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プロトコル検証のための免疫組織化学データ分析の自動化 (2023-EU-30MP-1318)

Cerba Research は、臨床試験向けに高品質で専門的な分析および診断ソリューションを提供するグローバル企業です。Cerba Research Montpellier は、患者の組織切片で選択したターゲットの発現を検出するカスタマイズされた免疫組織化学プロトコルを開発しています。臨床試験で使用するには、これらのプロトコルが規制当局の基準を満たし、貴重な患者のサンプルで一貫した結果が得られるようにする必要があります。評価されるパラメーターの多様性と、これらのカスタム プロトコルの実装で可能な評価の種類により、データ分析の自動化が必要になりました。さまざまな JMP® ツールのおかげで、ダッシュボードに統計データとグラフ データを含めることで、時間を節約し、プロトコル パフォーマンス レポートを均一化する自動分析を開発しました。JMP アドインとして提出されたこのプロセスは、ユーザー ワークフローに組み込まれ、手順が簡素化されました。

使用バージョン: JMP v16.1.0

こんにちは。 私の 名前 は マリー ジェリュス・デュラン そして 私は 働く のために C エルバリサーチ モンペリエ。 今日、 I 意思 見せる あなた どうやって 私たちは セット 上 オートメーション の 免疫組織化学 データ 分析 のために プロトコル 検証 で モンペリエ 使用して ジャンプ そして その ツール のように ダッシュボード そして アドイン 機能。

初め、 いくつかの 言葉 について セルバリサーチ、 その a 全世界 会社 と 機能 で 全て の 大陸。 ここ I 強調表示 で 黄色 の 部門 私は 働く のために。 その a 組織病理学 電子情報技術 部門。 として あなた できる 見る、 私は ベース で モンペリエ で フランス。W e また 他の ラボ で 私たち、 で 新しい ヨーク、 そして で 台湾 で 台北。

初め の 全て、 何 は 免疫組織 化学？ の 標的 の の 技術 は に 検出する タンパク質を標的とする 主に の上 a 組織 サンプル。 ここ あなた 持っている a スライス の a 組織、 のために 例、 いつ あなた する a 生検。 私たちは 意思 見て で の ターゲット の 興味 抗体を使用して、 どれの 意思 検出する の ターゲット。 これ 抗体 は 認識された による 別の 1つ どれの は 組み合わせた と クロマル フルオロホルム または アクティブ コンポーネント それ 許可する の 検出 の の ターゲット。 ここ あなた 見る、 のために 例、 これら 三つ コンポーネント は 強調表示、 意味 それ 抗体 バインド それ そして 私たちは できる 検出する それ。 後 の 実験、 私たちは できる できる 見て で の スライド 下 顕微鏡 または 使用して a スキャナー、 どれの 許可する 視覚化 そして 分析 の の 結果。

の上 の 次 スライド、 I ただ ズーム で それで あなた できる 見る より良い 何 それ 見た目 のように。 ここ その a 肌 サンプル そして あなた 持っている a 細胞 核 で 青 そして の ターゲット の 興味 で 赤。 1つ の 課題 内で 免疫組織 化学 そして 組織病理学 は それ あなた 持っている 多くの 可能 プロトコル、 着色料。 ここ の上 の 左、 その 二 違う 組織学的 着色料。 それ しない 関与する 抗体 のように I 見せる あなた、 しかし それ ただ 反応的な と の 違う コンポーネント の の ティッシュ。 あなた 見る ここ のために の 動く、 私たちは 持っている 五 色。 のために の 彼、 私たちは 持っている のみ 1つ 色、 しかし の 強度 依存する の上 の タイプ の 構造 あなた は 見ている で で の 組織。

の上 の 右、 あなた 持っている 二 免疫組織化学 プロトコル。 1つ 単体、 私たちは と呼ばれる それ、 なぜなら 私たちは 検出する のみ 1つ ターゲット、 そして その a クロモジェニック ここ。 その で 茶色。 の上 の トップ 右、 あなた 持っている a マルチプレックス。 H また 私たちは 検出する 多くの コンポーネント。 ここ その a 4階建て、 4つ ターゲット の上 の 同じ スライド、 そして それぞれ は 明らかにした による 違う 流れ の 仕事。 あなた 持っている 違う 色 のために それぞれ の の ターゲット。

の間で の これら 着色 検出 可能性、 それから あなた 持っている a 多数の 可能 分析 方法。 の スライド できる なれ 分析された による a 病理学者、 どれの 意思 与える 私たち 定性 または 半 定量的 データ、 または による 画像 分析、 どれの 意思 与える 私たち 定量的 データ。 別の 層 の それ は それ あなた できる 持っている 報告可能 パラメータ どれの は シングル。 のために 例、 もし あなた 持っている a シンプレックス、 あなた 検出する の ターゲット、 のみ 1つ ターゲット、 そして あなた 評価 のみ 1つ パラメータ のように パーセンテージ の ポジティブ 細胞、 のために 例、 または あなた できる 持っている 多くの。 のために 1つ ターゲット、 あなた できる 持っている の パーセンテージ の ポジティブ 細胞 そして a 特定の 組織学 スコア。 または もし あなた 持っている a マルチプレックス、 それから あなた できる 掛ける これ のために 全て ターゲット で の マルチプレックス。 それぞれ 報告 レベル パラメータ は ターゲット- 依存。 あなた できる 想像する それ 私たちは 持っている a 多く の 組み合わせ それ 私たちは できる 持っている に アクセス その間 私たちの 検証。

で セルバリサーチ M 皮むき器、 で 2022年、 私たちは 持っている a 小さい 一部、 のように 20 % の 私たちの プロジェクト 関連している に 動物。 私たちは は 勉強する 動物 サンプル。 の 他の プロジェクト だった の上 人間 サンプル。 の間で これ、 ほとんど の 彼らは 4つ 臨床的 試験 の の プロジェクト。 それは a とても [聞き取れない 00:04:56] . W e 持っている いくつかの その他 それ は 外 臨床的 試験、 a 四半期 の 彼ら、 そして a 小さい 部分、 3 % それ は キャップ 準拠しています。 キャップ は a 特定の 規制 のために 私たち。 それは に 知る それ 前に いる 使用済み で a 臨床的 トライアル、 私たちは すべき 示す それ 私たちの プロトコル それ 私たちは 発展した で モンペリエ 見せる 一貫性 で 結果 のために セクション の の 同じ サンプル。 もし 私たちは 分析する の サンプル で 違う タイプポイント、 のために 例、 の サンプル の 患者 関与した で の 勉強、 の 初め 年 すべき なれ の 同じ よりも で の 五 年 後。

の上 の 違う オートマトン、 私たちは 持っている で 私たちの異なる サイト、 そして いつ の サンプル は 分析された による 違う オペレーター または 病理学者。 これ 適用される a 厳格な 検証 によると に の 健康 代理店、 そして これ 検証 は 主に ベース の上 統計的 基準。

の 含意 のために の 会社 は それ 私たちは 必要 に 増加 の チーム メンバー に サポート の 増加 番号 の プロジェクト 私たちは 持っている それぞれ 年、 そして 私たちは 必要 a 普通 属 統計的 分析 パイプライン に なれ もちろん それ 私たちは 意思 与える 全て 私たちの クライアント の 同じ タイプ の 結果。 明らかに、 私たちは 必要 統計的 分析 道具、 そして その いつ 私たちは 選ぶ ジャンプ に サポート 私たちの 検証 の の プロトコル。

今日、 I 意思 見せる あなた のみ a 一部 の 何 私たちは は やっている なぜなら I しない 持っている 時間 に 見せる あなた すべて。 I 選んだ a とても 単純 例。 その 一種の 実験 私たちは する に 検証する の 精度 の の プロトコル、 意味 それ 私たちは チェック の イントララン , どれの は と呼ばれる 再現性 精度 以上 三つ スライド。 ここ は の 三つ 1つ 強調表示 で 紫 で の 同じ サイクル。 の 三つ スライド I 走る で の 同じ 時間、 彼らは 来る から の 同じ サンプル、 そして 私たちは ただ チェック それ 私たちは 持っている の 同じ データ。 の インターラン、 再現性、 テスト 以上 二 スライド 強調表示 で 青 で それぞれ サイクル。 で 合計、 私たちは 持っている 六 スライド 以上 三つ サイクル。

のために 報告可能 パラメータ、 I 意思 使用 の 画像 分析 データセット、 どれの は 定量的 データ そして いつもの より簡単に に 分析します。 私たちは 意思 持っている 二 報告可能 パラメータ のために 1つ ターゲット。

どうやって する あなた 始める？ 初め、 私たちは 必要 に 輸入 の データ。 I しない 知る もし あなた は おなじみ と それ。 しかし で 私たちの 場合、 私たちは 持っている データ どちらか から 言葉 文書、 それで 私たちは 使用 の 言葉 輸入 道具 利用可能 の上 ジャンプ コミュニティ Webサイト . I 置く の リンク ここ それで あなた できる 行く そして 探す それ また。 または 私たちは 輸入 データ から エクセル どちらか 直接 による オープニング の ファイル で ジャンプ または による 使用して の ジャンプ 道具 で エクセル。

のために これ プレゼンテーション、 ただ に なれ もっと早く、 I 作成する いくつかの スクリプト に ヘルプ 自分 に 集中 の上 の ダッシュボード 創造 後 それ、 どれの 意思 取る もっと 時間。 しかし これ は ただ いくつかの スクリプト そして ただ に なれ もっと早く、 しかし I 意思 ない 開発する の中へ それ それから。 ここ I 意思 開ける a データ テーブル から プロジェクト X ここ。 として あなた できる 見る、 その a とても 単純 テーブル。 I 持っている 4つ 列 と の 検証、 の スライド ID、 どれの は 内部 スライド 数字、 そして の データセット のために 私の 二 報告可能 パラメータ。 これ データ 続く なぜなら 彼らは 来る から 画像 分析。

一度 I 持っている これ、 I 意思 必要 に 準備する 私の データ。 その a ほとんど 時間 消費する 一部 の 分析 データ。 また、 その なぜ I 持っている a スクリプト。 あなた 見る の 五 列 どこ I した。 の サンプル に なれ できる に 相関する それぞれ データ に の 同じ サンプル、 どれの は a 一部 の の スライド ID 私たちは 持っている 内部的に。 I ただ 得る a 式 ここ に ヘルプ 自分 に する それ。 の スライド 番号、 どれの は の 最後 数字 の の スライド ID、 そして の スライド 注文、 の 1、 2、 3、 4、 5、 6、 7 のために それぞれ サンプル。 ありがとう に これ スライド 注文、 I だろう 言う、 I 埋め込む の リピータ。 の 三つ 初め スライド どれの だった 滞在 で の 同じ サイクル のために リピータ、 そして 二 初め スライド の それぞれ サイクル のために 生殖能力 テスト。

ここ I 持っている 全て の 情報 必要 に する 私の 分析。 I 行く 戻る に 私の ジャーナル、 そして 私たちは 意思 欲しい に する の ダッシュボード 質問。 I まだ 持っている いくつかの 手順 に する 前に それ なぜなら I だろう のように に 持っている 全て の 分析 I 欲しい に 置く で の ダッシュボード。 ここ は の 二 少し テーブル あなた 見る どこ 私たちは は 必須 に 分析する の 履歴書 の 私たちの プロトコル のために それぞれ サンプル のために 再現性。 I 選択された のみ の 三つ 初め スライド ありがとう に の 地元 データ フィルター。 の 同じ のために 再現性、 どこ あなた 見る I 持っている の スライド から の 再現性 カラム。

ここ は の データ それ I 必要。 これ データ I 更新されました 彼ら で ここ。 あなた 見る I 持っている 多くの もっと 列 今。 その より簡単に に 探す の 名前 ここ。 I 持っている の サンプル 履歴書 のために 再現性、 のために 報告可能 パラメータ 1 そして 2、 そして それから の 同じ のために 再現性 のために の 二 パラメータ、 そして それから I する の 平均 の 両方 サンプル のために それぞれ の これら 列。 ここ、 全て の データ I 意思 必要 に 埋め込む で 私の ダッシュボード。 I できる クロス これ テーブル。 I しない 必要 彼ら もう。

I 意思 今 する の グラフ そして テーブル それ 意思 本当に フィット で の ダッシュボード。 また、 何 I 欲しい に 見せる に の クライアント は の 分布 の の データ のために 再現性。 I 置く として 良い の 標準 偏差 そして の 平均。 いつもの、 その かわいい 良い ここと のために 再現性 どこ I 持っている 全て 私の 六 スライド。 それから I だろう 置く a テーブル と a 履歴書 のために それぞれ サンプル のために 再現性 そして の 再現性 の上 の 左 のために の 初め パラメータ そして の上 の 右 のために の 2番 1つ。 の 同じ 概要 のために の 平均 の の 二 サンプル。

これら は の 4つ 一部 I 欲しい に 見せる の上 私の ダッシュボード。 I 意思 見せる あなた どうやって それ 見た目 のように。 I 欲しい に 得る 何か のように それ。 これ は 頻繁 I した それ I できる 見せる それ、 の 二 グラフ そして の 二 テーブル。 その 何 I だろう 見せる あなた どうやって に する 今。 あなた 見る それ 全て の グラフ は に の 同じ データ テーブル、 ごめん、 そして その 多くの より簡単に に する の ダッシュボード 後。 I 保存された として 良い 全て の スクリプト それで I できる やり直す 彼ら いつでも I 欲しい。 I 意思 作成する a 新しい ファイル、 新しい ダッシュボード。 あなた 持っている 多くの テンプレート。 いつもの 始める から 空白 そして ただ あなた 持っている に 置く で 何 あなた 欲しい に 見る。 時々 その a 少し 難しい なぜなら その 小さい、 しかし 私たちは いつも 管理 に 探す 私たちの 方法。

私の テーブル で の 底、 あなた ただ 落とす 彼ら どこ あなた 欲しい に 持っている 彼ら。 その かわいい 単純。 あなた できる 変化 の それぞれの名前 一部、 それで I 意思 ない する それ ただ。 しかし あなた できる 見る それ あなた できる 編集 全て の 部品。 あなた できる 走る あなたの スクリプト そして それから 与える あなた の ダッシュボード。 その かわいい 似ている に 何 I 示した あなた 前に。 I 持っている 私の 二 テーブル で の 底 そして 私の 二 グラフ で の トップ ここ。 I 持っている 反転した の 二、 それで I いつもの 好む に 始める と 繰り返す それ。 I 意思 ただ スイッチ 彼ら。 もし I 置く それ どこ 何か だった すでに、 彼らは ただ スイッチ。

ここ 私たちは は。 これ は の レイアウト I 欲しい、 それで その 良い。 後、 あなた できる 遊ぶ に 見る より良い、 もっと または 少ない、 の の テーブル、 そして その他。 しかし これ は ただ のために ビジュアル [聞き取れない 00:15:00] プロセス。 それから、 わかった、 今 私たちは 持っている ダッシュボード、 しかし それ だろう なれ もっと 興味がある もし 私たちは できる 直接 行く のために の ダッシュボード いつ あなた 持っている 全て あなたの データ あなた 欲しい の上 の ダッシュボード そして クリック そして あなた 持っている a ダッシュボード。 のために それ、 私たちは ただ 必要 に する の 追加- で。 その とても 単純。 ありがとう に の 魔法 三角形、 I 電話 それ、 の 赤 三角形 ここ。 あなた クリック 保存 スクリプト そして ただ に 追加-I n. それから それ 意思 作成する a スクリプト それ 意思 する の 同じ ダッシュボード また。

さあ 行く 戻る に の データ テーブル。 I 意思 近い これ 1つ。 あなた は もちろん それ の 1つ それ あなた 意思 見る は これじゃない 1つ。 ごめん、 I すべきではない 持っている 閉鎖 それ 前に やっている の ダッシュボード。 I 意思 ただ 使用 これ に なれ もっと早く そして ない に 作成する それ また。 ここ、 もし あなた クリック の上 の 赤、 保存 スクリプト、 に 追加 -で。 それから これ は の 名前 あなた 意思 持っている で の 追加- で リスト、 しかし その に 管理 あなたの 追加- イン、 I だろう 言う、 しかし その ない の 1つ それ 意思 形 外 で の アドイン タブ で ジャンプ。 の 名前 それ あなたは で の アドイン タブ は これ 1つ。 のために 今日、 I だろう ただ 電話 それ テスト それで I 知る どれの 1つ は これ。 保存。 あなた 見る ここ、 あなた 持っている 全て の スクリプト 使用済み による ジャンプ に する これ ダッシュボード、 そして I 意思 保存 それ で 私たちの プロジェクト X. ここ あなた 見る それ 取る の 名前 の上 の 初め タブ ダッシュボード のみ。

I 保存 それ。 ここ I 持っている これ 両方 チェック インストール 後 保存、 それで それ だった すでに 置く で 私の アドイン リスト。 もし の 箱 だった ない チェック、 それから あなた 持っている ただ に 行く に の 位置。 あなた 保存 あなたの ファイル そして クリック の上 それ そして その インストールされました。 今 I できる 近い これ ダッシュボード .

I 持っている 作成された 私の すでに補完しています。 今、 どうやって に 使用 それ？ I ただ 行った a 少し もっと早く。 もし あなた 開ける それ、 それ インストールします。 として I 持っている それ すでに、 I 意思 ない 始める それ。 その ただ 下 それ。 もし あなた 行く に ビュー、 アドイン、 ごめん、 ダッシュボード、 そして 登録解除、 その ない 消去されました。 I 意思 探す それ また いつ I 行く に 私の プロジェクト。 ここ あなた 見る I 持っている それ。 もし I ダブル -クリック、 それ 聞く 自分 もし I 欲しい に インストール それ。 もちろん、 I 欲しい に インストール それ。 その 戻る ここ また。 あなた できる 共有 それ。 あなた ただ 持っている に コピー の 同じ ファイル I クリックした の上 そして ペースト それ で a 共有 フォルダ または 送信 それ に a ジャンプ ユーザー 同僚。 あなた できる 修正する それ。 のために これ あなた 持っている に 行く で 開ける。 また、 これ は の ダッシュボード しかし それから の 黒 クリック これ 時間、 ただ 行く の上 の 矢印 ここ に 開ける そして 開ける 使用して アドイン ビルダー。

ここ あなた 行く 戻る に の 初め 時間 ウィンドウ どこ あなた 持っている あなたの スクリプト ここ、 そして あなた できる どちらか 編集 の スクリプト または 置く 他の 機能 それ I しない 本当に 使用、 に なれ 正直。 しかし あなた 持っている 多くの 機能。 私は もちろん あなた 意思 探す もっと 情報 の上 ジャンプ Webサイト について それ。 これ、 のために 例、 意思 許可する あなた に 置く 全て の 準備 ステップ で の 同じ 補体。 いつ あなた 走る、 すべて は 終わり で の 同じ 時間。 これ は それ。

で 結論、 使用して これ ダッシュボード そして アドイン 機能 許可する 私たち に 持っている レポート 一貫性 なぜなら 私たちは 持っている いつも の 同じ セット 上 の 結果 に 送信 に の クライアント。 私たちは 増加 の トレーサビリティ。 ありがとう として 良い のために の 使用 の の スクリプト なぜなら 私たちは は もちろん それ 私たちは は 全て やっている の 同じ。 I tの a 素晴らしい 時間 セーバー なぜなら として あなた 言う、 I ただ 持っている に クリック の上 1つ ボタン そして I 持っている 私の ダッシュボード。 もし あなた 組み合わせる これ と a 正確なタイミング。 全て の データ 準備、 それから あなた 持っている あなたの テーブル、 あなた クリック の上 1つ ボタン、 そして あなた 持っている すべて 終わり。 その a 素晴らしい 時間 セーバー。

その 全て I 望んだ に 見せる あなた 今日。 I 希望 あなた 楽しむ それ。 もし あなた 持っている どれでも 質問、 しない ためらう に 到着 外 に 自分 どちらか による メール— あなた 持っている の メール の上 の 初め スライド ここ- または を通して の ジャンプ コミュニティ。 感謝 あなた。

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