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Automatizzazione dell'analisi dei dati immunoistochimici per la convalida del protocollo (2023-EU-30MP-1318)

Cerba Research è un'azienda globale che fornisce soluzioni analitiche e diagnostiche specializzate di alta qualità per le sperimentazioni cliniche. Cerba Research Montpellier sviluppa protocolli di immunoistochimica personalizzati per rilevare l'espressione di target selezionati sulle sezioni di tessuto dei pazienti. Per essere utilizzati nelle sperimentazioni cliniche, questi protocolli devono soddisfare i criteri delle agenzie di regolamentazione per garantire che il protocollo consenta risultati coerenti sui preziosi campioni dei pazienti. Con la diversità dei parametri valutati e i tipi di valutazione possibili nell'implementazione di questi protocolli personalizzati, l'automazione dell'analisi dei dati è diventata una necessità. Grazie a vari strumenti JMP®, abbiamo sviluppato un'analisi automatizzata che fa risparmiare tempo e omogeneizza i report sulle prestazioni del protocollo includendo dati statistici e grafici in una Dashboard. Questo processo, inviato come componente aggiuntivo JMP, è stato incorporato nei nostri flussi di lavoro utente, facilitando così le nostre procedure.

Versione utilizzata: JMP v16.1.0

Ciao. Mio nome È Maria Gerus-Durand, E Io sono lavorando per C Ricerca sull'erba Montpellier. Oggi, I Volere spettacolo Voi Come Noi impostato su automazione Di immunoistochimica dati analisi per protocollo convalida In Montpellier usando Il JMP E suo utensili Piace pannello di controllo E componente aggiuntivo funzioni.

Primo, Alcuni parole Di Ricerca Cerba, suo a in tutto il mondo azienda con capacità In Tutto IL continenti. Qui I evidenziato In giallo IL dipartimento Io sono lavorando per. Suo a Istopatologia EHC Dipartimento. COME Voi Potere Vedere, Io sono basato In Montpellier In Francia. W e avere anche altro laboratori In NOI, In Nuovo Città di York, E In Taiwan In Taipei.

Primo Di Tutto, Che cosa È immunoistochimica chimica? IL scopo Di IL tecnica È A rilevare proteine ​​bersaglio principalmente SU a tessuto campione. Qui Voi Avere a fetta Di a tessuto, per esempio, Quando Voi Fare a biopsia. Noi Volere Aspetto A IL obiettivi Di interesse utilizzando anticorpi, Quale Volere rilevare IL bersaglio. Questo anticorpo È riconosciuto di un altro uno Quale È combinato con cromatico fluoroform O attivo componenti Quello permettere IL rilevamento Di IL bersaglio. Qui Voi Vedere, per esempio, questi tre componenti Sono evidenziato, Senso Quello anticorpi legamento Esso E Noi Potere rilevare Esso. Dopo IL sperimentare, Noi Potere Potere Aspetto A IL diapositive Sotto microscopio O usando a scanner, Quale permettere visualizzazione E analisi Di IL risultati.

SU IL Prossimo diapositiva, I Appena ingrandire In COSÌ Voi Potere Vedere Meglio Che cosa Esso sembra Piace. Qui suo a pelle campione E Voi Avere a cella nucleare In blu E IL bersaglio Di interesse In rosso. Uno Di le sfide entro immunoistochimica chimica E istopatologia È Quello Voi Avere molti possibile protocolli, coloranti. Qui SU IL Sinistra, suo due diverso istologico coloranti. Esso non lo fa coinvolgere anticorpi Piace I spettacolo Voi, Ma Esso Appena reattivo con IL diverso componenti Di IL tessuti. Voi Vedere Qui per IL MOSSA, Noi Avere cinque colori. Per IL LUI, Noi Avere soltanto uno colore, Ma IL intensità dipende SU IL tipo Di struttura Voi Sono guardare A In IL tessuto.

SU IL Giusto, Voi Avere due immunoistochimica protocollo. Uno semplice, Noi chiamato Esso, Perché Noi rilevare soltanto uno bersaglio, E suo a cromogenico Qui. Suo In marrone. SU IL superiore Giusto, Voi Avere a multisala. H Anche Noi rilevare molti componenti. Qui suo a quadrilocale, quattro obiettivi SU IL Stesso diapositiva, E ogni È rivelato di diverso fluire Di lavoro. Voi Avere diverso colore per ogni Di IL obiettivi.

Tra Di questi colorazione rilevamento possibilità, Poi Voi Avere a moltitudine di possibile analisi metodo. IL diapositive Potere Essere analizzato di a patologo, Quale Volere Dare noi qualitativo O semi- quantitativo dati, O di immagine analisi, Quale Volere Dare noi quantitativo dati. Un altro strato Di Quello È Quello Voi Potere Avere segnalabile parametri Quale Sono separare. Per esempio, Se Voi Avere a semplice, Voi rilevare IL obiettivi, soltanto uno bersaglio, E Voi valutare soltanto uno parametro Piace percentuale Di positivo cellule, per esempio, O Voi Potere Avere molti. Per uno bersaglio, Voi Potere Avere IL percentuale Di positivo cellule E a specifico istologia punto. O Se Voi Avere a multisala, Poi Voi Potere moltiplicare Questo per Tutto obiettivi In IL multisala. Ogni rapporto livello parametro È bersaglio- dipendente. Voi Potere immaginare Quello Noi Avere a quantità Di combinazione Quello Noi Potere Avere A accesso durante Nostro convalide.

In Ricerca Cerba M pelapatate, In 2022, Noi Avere a piccolo parte, Piace 20 % Di Nostro progetto imparentato A animali. Noi Sono studiando animale campioni. IL altro progetti erano SU umano campioni. Tra Questo, maggior parte Di loro sono quattro clinico prove Di IL progetto. Questo è a molto [inudibile 00:04:56] . W e Avere Alcuni altri Quello Sono al di fuori clinico prove, a trimestre Di loro, E a piccolo porzione, 3 % Quello Sono CAP compiacente. CAP È a specifico regolamento per NOI. È A Sapere Quello Prima essendo usato In a clinico prova, Noi Dovrebbe dimostrare Quello Nostro protocollo Quello Noi sviluppato In Montpellier spettacolo coerenza In risultati per sezione Di IL Stesso campione. Se Noi analizzare IL campione A diverso digitare punti, per esempio, IL campioni Di pazienti coinvolto In IL studio, IL Primo anno Dovrebbe Essere IL Stesso di In IL cinque anni Dopo.

SU IL diverso automi, Noi Avere A la nostra diversità siti, E Quando IL campioni Sono analizzato di diverso operatori O patologi. Questo si applica a rigoroso convalida secondo A IL salute agenzia, E Questo convalida È principalmente basato SU statistico criterio.

IL implicazione per IL azienda È Quello Noi Bisogno A aumento IL squadra membri A supporto IL crescente numero Di progetti Noi Avere ogni anno, E Noi Bisogno a normale genere statistico analisi conduttura A Essere Sicuro Quello Noi Volere Dare Tutto Nostro clienti IL Stesso tipo Di risultati. Ovviamente, Noi Bisogno statistico analisi attrezzo, E suo Quando Noi scegliere Il JMP A supporto Nostro convalida Di IL protocollo.

Oggi, I Volere spettacolo Voi soltanto a parte Di Che cosa Noi Sono facendo Perché I non Avere tempo A spettacolo Voi qualunque cosa. I scelto a abbastanza semplice esempio. Suo una specie di sperimentare Noi Fare A convalidare IL precisione Di IL protocollo, Senso Quello Noi controllo IL intra-corsa , Quale È chiamato ripetibilità precisione Sopra tre diapositive. Qui Sono IL tre quelli evidenziato In viola In IL Stesso ciclo. IL tre diapositive I correre A IL Stesso tempo, Essi Venire da IL Stesso campione, E Noi Appena controllo Quello Noi Avere IL Stesso dati. IL inter-corsa, riproducibilità, test Sopra due diapositive evidenziato In blu In ogni ciclo. In totale, Noi Avere sei diapositive Sopra tre cicli.

Per segnalabile parametri, I Volere utilizzo UN immagine analisi insieme di dati, Quale È quantitativo dati E Generalmente Più facile A analizzare. Noi Volere Avere due segnalabile parametri per uno bersaglio.

Come Fare Voi inizio? Primo, Noi Bisogno A importare IL dati. I non Sapere Se Voi Sono familiare con Quello. Ma In Nostro caso, Noi Avere dati O da Parola documenti, COSÌ Noi utilizzo IL Parola Importare Attrezzo disponibile SU Il JMP comunità sito web . I Mettere IL collegamento Qui COSÌ Voi Potere andare E Trovare Esso Ancora. O Noi importare dati da Eccellere O direttamente di apertura IL file In Il JMP O di usando IL Il JMP attrezzo In Eccellere.

Per Questo presentazione, Appena A Essere Più veloce, I creare Alcuni sceneggiatura A aiuto Me A messa a fuoco SU IL pannello di controllo creazione Dopo Quello, Quale Volere Prendere Di più tempo. Ma Questo È Appena Alcuni sceneggiatura E Appena A Essere Più veloce, Ma I Volere non sviluppare in Esso Poi. Qui I Volere aprire a dati tavolo da Progetto X Qui. COME Voi Potere Vedere, suo a abbastanza semplice tavolo. I Avere quattro colonne con IL convalida, IL diapositiva ID, Quale Sono interno diapositiva numeri, E IL insieme di dati per Mio due segnalabile parametri. Questo dati continua Perché Essi Venire da immagine analisi.

Una volta I Avere Questo, I Volere Bisogno A preparare Mio dati. Suo a maggior parte tempo consumando parte Di analisi dati. Ancora, suo Perché I Avere a sceneggiatura. Voi Vedere IL cinque colonne Dove I fatto. IL campione A Essere capace A correlare ogni dati A IL Stesso campione, Quale È a parte Di IL diapositiva ID Noi Avere internamente. I Appena Ottenere a formula Qui A aiuto Me A Fare Quello. IL diapositiva numero, Quale Sono IL scorso cifre Di IL diapositiva ID, E IL diapositiva ordine, IL 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 per ogni campione. Grazie A Questo diapositiva ordinazione, I volevo Dire, I attrezzo IL ripetitore. IL tre Primo diapositive Quale erano rimanere In IL Stesso ciclo per ripetitore, E due Primo diapositive Di ogni ciclo per riproduttività test.

Qui I Avere Tutto IL informazioni necessario A Fare Mio analisi. I andare Indietro A Mio diario, E Noi Volere Volere A Fare IL pannello di controllo domanda. I Ancora Avere Alcuni passi A Fare Prima Quello Perché I volevo Piace A Avere Tutto IL analisi I Volere A Mettere In IL pannello di controllo. Qui Sono IL due poco tavolo Voi Vedere Dove Noi Sono necessario A analizzare IL Curriculum Vitae Di Nostro protocollo per ogni campione per ripetibilità. I selezionato soltanto IL tre Primo diapositive Grazie A IL locale dati filtro. IL Stesso per riproducibilità, Dove Voi Vedere I Avere IL diapositive da IL riproducibilità colonna.

Qui Sono IL dati Quello I Bisogno. Questo dati I aggiornato loro In Qui. Voi Vedere I Avere tanto Di più colonne Ora. Suo Più facile A Trovare IL nome Qui. I Avere IL campione Curriculum Vitae per ripetibilità, per segnalabile parametro 1 E 2, E Poi IL Stesso per riproducibilità per IL due parametri, E Poi I Fare IL Significare Di Entrambi campioni per ogni Di questi colonne. Qui, Tutto IL dati I Volere Bisogno A attrezzo In Mio pannello di controllo. I Potere attraverso Questo tavolo. I non Bisogno loro più.

I Volere Ora Fare IL grafici E tavoli Quello Volere Veramente adatto In IL pannello di controllo. Ancora, Che cosa I Volere A spettacolo A IL cliente È IL distribuzione Di IL dati per ripetibilità. I Mettere COME BENE IL standard deviazione E IL Significare. Generalmente, suo bello Bene qui e per riproducibilità Dove I Avere Tutto Mio sei diapositive. Poi I volevo Mettere a tavolo con a Curriculum Vitae per ogni campione per ripetibilità E IL riproducibilità SU IL Sinistra per IL Primo parametro E SU IL Giusto per IL secondo uno. IL Stesso delineare per IL Significare Di IL due campioni.

Questi Sono IL quattro parte I Volere A spettacolo SU Mio pannello di controllo. I Volere spettacolo Voi Come Esso sembra Piace. I Volere A ottenere qualcosa Piace Quello. Questo È Spesso I fatto Quello I Potere spettacolo Esso, IL due grafici E IL due tavolo. Suo Che cosa I volevo spettacolo Voi Come A Fare Ora. Voi Vedere Quello Tutto IL grafici Sono A IL Stesso dati tavolo, Scusa, E suo tanto Più facile A Fare IL pannello di controllo Dopo. I salvato COME BENE Tutto IL copioni COSÌ I Potere rifare loro ogni volta I Volere. I Volere creare a nuovo file, nuovo pannello di controllo. Voi Avere molti modelli. Io Generalmente inizio da vuoto E Appena Voi Avere A Mettere In Che cosa Voi Volere A Vedere. A volte suo a morso difficile Perché suo piccolo, Ma Noi Sempre maneggio A Trovare Nostro modo.

Mio tavolo A IL metter il fondo a, Voi Appena gocciolare loro Dove Voi Volere A Avere loro. Suo bello semplice. Voi Potere modifica IL nomi di ciascuno parte, COSÌ I Volere non Fare Esso Appena. Ma Voi Potere Vedere Quello Voi Potere modificare Tutto IL parti. Voi Potere correre tuo sceneggiatura E Poi Dare Voi IL pannello di controllo. Suo bello simile A Che cosa I ha mostrato Voi Prima. I Avere Mio due tavoli A IL metter il fondo a E Mio due grafici A IL superiore Qui. I Avere invertito IL due, COSÌ I Generalmente prefer A inizio con ripetere Quello. I Volere Appena interruttore loro. Se I Mettere Esso Dove qualcosa era Già, Essi Appena interruttore.

Qui Noi Sono. Questo È IL disposizione I Volere, COSÌ suo Bene. Dopo, Voi Potere giocare A Vedere Meglio, Di più O meno, Di IL tavolo, E ecc. Ma Questo È Appena per visivo [inudibile 00:15:00] processo. Poi, Va bene, Ora Noi Avere pannello di controllo, Ma Esso volevo Essere Di più interessato Se Noi Potere direttamente andare per IL pannello di controllo Quando Voi Avere Tutto tuo dati Voi Volere SU IL pannello di controllo E clic E Voi Avere a pannello di controllo. Per Quello, Noi Appena Bisogno A Fare UN aggiungere- In. Suo abbastanza semplice. Grazie A IL magia triangolo, I chiamata Esso, IL rosso triangolo Qui. Voi clic Salva Sceneggiatura E Appena A Aggiungi-I N. Poi Esso Volere creare a sceneggiatura Quello Volere Fare IL Stesso pannello di controllo Ancora.

Andiamo andare Indietro A IL dati tavolo. I Volere vicino Questo uno. Voi Sono Sicuro Quello IL uno Quello Voi Volere Vedere È non questo uno. Scusa, I non dovrebbe Avere Chiuso Esso Prima facendo IL pannello di controllo. I Volere Appena utilizzo Questo A Essere Più veloce E non A creare Esso Ancora. Qui, Se Voi clic SU IL rosso, Salva Sceneggiatura, A Aggiungere -In. Poi Questo È IL nome Voi Volere Avere In IL aggiungere- In lista, Ma suo A maneggio tuo aggiungere- dentro, I volevo Dire, Ma suo non IL uno Quello Volere figura fuori In IL componente aggiuntivo scheda In Italiano: IL nome Quello tu sei In IL componente aggiuntivo scheda È Questo uno. Per Oggi, I volevo Appena chiamata Esso Test COSÌ I Sapere Quale uno È Questo. Salva. Voi Vedere Qui, Voi Avere Tutto IL sceneggiatura usato di Il JMP A Fare Questo pannello di controllo, E I Volere salva Esso In Nostro Progetto X. Qui Voi Vedere Esso Prendere IL nome SU IL Primo scheda Pannello di controllo soltanto.

I salva Esso. Qui I Avere Questo Entrambi tic tac Installare Dopo salva, COSÌ Esso era Già Mettere In Mio componente aggiuntivo lista. Se IL scatola era non spuntato, Poi Voi Avere Appena A andare A IL posizione. Voi salva tuo file E clic SU Esso E suo installato. Ora I Potere vicino Questo pannello di controllo .

I Avere creato Mio complemento già. Ora, Come A utilizzo Esso? I Appena andato a morso Più veloce. Se Voi aprire Esso, Esso installa. COME I Avere Esso Già, I Volere non inizio Esso. Suo Appena Sotto Esso. Se Voi andare A Visualizzazione, Componenti aggiuntivi, Scusa, Pannello di controllo, E Annullare la registrazione, suo non cancellato. I Volere Trovare Esso Ancora Quando I andare A Mio progetto. Qui Voi Vedere I Avere Esso. Se I raddoppiare -clic, Esso chiedere Me Se I Volere A installare Esso. Sicuro, I Volere A installare Esso. Suo Indietro Qui Ancora. Voi Potere condividere Esso. Voi Appena Avere A copia IL Stesso file I cliccato SU E impasto Esso In a condiviso cartella O Inviare Esso A a Il JMP utente collega. Voi Potere modificare Esso. Per Questo Voi Avere A andare In Aprire. Ancora, Questo È IL pannello di controllo Ma Poi IL nero clic Questo tempo, Appena andare SU IL freccia Qui A aprire E Aprire usando Componente aggiuntivo Costruttore.

Qui Voi andare Indietro A IL Primo tempo finestra Dove Voi Avere tuo sceneggiatura Qui, E Voi Potere O modificare IL sceneggiatura O Mettere altro funzioni Quello I non Veramente utilizzo, A Essere onesto. Ma Voi Avere molti funzioni. Io sono Sicuro Voi Volere Trovare Di più informazioni SU Il JMP sito web Di Quello. Questo, per esempio, Volere permettere Voi A Mettere Tutto IL preparazione fare un passo In IL Stesso complemento. Quando Voi correre, qualunque cosa È Fatto A IL Stesso tempo. Questo È Esso.

In conclusione, usando Questo pannello di controllo E componente aggiuntivo funzioni permettere noi A Avere relazioni coerenza Perché Noi Avere Sempre IL Stesso impostato su Di risultati A Inviare A IL clienti. Noi aumento IL tracciabilità. Grazie COME BENE per IL utilizzo Di IL copioni Perché Noi Sono Sicuro Quello Noi Sono Tutto facendo IL Stesso. I è a Grande tempo risparmiatore Perché COME Voi Dire, I Appena Avere A clic SU uno pulsante E I Avere Mio pannello di controllo. Se Voi combinare Questo con a tempi di precisione. Tutto IL dati preparazione, Poi Voi Avere tuo tavolo, Voi clic SU uno pulsante, E Voi Avere qualunque cosa Fatto. Suo a Grande tempo risparmiatore.

Suo Tutto I ricercato A spettacolo Voi Oggi. I Speranza Voi Godere Esso. Se Voi Avere Qualunque domanda, non esitare A portata fuori A Me O di e-mail- Voi Avere IL e-mail SU IL Primo diapositiva Qui- O Attraverso IL Il JMP comunità. Grazie Voi.

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