スピーカー | トランスクリプト |
| カート・ヒンリヒス | さて、トム・ウォーク、アンナとディディエ |
| AG.Q.Hub にポスターが載っています。トム、どうぞ。 |
| トム・ウォーク | Curt さん、本当にありがとうございました。また、このプレゼンテーションに招待してくださった JMP コミュニティの皆様にも感謝いたします。私たちの成果を皆さんにご紹介できることをとてもうれしく思っています。 |
| 今日は、ノースダコタ州立大学植物科学科で構築しているAG.Q.Hubというツールについてお話します。これは主に、私と私たちのチーム、植物育種データベース管理チームの仕事です。 |
| アンナとディディエ |
| そして植物科学科長のリッチ・ホースリー氏。 |
| 私たちがやったのは、この長いサイクルを確立してきた植物育種家たちを助けようとしたことです。 |
| 作物の改良には長いプロセスが必要です。正しく一貫して行うには、多くの実験を行う必要があります。 |
| 幸運に恵まれて最高の作物を選ぶことができます。そのためには、たくさんの交配をする必要があります |
| 最初は何千ものラインでたくさんの試験が行われ、そこから10年以上のサイクルを経て、 |
| 選択...毎年、どのラインを前進させるのが最善か選択をします。そしてこれは...すべては環境条件によって変化するので、正しい組み合わせを見つけなければなりません |
| 遺伝子と環境の関係を研究する。そのためには適切な分析と実験計画が必要で、これは非常に複雑になる。 |
| 植物育種チームです。品種の選択には長いプロセスが必要です。私たちがやりたいのは、毎年の選択プロセスをより簡単にすることです。このプロセス全体を短縮できればいいのですが、私たちのより当面の目標は |
| プロセスをより効率的にするために、各段階での選択もより効率的になります。 |
| そのために私たちが行ったのは、AG.Q.Hubというツールを開発し、それを育種プログラムで使用していたことです。 |
| NDSU の植物科学には 10 の育種プログラムがあり、60 人以上のユーザーがいます。また、より多くの品種試験とフィールド サイトを備えた 2 つの研究拡張センターも設立しました。そして、このリストは増え続けています。 |
| 私たちはより多くのユーザーを追加しようとしており、おそらくさらに多くの研究拡張センターを追加する予定です。 |
| AG.Q.Hub の優れた点、そしてこのようなユーザーがいる理由は、AG.Q.Hub には機能があり、データベースに直接接続して、数十年分の実験データを見ることができるからです。それができれば、この分析を行うことができます。 |
| 実験計画を見たり、品種の履歴を確認したり、個々の実験のデータの分布を確認したり、blupsを計算したりすることができます。 |
| 予測値を作成します。予測値がわかれば、直接対決で |
| 比較、そして |
| 比較したら、直接比較してレポートの作成を開始できます。 |
| ここで、データのサブセット化とテーブルの構築を含むレポートを作成できるようにしたいと考えています。 |
| 視覚化により、ユーザーにとって作業がはるかに簡単になります。AG.Q.Hub で数回クリックするだけで、これらすべてが数秒以内に完了し、ユーザーがスプレッドシートやワークブックを使用していた過去数週間の時間を節約します。 |
| AG.Q.Hub のワークフローの概要を説明するために、レポートのデータを生成する 1 つのサイクルを示します。 |
| ユーザーは AG.Q.Hub にアクセスして、使用したいデータベース、実行したい分析やクエリの種類、および出力を選択します。 |
| そして、スタートをクリックすると、別のウィンドウが開き、クエリのパラメータ、クエリしたい実験、年、 |
| 確認したい特性や治療法を選択します。パラメータを選択して [OK] をクリックすると、これらのデータ テーブルにデータがポップアップ表示され、データ テーブルは... |
| AG.Q.Hubアドイン内では、すべてのデータテーブルがAG.Q.Hubのタブ内にきれいにまとめられています。そして、ここに私たちが持っている最新の機能のいくつかがあります |
| ユーザーは興味のある品種を入力して選択し、並べ替え、選択し、フィルタリングして、フィルタリングされた品種テーブルを作成できます。 |
| そして、これらのフィルタリングされたさまざまなテーブルを使用して、それらを Excel またはその他のドキュメントのレポートにエクスポートできます。 |
| 1 つの実験が完了したら、最初からやり直して別の一連の実験に進むことができます。必要な数の分析を行った後は、[キャンセル] をクリックします。 |
| 私たちはまだこれに取り組んでおり、進行中の作業ですが、ユーザーから多くの素晴らしいアイデアをいただいています。私たちがやりたいことは... |
| 私たちは常に、より多くのユーザーや研究拡張センターにこれを拡大しています。これは私たちにとって、これを構築するのに役立っています。それを行うにあたり、テンプレートをまとめることを検討しています。 |
| プログラムによって使用されるリリース テーブルのリリース... |
| これにより、ユーザーが直接比較表や品種リリース表を簡単に作成できるような出力表を構築できます。 |
| さらに、視覚化を追加して品種の比較を迅速に行うことで、作業をさらに簡単にしたいと考えています。植物育種家としての経験を持つ Anna は、この点に関して素晴らしいアイデアを持っています。 |
| 最後に、私たちは常に、ユーザーがクリックするとオプションが変わるなど、インターフェースをより動的にすることを考えています。 |
| 私の話は以上ですが、まずはこの短いビデオで、AG.Q.Hub が何をするのかについて、よりよく理解していただくために始めたいと思います。 |
| そしてカート、 |
| この度はこのような機会を頂きありがとうございます。 |
| さて、もう 1 つ、皆さんにお見せしたいことがあります。共有画面です。ユーザーにもう 1 つお見せしたいのは、AG.Q.Hub の最新の機能です。 |
| これが私たちが興奮していることです...これが私たちが向かっている方向です。ここにあるものは...ここにあるものは、ユーザーが選択とフィルタリングを行い、テーブルを作成したいものを作成すると... |
| テーブルを作成する際に使用する品種については、ダッシュボードを開いて、フィルタリングされた品種の中からチェック ラインとして使用するものを選択できるようにしています。 |
| たとえば、この歴史的な品種をチェック ラインとして設定し、新しいテスト ラインをそれらのチェック ラインと比較したいとします。 |
| そして、私たちが見たい特性の種類を選択します。現場で見た特性と、研究室で測定した特性、あるいは特性です。 |
| たとえば、病気の特性などです。そして、「テーブルの作成」をクリックすると、これらのテーブルが出力されます。時間を節約するために、今はそれを実行しません。 |
| しかし、それぞれの特性の表を出力することになります。 |
| それぞれの品種についてですが、まだ作業が必要なことがわかります。品種の名前を入れる必要がありますが、まだ作業中です。しかし、とても興奮しているので、終了する前にこれをお見せしたいと思いました。 |
| これが私たちが進む方向であり、このダッシュボードを基にしてこれらのテーブルを作成し続け、ユーザーが Excel に適した形式で出力できるように出力を作成していきます。 |
| さらにExcelやWordなどに出力してフォーマットし、この品種とこの品種を比較して直接比較できる視覚化を構築できます。私たちはこれらのダッシュボードを構築しています。私たちはこれにとても興奮しています。 |
| これをJMPコミュニティに紹介し共有できることをとても嬉しく思います。そして最後に、ノースダコタ州立大学の皆さんに感謝したいと思います。 |
| アンナ、ディディエ、リッチ、私、そして他のすべてのユーザー。 |
| どうもありがとう。 |
