908 Devices는 REBEL 배지 분석기에서 생성된 아미노산 및 비타민 농도를 라인에서 직접 분석하고 추세를 파악하는 데 도움이 되는 JMP 추가 도구를 출시했습니다. 배지 개발 및 조정에서 다양한 매개변수를 시간이 지남에 따라 테스트하여 많은 수의 샘플과 생성된 데이터를 얻습니다. REBEL 분석기는 JMP 추가 기능과 함께 사용자 지정 보기에서 데이터 세트를 즉시 시각화할 수 있습니다. Alvotech는 JMP가 다양한 배지 제형을 사용한 다양한 생물 반응기 실행에서 아미노산 수준을 빠르게 비교하여 프로세스에 대한 이해를 개선하는 방법을 보여주는 사례 연구를 제시합니다.
복잡한 실험 환경에서 다양한 배지 조성을 13일 동안 여러 생물 반응기를 가동하여 테스트했습니다. REBEL과 함께 세 가지 다른 희석액으로 아미노산과 비타민 농도를 이중으로 분석하여 배치 성능을 평가했습니다.
21가지 아미노산과 6가지 비타민 수치를 모두 포함하는 이 대규모 데이터 세트의 결과는 JMP를 통해 간단한 방식으로 시각화되었으며, 데이터를 비교하고 측정 정확도를 결정하기 위한 다양한 설정을 제공했습니다.
안녕하세요, 저는 일디코입니다. 저는 동료 토마스와 함께 이 회의에서 Alvotech Germany를 대표합니다. 저희는 둘 다 Alvotech의 프로세스 혁신 팀원이며, 주로 미디어 개발 프로젝트를 진행하고 있습니다. 저희는 활발한 JMP 사용자이며, 주로 다양한 DOE, 복잡한 DOE를 사용하지만, 이번에는 REBEL 사용자를 위한 데이터 시각화를 위한 작고 스마트한 도구를 소개하고자 합니다. REBEL은 908 Devices 회사에서 제조한 광고 라인 지출 미디어 분석기입니다. 작년에 그들은 아미노산과 비타민 농도의 직접 분석과 추세 분석을 용이하게 하는 JMP 추가 도구를 출시했습니다.
이 측정과 함께, 이 JMP 추가 기능으로 사용자 정의 뷰에서 즉시 시각화할 수 있는 정말 큰 데이터 세트가 생성됩니다. 우리는 비교할 워크플로를 제시하고, 시간별 추세와 다른 결과, 다른 미디어 제형, 다른 바이오리액터 실행을 보여주고, 이 Smart Ramping 도구가 어떻게 향상된 프로세스 이해로 이어질 수 있는지, 그리고 이것이 우리의 일상 업무에 어떻게 도움이 될 수 있는지 보여주고 싶습니다.
REBEL에 대한 몇 마디. REBEL이란? 이것은 모세관 전기영동 기반 소형 질량 분석기인 폐기물 매체 분석기 기계로, 키트와 함께 작동하며, 한 샘플에서 33가지 다른 대사체를 분석할 수 있는 용량을 가지고 있습니다. 약 7, 10분 정도 걸리므로 정말 빠릅니다.
저는 언급했듯이, 이 플랫폼을 다양한 목적으로 미디어 개발에 사용합니다. 저희는 특정 대형 미디어를 공식화하는 데 공급업체를 비교합니다. 저희는 공급업체를 비교하고, 어느 공급업체가 가장 좋은 성과를 낼 수 있는지 정의합니다. 제가 언급했듯이, 저희는 복잡한 거래를 하고 있으며, 이러한 다양한 미디어 조건에서 분석물 추세를 따라야 합니다. 저희는 매일 빠르게 결정을 내려 공급 전략을 정의하거나, 이러한 조건, 시간 경과에 따른 분석물 추세를 확인해야 합니다. 저희는 또한 이 도구를 사용하여 벤치 스케일 바이오리액터 실행에서 다양한 조건을 비교합니다. 하나의 제품 수명 주기 관리가 있고, 예를 들어 새로운 미디어를 구현하고 싶은 경우, 다른 설정과 비교합니다.
대규모 데이터 세트를 생성할 때, 정말 빠른 데이터 처리 및 시각화를 위한 이 JMP 추가 기능 도구가 있습니다. 여기서는 JMP 16 이상 버전에서만 작동한다는 점을 알려드리고자 합니다. 제가 언급했듯이 전체 설계와 방법으로 돌아가면, 이 포스터에서 세 가지 사례 연구를 통해 세 가지 작은 비교 워크플로를 제시하고 싶습니다. 이러한 워크플로가 데이터 가져오기에서 사용자 지정 대시보드 보기까지 어떻게 표시되는지에 대한 짧은 데모 비디오를 보여드리고 싶습니다. 그런 다음 필요에 따라 추가로 처리, 저장, 전송, 내보내기 등을 수행할 수 있습니다. 준비된 데이터 필터가 있는 대규모 데이터 세트의 경우 분석은 실제로 1, 2분 밖에 걸리지 않습니다. 이것은 REBEL 사용자에게 정말 유용한 도구입니다.
작동 원리는? 첫째, 애드인을 설치한 후, 정말 쉽습니다. 애드인 파일을 설치하기만 하면 됩니다. Alvotech에서는 JMP의 원격 버전을 가지고 있는데, 이는 많은 제한 사항이 있는 GMP 검증 환경이기 때문입니다. 여기서 애드인을 설치한 후, 세 가지 워크플로, 샘플 비교 워크플로, 연구 1에서 보여주고 싶은 내용, 연구 2에서 이상 추세와 조건 추세에 대한 두 가지 시간 경과 워크플로를 볼 수 있습니다. 그리고 제가 잊었던 것이 있습니다... 여기, 연구 3이 있습니다.
결과 파일, 즉 기계가 생성하는 것은 배치 실행 시트를 기반으로 하는 소위 REBEL 배치에서 나오는 CSV 파일입니다. 이것은 샘플 레이블이 잘 정의된 경우 템플릿, 즉 Excel 템플릿입니다. 결과 시트가 생성되면 JMP로 직접 가져올 수 있습니다. 소위 샘플 레이블 파일이라는 선택적 파일이 있는데, 샘플을 사용자 정의 메타데이터와 연관시키는 옵션이 있기 때문에 매우 유용합니다. 즉, 추세 워크플로에서 중요한 것입니다. 예를 들어, 어떤 조건이 어떤 바이오리액터에 있는지 확인하기 위해 바이오리액터 이름을 샘플 레이블 이름에 대응시키고 싶습니다. JMP는 이 샘플 레이블과 이러한 구성 요소를 인식합니다. 나중에 데모 비디오에서 더 명확하게 보여드리겠습니다.
마지막으로, 결과를 JMP로 가져오면 먼저 기본 보고서 대시보드가 생성되고, 나중에 데이터 필터로 사용자 정의할 수 있습니다. 이것이 REBEL의 워크플로입니다. 첫 번째 비교 워크플로로 이동합니다. 이 사용자 정의 뷰가 어떻게 생성되었는지 보여드리고 싶습니다. 짧은 비디오로 보여드리고 싶습니다. 먼저 샘플 비교 워크플로를 엽니다. 이 파일이 있는 폴더를 선택합니다. 원격 JMP로 작업하고 있기 때문에 약간 복잡합니다.
폴더를 찾습니다. 폴더를 선택하면 처음에는 비어 있습니다. 샘플 레이블 파일을 선택하여 열어야 합니다. 행 번호 1로 시작하는 헤더를 조정합니다. 이것은 가져온 파일이며, JMP에서 데이터 테이블을 생성합니다. 시간이 조금 걸립니다. 바로 샘플 비교 대시보드 뷰로 이동합니다. 여기서 다른 배지를 사용하는 다른 생물 반응기의 모든 분석 항목을 볼 수 있습니다. 표에는 중복 또는 삼중 복제를 수행하기 때문에 분석 항목의 평균 값이 표시됩니다.
필터 패널의 왼쪽에서 샘플 라벨을 선택할 수 있습니다. 이 경우 그는 매체 유형만 표시하고 싶어하기 때문입니다. 또한 여는 데 시간이 걸립니다. 이것은 매체 A 구성입니다. 다른 모든 매체는 차례로 나타나야 합니다.
다른 워크플로는 훨씬 빠릅니다. 어떻게 된 일인지, 미디어, 비교 워크플로는 정말 정말 느립니다. 이것들은 미디어, 다른 공급업체가 준비한 동일한 미디어입니다. 차이점을 볼 수 있습니다. 또한 분석물의 농도 패턴을 볼 수 있으며 샘플 희석이 좋았는지 여부를 결정할 수 있습니다. 또한 제어판에서 신뢰 구간을 선택할 수 있습니다. 값의 표준 편차를 선택하여 여전히 허용할 수 있는 정의된 범위에 있는지 알아낼 수 있습니다.
최종 사용자 지정 대시보드가 생기면 이 대시보드를 저장할 수 있습니다. 저장한 후 데이터 테이블을 클릭하면 나타납니다. 네. 왼쪽 상단의 제어판에 있습니다. 수정된 대시보드가 있는데, 그걸 클릭하면 다시 나타납니다. 물론, 다음에 다시 나타나도록 데이터 테이블을 저장해야 하는 경우입니다.
물론, 모든 형식으로 데이터를 내보낼 수도 있습니다. 이것이 첫 번째 워크플로였습니다. 다른 워크플로는 미디어 개발에서 가장 많이 사용하는 분석물 추세 워크플로와 조건 추세 워크플로입니다. 분석물 추세로 이동하면 해당 비디오도 있습니다. 하지만 말하기 전에, 여기서 매우 중요한 작업에 대해 말씀드리고 싶습니다. 시간 경과 구성 요소를 정의하는 것입니다. 이는 원래 결과 표인 Excel 표에서 샘플 레이블 열의 첫 번째 항목이 있는 방식으로 작동합니다.
이 경우, 3일차의 1번 배양 스테이션, 2번 용기입니다.JMP는 시간 구성 요소, 첫 번째 시간 구성 요소, 즉 3번을 알아야 합니다.구분 기호를 사용하여 시간 경과 구성 요소를 정의합니다.여기서 표시된 대로 구분 기호는 텍스트 문자열을 구분하는 문자입니다.이 경우 이 명명 규칙에 따라 이중 공백입니다.첫 번째 시간으로 표시하려는 시간 경과 구성 요소는 3번입니다.이것은 샘플 레이블의 세 번째 구성 요소입니다.여기서 미리 보기를 업데이트하면 시간 3이 첫 번째 시간 구성 요소가 되고 샘플 레이블이 그 중 하나인 것으로 나타납니다.선택 사항인 샘플 레이블 파일에서 정의한 것과 동일하며, 배치 레코드 위치에 해당하며 분석물 추세 데이터 세트에서 보고 싶은 것입니다.
이것을 얻으면 JMP 가져오기가 대시보드를 보여줍니다. 비디오에서도 보여주는 것이 더 좋고, 단계별로 진행하면 더 잘 보입니다. 두 번째 Analyte 추세 워크플로를 엽니다. 앞서 언급했듯이 샘플 레이블의 정보를 전달합니다. 샘플 레이블 옵션 파일을 만들었기 때문입니다.
시간 경과 샘플 레이블 파일이 있습니다. JMP는 즉시 인식하고 가져옵니다. 이렇게 하면 더블 스페이스와 숫자 3으로 시간 경과 구성 요소를 정의할 수 있는데, 이는 시간이 3으로 시작함을 나타내며, 이는 3일차입니다. 이제 데이터 테이블과 모든 분석 항목을 표시하는 분석 항목 추세 대시보드 뷰가 나타납니다. 이 분석 항목 추세는 시간 경과에서 모든 항목의 평균을 표시합니다.
샘플이 있는 모든 날짜가 여기에 정의되어 있습니다. 표준 오차 범위를 설정할 수 있으며, 하나의 배양 스테이션만 표시하도록 필터를 설정할 수도 있습니다. 그렇지 않으면 좋은 추세가 되지 않기 때문입니다. 이 분석물 추세는 하나의 조건만 표시합니다. 모든 분석물, 여기서 이상치를 볼 수 있습니다. 분석물의 비정상적인 동작을 볼 수 있습니다. 사용자 지정 보기에서 분석물을 하나만 표시하도록 선택할 수 있습니다.
또한 값이 측정되지 않았는지 확인할 수 있습니다. 신뢰 구간을 설정하고, 필요하다면 표준 편차를 설정할 수 있습니다. 원한다면 다른 분석 항목을 하나씩 확인합니다. 그리고 대시보드를 데이터 테이블에 저장합니다. 나중에 내보내고 싶은 수정된 대시보드를 원하는 수만큼 저장할 수 있는지 확인합니다.
여기에는 특이한 것이 있습니다. 사실, 이 데이터 세트에서 버그가 발견되었습니다. 다음 슬라이드에서 동일한 데이터 세트, 적어도 첫 번째 데이터 세트에서 생성된 조건 추세 워크플로를 통해 이를 보여드리겠습니다. 이번에는 비디오를 보여드리지 않을 텐데, 데이터 가져오기가 지난번과 같을 것이기 때문입니다.
제가 언급했듯이, 이것은 배지 조건에 대한 DOE입니다. 이것은 AMBR15 소형 생물 반응기 설정입니다. 여기, 이것은 제가 가장 좋아하는 워크플로우, 즉 우리가 모든 조건에서 시간 경과에 따라 하나의 분석물을 선택할 때의 조건 추세 워크플로우입니다. 여기, 물음표가 있는 이 생물 반응기 위치가 있는데, 이것은 샘플 레이블 파일에 없었습니다. 이것은 시스템의 버그입니다. 이 경우, 데이터 테이블, 시간 경과 구성 요소 및 샘플 레이블의 이름을 확인할 때 올바르게 분리되지 않았습니다. 이것은 버그로 식별되었습니다.
여기서 특정 날짜, 예를 들어 여기와 여기, 11일차와 6일차에 값이 누락된 것을 볼 수 있습니다. 또한 데이터 테이블에서 값이 누락된 것을 볼 수 있습니다. 이는 908 Devices에 보고할 수 있는 버그를 의미합니다. 무슨 일이 일어났는지 조사하는 것은 아직 진행 중입니다. 제가 이 시간 경과 조건 추세 워크플로를 정말 좋고 유용하다고 생각하는 이유는, 여기서 예를 들어 다른 조건을 볼 수 있기 때문입니다. 다른 용기, 다른 조건이 얼마나 불균형한지, 어떤 종류의 조건이 있는 DOE이기 때문에 결과에 대해 전혀 알 수 없습니다. 미디어가 균형 잡히지 않았습니다.
아미노산은 정말 다른 추세를 보입니다. 예를 들어, 여기 알라닌은 특정 날짜 이후 세포가 어떻게 성장하고 죽는지에 대해 완전히 다른 패턴을 보입니다. 정말 다른 추세를 보이는데, 이는 연구를 마무리할 때 우리에게 매우 귀중하고 중요한 정보입니다. 또한, 매일 긴급 공급 전략을 변경하고 싶다면 REBEL은 모든 조건에서 모든 분석 항목을 매일 측정할 수 있으며, 이 워크플로우를 통해 정말 빠르게 확인할 수 있습니다.
이는 또한 추세 상태이지만, 제가 보여드리고 싶은 마지막 연구에서는 mAb 제품의 수명 주기 관리입니다. 새로운 배지 제형이 원래 배지 제형과 비교하여 어떤 성능을 보이는지 보여드리고자 합니다. 우리는 이 14일 동안 성장하는 세포와 생산된 제품을 따릅니다. 물론 분석물 추세를 따랐습니다. 방대한 데이터 집합이 생성되었고, 저는 샘플 레이블 파일을 만들었습니다. 즉, 시간 경과 구성 요소가 정의된 후, 지난번과 같은 방식으로 배치 어코드 위치가 동일한 이름으로 추가되어 JMP가 배치 어코드를 식별할 수 있게 되었습니다.
마지막 영상을 보여드리겠습니다. 이것들은 연결된 파일입니다. 같은 폴더 아래에 있는 두 개의 다른 배치를 JMP로 시각화하여 JMP로 가져올 수 있습니다. 이것은 또한 이 추가 도구의 정말 좋은 기능입니다. 같은 연구에 대한 다른 결과 파일을 동시에 열고 데이터를 연결할 수 있습니다. 샘플 레이블 파일은 JMP에서 즉시 정의되고 읽힙니다.
여기서 정의는 약간 다른데, 첫 번째 샘플 레이블 열도 다르기 때문입니다. 저는 여기서 0일로 식별합니다. 이제 모든 분석 항목이 모든 조건에서 기본적으로 나타납니다. 그래서 여기에 로컬 데이터 필터를 적용해야 합니다. 예를 들어 슬라이드에 스크린샷으로 있는 아르기닌을 살펴보겠습니다. 미디어가 얼마나 균형 잡혔는지 명확하게 볼 수 있고, 이미 정의된 조건입니다. 적어도 이 분석 항목의 경우 두 가지 다른 미디어 유형 간의 추세가 동일합니다. [청취 불가 00:22:57] 위치가 여기에 완벽하게 있습니다. 이 경우 버그가 없습니다. 완료되면 이전과 같이 대시보드를 저장할 수 있습니다.
물론, 더 고급 JMP 사용자를 위해 Graph Builder 옵션으로 추가로 사용자 정의할 수 있습니다. 이것은 내보내기 폴더를 선택하여 내보내는 방법과 같으며, 그림 파일로 내보내거나 Excel, 결과 테이블로 내보낼 수 있습니다. 여기에는 이미 많은 내보내기가 있습니다.
돌아가서 이 정말 유용한 도구를 결론지을 수 있다면, 우리는 이 복잡한 데이터 세트가 시간 경과 구성 요소를 추가하고 일부 구성 요소를 식별함으로써 정말 몇 번의 클릭으로 시각화될 수 있다는 것을 알 수 있습니다. 정말 쉽습니다. 이 애드인 도구를 사용하는 데 JMP 지식이 전혀 필요하지 않다고 생각하기 때문에 비고급 JMP 사용자에게 정말 유용합니다. 매우 짧은 시간 내에 정말, 정말 빠른 데이터 기반 의사 결정을 내릴 수 있기 때문에 이점이 큽니다. 이것은 정말 중요합니다.
908 Devices에서 업그레이드된 통계 분석 도구인 버전 2.6이 출시 중이라는 알림을 받았습니다. 이것은 개선된 버전입니다. 분리된 샘플 레이블 파일이 필요하지 않은 경우, 샘플 레이블 파일인 원래 결과 파일에 별도의 열로 둘 수 있으며, 시간 경과를 정의하고 추세 워크플로를 열 때 선택적 샘플 레이블 Excel 파일을 추가할 필요가 없습니다.
그게 전부입니다. 마음에 들어하셨으면 좋겠습니다. 관심을 가져주셔서 정말 감사합니다.
