nous se déplacer à travers plaque rangées.
I n le bas exemple, toi voir que même cependant le moyenne variabilité à travers le plaque, rangée sage, est toujours le même, nous peut clairement voir que avec le plaque rangée changements, nous aussi voir a ampleur de le changements dans termes de le variabilité dans le rangée. T chapeau quelque chose que nous vraiment besoin à payer a grand attention à parce que finalement sur notre plaques, nous toujours avoir à avoir certain puits où nous sont en allant à livrer notre dilution série de référence matériel et notre testé échantillons.
F ou le plaque uniformité, Je suis en allant à présent toi brièvement a cas étude avec a non- cellule basé obligatoire essai où nous avoir a recombinant cible. T chapeau a recombinant protéine lequel est codé sur le microtitration plaques. W e viens en haut avec notre médicament, encore, dans le formulaire de dilution série. I n ce cas, le biologique est a monoclonal anticorps. W e sont capable à utiliser a détection réactif accouplé avec un enzyme, où après ajout de le clair substrat, le substrat obtient catalysé par le enzyme dans présence de notre médicament dans commande à rendement a coloré produit.
A s toi peut voir, là sont multiple mesures et multiple lavages à côté. Beaucoup obligatoire dosages serait avoir similaire ensemble en haut, mais ils peut différer. T ces différences peut être, pour exemple, dans liquide volumes, incubation fois, tampons, réactif conditions, et plaque types utilisé. B parce que de que, plaque uniformité a vraiment a été menée pour chaque essai nous développer. Parce que là sont beaucoup potentiel sources de variabilité, y compris le opérateur.
Nous déjà avait a flux de travail dans lieu dans notre équipe à faire que, mais que était vraiment lourd, lequel I espoir toi serait être assez clair quand nous plonger dans ce glisser. Quoi nous avait à faire est manuellement exporter le plaque réponse données depuis notre plaque lecteur dans le Exceller feuille. Nous avait à manuellement réarranger le données dans dilution série et alors casser il vers le bas par plaque. Nous étaient calculateur CE 50 ou CI 50 dans a différent troisième faire la fête logiciel. Ceux mesuré inflexion points avait à être alors manuellement réexporté depuis que logiciel dos dans Exceller.
Nous avait à manuellement organiser le données dos dans le Exceller dans a format que serait être digestible pour a simple Ajuster Y par x analyse dans JMP. T ensemble avec Hadley, nous étaient capable à développer a JMP plugin, lequel est capable à faire tout et même plus que que dans juste un étape sans le besoin de en utilisant n'importe lequel pièces de logiciel quoi que ce soit. A s toi peut voir ici, le entier flux de travail est cassé vers le bas dans trois mesures.
D'abord est le données importer dans JMP. Nous sont capable à importer multiple plaques à une fois. Nous sont capable à générer plaque chaleur cartes juste à visuellement exporter le données et potentiellement détecter et éliminer valeurs aberrantes que serait sinon fausser notre données analyse et potentiellement plomb à conclusions erronées. T poule nous sont capable à regarder à le courbe biais analyse en allant par plaque rangées ou plaque colonnes. I f rien apparence potentiellement suspect ou nous vouloir à faire a Plus profond plonger, nous pleinement employer JMP interactivité. Juste par planant sur a certain données indiquer, étaient capable à regarder à le courbes et que particulier affliction indiquer calcul vient depuis.
I espoir il volonté être beaucoup plus clair dans a moment quand Hadley est en allant à démontrer le JMP plugin dans JMP. Hadley, le sol est le vôtre.
Tous droite, remercier toi très beaucoup. Thomas et Bonjour, tout le monde. Je suis en allant à aller devant et partager mon écran. Avant I saut directement dans le annonce, Identifiant comme à montrer toi que le annonce prend avantage de a nombre de caractéristiques dans JMP. D'abord un est le Ajuster Courbe plate-forme disponible depuis Spécialisé Modélisation. Comment le Ajuster Courbe travaux. En fait, peut être Je vais montrer il dans était dosages a peu mieux. Comment Ajuster Courbe travaux est que il permet toi à calculer information à propos ton connu courbe formes. Pour exemple, le croissance taux, ou dans notre cas, le un que nous étaient intéressé dans était le inflexion indiquer, ajuster a variété de différent types de courbes. Pour exemple, le sigmoïdale courbes, lequel est quoi nous étaient en utilisant ici.
Le autre un que il fait utiliser de est le carte formes. Carte formes raconte le logiciel à reconnaître a certain valeur dans a colonne comme a chiffre sur a carte et à reproduire que chiffre dans Graphique Constructeur. Toi peut voir que ici. JMP vient préchargé avec beaucoup défaut formes, pour exemple, pays noms, et là sont quelques autres comme Bien. Le microtitration puits sont pas compris avec JMP par défaut. Si personne est intéressé dans en utilisant eux, toi peut trouver eux sur sur le communauté. I pense que il y a a lien à ce emplacement où toi peut télécharger ces Eh bien, des formes, ces formes de carte dans notre présentation sur le même page.
Sans plus loin décoration, allons saut dans quelques de quoi le Complément fait. Si I étaient à ouvrir en haut ce exemple ici où toi pourrait voir le nom de le cellule, le plaque que il est venu depuis, le données, et alors le plaque rangée colonne, et alors le concentration valeur. Le d'abord chose épouser comme à faire est à visualiser ce. Le Complément permet nous à faire que par en cliquant sur le Générer Cellule Cartes bouton où I peut mettre dans le données, le plaque nom, et le cellule nom, appuyez sur OK.
Ici toi peut voir tous le différent carte formes et utiliser ces à très rapidement identifier valeurs aberrantes ou n'importe lequel spécial chose que peut être événement sur le plaque que toi peut reconnaître visuellement. Droite loin, nous avons obtenu quelques valeur de ce. Quoi Identifiant comme à dire, cependant, est que le données, quand il vient dehors de le machine à a jours fin, I était dit ce dans assez tel a bon format, il en fait apparence comme ce. C'est ces CSV fichiers, et toi peut voir tous de que information ici. Le très d'abord étape est à prendre tous de ce données et à obtenir il dans JMP. De cours, JMP peut lire CSV fichiers, donc c'est pas tel a grand problème. Là il est.
Une fois nous avons fait que, nous besoin à saisir le individuel données depuis le plaques eux-mêmes. Il y a a nombre de plaques ici. Ici nous peut utiliser le Complément pour quelques aide. Je suis en allant à saisir ce. Par le chemin, pour n'importe qui regarder ce, si toi avoir similaire données ou similaire besoins et sont intéressé dans développement ces Modules complémentaires toi-même, toi peut toujours atteindre dehors à ton locale JMP équipe pour aide. Ils auraient être heureux à montrer toi comment à faire ces et travail avec toi à faire eux comme Bien. N aïe que J'ai mis en évidence tous de ces, J'ai choisi eux dans le tableau, Je suis en allant à aller devant et importer ce données. N aïe c'est dans le droite format et I peut aller devant et générer mon carte formes.
Le autre chose que I peut faire est calculer tous mon CE 50 valeurs ou rien autre que Identifiant comme à calculer. Dans commande à faire que, I besoin à saisir le concentrations. Comme I comprendre que le concentrations que sont utilisé changement depuis exemple à exemple, donc là n'était pas un option à automatiser ce. Mais le personnes en cours d'exécution ces savoir quoi ils sont pour leur spécifique exemple, donc ils peut saisir eux et alors importer eux comme que. N aïe quoi Bien faire est Bien aller devant et générer tous de notre CE 50 valeurs. Générer inflexion indiquer tableau. H voici mon données. Voici mon concentration. Voici mon plaque, et voici mon rangée information. Je vais presse D'ACCORD. Maintenant J'ai a obtenu a tableau de tous de le CE 50 valeurs.
Ce est très bon. I peut faire quelques analyse JMP si I vouloir à. Le autre chose tu vas avis est que c'est créé a Ajuster Groupe scénario ici, lequel I peut utiliser à explorer le estimations par plaque rangée, et par plaque eux-mêmes. Ce est plaque rangée. Si étaient regarder à il par rangée, si étaient regarder à par colonne, il serait être plaque colonne. Ce est très bon, mais quoi il fait est il prend avantage de un autre JMP fonctionnalité appelé Graphiques, lequel permet toi à générer ou ouvrir en haut et courir n'importe lequel n'importe lequel plate-forme dans JMP depuis n'importe lequel plate-forme dans JMP, soit que plate-forme ou un autre plate-forme.
Dans ce cas, épouser comme à courir Ajuster courbe depuis notre Ajuster Y par x Ajuster Groupe rapport. Nous peut faire que simplement par planant sur n'importe lequel indiquer que captures notre intérêt. Quand nous faire que, nous générer le inflexion indiquer. Le entier courbe, nous peut regarder à il, ou nous peut plonger dans a petit plus proche par en cliquant que bouton. Que prend nous droite dans Ajuster courbe avec le échantillon que généré que forme. Différent des choses que nous peut faire avec ce données. Peut-être un autre chose que Je vais montrer toi que le Complément peut faire est à explorer ce a petit peu plus étroitement à explorer le variabilité depuis échantillon à échantillon.
Nous peut faire que par pressage ce bouton et alors explorer le standard déviation de tous de le échantillons que dans théorie serait être le même, mais il y a en allant à être quelques variabilité. Nous pourrait voir quoi que apparence comme sur ici. I espoir toi trouvé que intéressant. I espoir c'est donné toi quelques idées à propos comment toi peut construire similaire Modules complémentaires toi-même ou automatiser processus que typiquement prendre a long temps. Thomas, comment long serait ce avoir pris sans le utiliser de le Module complémentaire ?
Probablement quelque chose autour 3-5 heures. I pense le conclusions que pourrait être dessiné peut pas nécessairement refléter le réalité. Simplement parce que certain outils étaient pas disponible pour nous. Certainement beaucoup de a radical changement dans le manières comment nous travail. Remercier toi très beaucoup, Hadley, pour que présentation. Juste à finition désactivé, I volonté juste résumer tout. Avec un peu de chance, toi peut voir mon diapositives maintenant.
I serait juste vouloir à réitérer le avantages de le nouveau outils. Il est vraiment a un arrêt- boutique pour plaque biais et uniformité analyse avec la plupart modèles lequel sont déjà choisi pour utilisateurs. Que était assez important pour nous comme Bien. Juste à assurer que nous avoir ce complet conformité dans notre équipe que le meilleur modèles sont être utilisé. Le plaque chaleur génération de cartes option autorisé nous à retirer n'importe lequel de le évident données valeurs aberrantes dans commande à se concentrer sur le vrai variabilité analyse.
Allons-y pense pour a moment que nous avoir un valeur aberrante dans un de le cinq plaques dans un de le puits dans rangée H que pas nécessairement moyens que le variabilité de le entier rangée H à travers tous le essai courses serait toujours être beaucoup plus haut comparé à le autre rangées. Comme réitéré aussi à le très début à travers que question que Hadley a demandé, nous vraiment étaient capable à retirer le manuel et erreur sujet copie coller de le données.
Quoi I vraiment personnellement très aimé est le interconnecté connectivité de courbe analyse avec plaque brut et colonne variabilité analyse. T chapeau ces types de graphiques que Hadley a démontré à toi. Plus dans profondeur analyse de incertitude dans le calcul de le inflexion indiquer est possible. C'est quelque chose que nous sont explorer plus loin comme Bien à peut-être étendre que JMP Complément même plus loin. A ll dans tous, il certainement sida et vitesses en haut développement de robuste puissance essais en notre équipe en allant avant.
T écheveau toi très beaucoup pour ton attention. Les deux Hadley et I serait être disposé à prendre n'importe lequel questions juste par contacter nous à JMP Utilisateur forum. Remercier toi très beaucoup.
