Salut tout le monde, merci pour réglage dans.
Mon nom est Anderson Mayfield,
et Je suis a cœur récif scientifique fonctionnement dans Sud Floride.
Sur le suivant 45 minutes ou donc, Je suis en allant à parler à toi
à propos quelques passionnant recherche J'ai a été faire entièrement
dans le JMP Pro suite sur tenter à activer corail récif triage
avec machine apprentissage.
Donc, à donner toi un contour de quoi Je suis en allant à être discuter aujourd'hui,
Je suis en allant à donner toi a bref aperçu
de quelques problèmes parement corail récifs, le écosystème I étude.
Je vais à donner toi a petit peu de a résumer
de le parler I a donné dans le JMP Découverte 2021 sommet
comme Bien comme le 2020 sommet.
Et ce est quoi Je vais référer à comme le corail Vétérinaires approche,
dans lequel I était en essayant à faire prédictions
à propos le destins de individuel corail colonies.
À propos à mi-chemin à travers le parler, Je suis en allant à il suit
à quoi J'ai a été fonctionnement sur plus récemment,
lequel est tenter à trouver le résilient récifs,
lequel récifs dehors là sont en allant à être le ceux
que peut météo le tempête avec respect à climat changement
et sont en allant à être autour dans avenir millénaires.
Et ce approche Je vais référer à comme le pauvre épidémiologiste approche.
Donc I pense la plupart de toi probablement déjà
sont conscient de le motivation ou le besoin pour ce recherche.
Corail récifs sont dans mauvais forme.
Le raison est parce que, le simple corail animaux
que construire ces incroyable structures avoir a délicat complexe association
avec dinoflagellés de le famille symbiodyacie.
Ce permet eux à construire ces massif structures
que peut être vu depuis espace.
Le problème est, comme eau de mer températures obtenir plus chaud et plus chaud,
le symbiose pauses vers le bas, le algues,
le dinoflagellés sont Non plus long capable à photosynthétiser,
et ils partir le corail ou digéré ou en fait juste cesser à photosynthétiser.
Quoi ce moyens est le coraux lentement commencer affamé à la mort et ils périr.
Certainement étaient inquiet à propos autre facteurs de stress comme Bien,
des choses comme eau de mer pollution,
maladie, eutrophisation, sur développement de côtier régions.
Mais sur a vraiment mondial échelle,
climat changement est quoi étaient la plupart concerné avec,
particulièrement ces soulèvement eau de mer températures.
Mais pour bien sûr, certain coraux Faire mieux que autres.
Il y a Plus fort espèces,
il y a plus résistant génotypes dans a espèces.
Toi pourrait même avoir cloner copains que sont dans fermer proximité à un un autre,
un de lequel pourrait le exigible à haut températures,
le autre volonté maintenir résilience.
Donc quoi lecteurs ce résilience dans ces plus robuste coraux
a a été quelque chose J'ai a été fonctionnement sur pour à propos 20 années maintenant.
Quoi J'ai a été en essayant à faire plus récemment
est pas juste expliquer quoi fait coraux résilient,
mais essayer à prédire lequel coraux que nous n'ont pas étudié encore
volonté être le ceux que pourrait hériter le Terre.
Donc Je suis en allant à donner a gentil de bref aperçu
de mon ancien approche.
I ne le faites pas vouloir à faire il sembler comme J'ai complètement abandonné
ce doubler de recherche,
mais comme tu vas voir là sont quelques problèmes avec il dans termes de c'est coût.
Le but aujourd'hui est à montrer toi gentil de le vieux chemin I était faire il
et alors ce transition à ce plus récent, moins cher, potentiellement plus mondial chemin.
Donc quoi I était faire avant, Je suis a moléculaire biologiste par entraînement,
I était en utilisant moléculaire et physiologique données depuis coraux
presque exclusivement à faire prédictif modèles
que serait alors donner moi a prédiction à propos le destin de le longévité,
le durée de vie de le corail.
Et ce est quoi I appel le corail vétérinaires approche,
parce que I était essentiellement faire quoi ton propre médecin serait faire.
I serait vérifier dans sur mon patients chaque maintenant et alors,
I serait prendre biopsies,
I serait profil eux en utilisant moléculaire stresser tests
que J'ai développé sur le années,
et alors I serait tentative à faire prédictions à propos
si ou pas ces coraux serait eau de Javel comme températures devenu plus chaud.
I pense c'est important à note que, le moléculaire composants de ce
sont particulièrement important parce que subcellulaire biologie
est en allant à refléter aberrant comportement ou stresser indicatif comportement
avant toi observer le changements avec le nu œil.
I ne le faites pas vouloir à attendez pour le coraux à eau de Javel
ou devenir malade ou commencer à bourbier désactivé leur tissus.
I vouloir à regarder à sublétal indications de stresser que arrivé semaines ou mois
avant ces catastrophique manifestations.
De même, ce est pourquoi nous avoir notre annuel examens physiques.
Toi vouloir à savoir, pour exemple si ton cholestérol niveaux sont haut
avant toi avoir a cœur attaque,
parce que si toi savoir toi avoir haut cholestérol
toi pourrait être capable à changement ton régime, prendre médicament, changement ton style de vie.
Toi pourrait être capable à contrecarrer ces gentil de plus grave signes
de santé déclin, comme a cardiaque arrêter.
C'est le même idée avec corail.
Nous vouloir à regarder à quelque chose à sublétal Balance
que nous peut faire quelque chose proactif.
Donc si nous savoir a corail est stressé basé sur c'est moléculaire signatures,
nous pourrait être capable à atténuer quelque chose à le locale échelle.
Nous peut pas être capable à lent le taux de climat changement
pour le saké de que corail, mais nous pourrait faire quelque chose
à le locale échelle que serait donner il a chance.
Quoi I était faire a peu années il y a
à a projet I porté dehors à Noah's Marin Laboratoire dans Miami, AOML ,
est I était bâtiment des milliers de neural réseaux dans JMP Pro 16,
dans lequel I était prise laboratoire coraux et champ coraux.
I était prise données depuis leur protéine niveaux.
Ce est a protéomique projet.
Alors nous avait notre champ test échantillons
où là étaient ces coraux dehors dans le champ dans le Floride Clés,
où nous n'a pas savoir si ils étaient en allant à eau de Javel
ou devenir malade ou périr.
Mais nous serait régulièrement prendre biopsies
et alors entrer le protéomique ou le protéine données
dans ces neural réseau modèles I fait dans JMP Pro,
et alors le modèles volonté cracher dehors a prédiction.
Alors le beauté de fonctionnement avec adulte coraux
est ils ne le faites pas se déplacer ce est en fait aussi a mauvais chose pour eux
parce que il moyens ils ne peut pas juste se déplacer loin quand conditions détériorer,
mais il moyens I savoir où à trouver eux
et alors I peut aller dehors là et voir,
si le neural réseaux prédictions étaient correct.
Ils en fait travaillé vraiment Bien.
Ce était un particulier espèces nous a fait ce gentil de preuve de concept avec
était appelé Orbicelle tofu.
Il apparence comme ce.
Avec ces neural réseau modèles
que étaient qualifié avec laboratoire et champ protéine données,
leur précision est à propos 92%.
Donc 92%, ce est environ 11 dehors de 12.
Donc 90, 95% de le temps, I peut utiliser le protéine données exclusivement
dire toi si ou pas a corail colonie volonté eau de Javel
comme températures obtenir vraiment chaud.
Typiquement dans Sud Floride, nous voir notre le plus élevé eau de mer températures
dans Août ou Septembre.
Dans 2019, I a pris quelques échantillons depuis différent récifs tout au long de le Clés.
Pour exemple, nous avoir ce échantillon ici, 6745 depuis Crocker Récif.
Nous essentiellement entré le protéomique données depuis que échantillon
mois dans avance de blanchiment, donc I pense un jour dans le hiver.
Le neural réseau depuis JMP Pro 16 est signalé comme être blanchiment sensible.
Nous est allé dehors là comme températures atteint 32 ou 33 C,
lequel est très stressant pour coraux,
et nous scie le colonie apparaissant comme ce.
Ce est mauvais nouvelles.
Il pourrait récupérer depuis ce, mais il probablement n'a pas.
Là était un autre corail depuis a site nous savoir
est typiquement plus résilient.
I signifier, ce est a énorme, ancien, plusieurs cent année vieux Orbicelle colonie.
Basé sur c'est protéine biomarqueurs
saisir dans le neural réseau depuis JMP Pro il était jugé blanchiment résistant.
Faible et voir, nous est allé dehors là
pendant le haut température événement que était meurtre autre coraux,
il apparence joli bien.
Toi ne le faites pas voir n'importe lequel signes de salut ou blanchiment.
De la même manière, nous avoir un autre site c'est aussi connu pour ayant
plus résilient coraux appelé le Rochers.
C'est protéine biomarqueur signatures étaient saisir dans le neural réseau modèle
et il était aussi jugé blanchiment résistant,
et ce en effet apparu à être le cas.
Ce est gentil de a carte de le Floride Clés,
notre marin laboratoires en haut dans Miami, donc pas aussi loin loin.
Ce est quelque chose J'ai recherché à faire pour a long temps,
en utilisant moléculaire signatures à attribuer a niveau de santé ou stresser,
le cas peut être
parce que ce pourrait activer corail récif triage
dans lequel nous pourrait prioriser notre conservation efforts.
Peut être ce exemple récif vers le bas ici que I a donné un A plus,
beaucoup de résilient coraux que ne le faites pas sembler dans péril de blanchiment ou maladie.
Peut être nous volonté laisser que récif être pour maintenant
et se concentrer notre efforts sur récif que était donné a grade de C.
Peut être le un que nous a donné a grade de F, peut être c'est aussi loin disparu
c'est pas même valeur notre efforts à essayer à sauvegarder il.
Mais I pense ces types de triage données sont en allant à être important
pour prioriser gestion décisions
et I était vraiment excité à propos ce projet.
Mais il y a a énorme problème, c'est vraiment cher et c'est lent.
C'est un corail espèces dans a relativement petit zone de le Terre
a pris trois années de mon temps, fonctionnement 80 heures a semaine,
quart de a million dollars à essentiellement construire
ceux neural réseau modèles.
La plupart de le du monde corail récifs sont dans le Indo Pacifique.
Le la plupart beau un sont trouvé dans ce région
que J'ai mis en évidence dans le bas, connu comme le Triangle de corail.
Ces sont zones que faire pas fonds corail récif recherche
à n'importe lequel super étendue,
ils simplement ne le faites pas avoir le humain pouvoir ou le financement.
Même si ils a fait, là sont des centaines, en haut à six ou 700 corail espèces
toi peut trouver sur ces récifs.
I volonté avoir passé loin long avant
I pourrait faire ce trier de analyse avec tous ces coraux,
même si I avait a couple de aides.
C'est aussi cher et c'est aussi lent.
Est là quelque chose autre nous pourrait faire que serait aide nous à savoir quelque chose
à propos le résilience, le longévité,
le stresser charges de ces récifs, sans ayant à faire ces fantaisie,
cher moléculaire analyses que exiger Bien qualifié personnel.
C'est quoi Je suis en allant à être parler à propos le repos de le temps.
Ce est quoi I appel
gentil de transition depuis a corail vétérinaire
qui est a obtenu a poignée de patients que I savoir leur santé dans super détail,
à pensée de moi-même plus comme un épidémiologiste.
Je suis en essayant à regarder pour plus mondial tendances dans corail santé
que I pourrait utiliser à faire modèles à propos leur avenir persistance
sur le Terre comme températures chaud.
Si toi souviens-toi avant,
I seulement utilisé le physiologique données à faire a prédictif modèle.
Maintenant quoi Je suis en allant à faire est Je suis en allant à essayer à intégrer
trois disparate données types dans fabrication a prédictif modèle.
Étaient en allant à regarder à environnemental données, et par que I signifier des choses comme,
eau de mer qualité, le taper de récif,
si le récif est exposé à le éléments,
le forme de le récif,
ceux types de physique propriétés, écologique données,
ce est essentiellement qu'est-ce que vie sur le récif.
Le coraux présent, comment beaucoup algues là est,
comment beaucoup poisson en direct sur le récif.
Ces sont tous des choses que pourrait être important pour récif santé,
et alors aussi le physiologique données depuis le coraux eux-mêmes.
Ce en fait a jamais a été fait avant.
La plupart personnes moniteur le santé de récifs basé sur seulement deux propriétés,
température et le abondance de corail, lequel est a bien commencer.
Mais comme Je vais montrer toi,
I pense ces modèles que sont plus complet et holistique
sont en allant à donner toi beaucoup
plus haut prédictif pouvoir.
Donc dans ce cas,
étaient pas simplement en essayant à prédire le résilience,
individuel corail colonies,
étaient regarder à a plus habitat ou entier écosystème niveau échelle,
c'est quoi étaient en essayant à prédire.
Donc comme a preuve de concept pour ce, J'ai a obtenu a bon données ensemble.
J'ai a été jouant avec depuis le Salomon Îles
c'est dans le sud-est partie de ce Corail Triangle
I mentionné que ce est où toi voir le la plupart biodiversité récifs,
le récifs avec le la plupart montant de corail et dans mon subjectif avis,
ce est où toi voir le la plupart beau récifs sur le planète.
Et I avait un incroyable opportunité à plonger tous sur ce région et au-delà
avec Khaled poubelle Sultan Vie Océans Fondation.
Il y a quelques années,
ils ont mené ce qu'on a appelé l'expédition mondiale sur les récifs coralliens,
il s'agissait de la plus grande étude de récifs coralliens jamais entreprise
Donc nous avait a entier équipe de scientifiques surveillance le récif
depuis le satellite niveau, depuis espace tous le chemin vers le bas dans le molécules
de le organismes résidant sur ces récifs.
Donc c'est a vraiment riche données ensemble.
Nous avoir bon récif cartes nous avons a été développement, nous avoir scaphandre autonome enquêtes,
plongeurs collectionner information à propos qu'est-ce que vie sur le récifs.
Étaient regarder à notre environnemental données, notre eau de mer qualité
c'est évidemment en allant à être important pour corail santé
et alors mon rôle, comme toi peut voir dans ce image ici
était dans échantillonnage coraux, juste prise minuscule petit biopsies
à profil avec quelques moléculaire dosages J'ai développé sur le dernier 20 années.
Et nous utilisé a différent espèces depuis le Caraïbes.
Nous utiliser ce corail appelé, Pocillopora acuta.
C'est gentil de intermédiairement sensible,
donc c'est gentil de dans le milieu, c'est gentil de a typique corail
mais plus surtout, c'est le modèle corail pour recherche.
Donc ce est le corail que nous savoir le la plupart à propos c'est physiologie.
Donc I serait encourager toi à soit vérifier dehors mon personnel site web,
coralreefdagnostics.com,
à vraiment voir comment incroyable a emplacement, Salomon Îles
et autre lieux nous visité étaient pour personnes que sont plus intéressé
dans le données.
Vie Océans Fondation a ce interactif carte le web serveur
c'est chargé avec haut résolution cartes et tous manière de données nous collecté,
c'est tous ouvrir accéder, c'est a vraiment bon ressource
et I était vraiment heureux à avoir a été a partie.
Donc enfin, 15 minutes dans, allons commencer faire quelque chose dans JMP.
Donc I mentionné nous avoir tous ces différent données types.
Nous avons a obtenu truc vie sur le bento,
nous avons a obtenu le écologique données, nous avons a obtenu le corail santé données.
Si I parlé à mon marin biologiste ami,
le d'abord chose ils sont en allant à vouloir à savoir est,
qu'est-ce que le corail couverture sur le récifs?
écologistes sont certes a petit peu aussi concentré sur abondance
comme toi peut voir plus tard dans le parler, selon sur comment le modèles courir.
Corail couverture seul ou corail abondance
est pas en fait a bien prédicteur de pauvre résilience.
A récif avec tonnes de corail n'a pas en fait faire n'importe lequel mieux
que a récif avec a peu corail.
Un de le raisons que pourrait être est,
a récif c'est a été décimé que peut seulement avoir a peu coraux gauche.
Ceux retardataires intrinsèquement adapté ou acclimaté
à peu importe tué désactivé leur frères donc ils en fait sont plus résilient.
Le récif pourrait être brut et laid et Non touristes peut vouloir à aller là,
mais c'est pas en fait a inférieur résilience.
Donc pour moi, Je suis plus intéressé dans qu'est-ce que en allant sur avec coraux.
La plupart personnes dans le champ sont plus obsédé avec corail couverture,
lequel est toujours important, même si c'est pas a bien métrique pour résilience,
toi toujours vouloir à savoir, où faire I trouver le récifs avec le la plupart corail?
Peut être c'est où toi vouloir à commencer [inaudible 00:16:11] .
Comment serait toi aller à propos faire ce dans JMP Pro?
Avec ce démo, Je suis en fait en allant à faire il dans JMP Pro 17,
a bêta version que J'ai a été démonstration pour a peu mois
mais toi pourrait juste comme facilement faire ce analyse dans JMP Pro.
Juste à se familiariser toi avec quoi le données ensemble apparence comme,
le rangées, il y a 272,
ces sont quoi nous appel transects.
Ces sont andains de le récif que nous arpenté.
Toi peut voir nous regardé à différent profondeurs.
Ces sont le environnemental données I mentionné avant.
Nous avons a obtenu spatial données tel comme coordonnées,
le taper de le récif, eau de mer qualité.
Et toi ne le faites pas besoin à inquiétude aussi beaucoup à propos ces abréviations,
mais ces sont juste le abréviations
pour le genres de organismes que étaient vie sur le récif.
Nous essentiellement plier eux dans 54 différent corail poubelles,
six algues poubelles, stérile substrat, donc ce est où rien est vie,
ce est en allant à être important à souviens-toi.
Alors autre invertébrés.
Ces sont le principal des choses que occuper le récif environnement.
J'ai exclu le poisson données parce que
I n'a pas avoir a bien organisé données ensemble à le moment,
mais I certainement vouloir à facteur que dans plus tard.
Mais allons regarder à ce en direct corail couverture.
Ce est tous le différent corail genres, somme ensemble.
Ce est a simple univarié analyse.
I vouloir à savoir, dans le Salomon Îles
qu'est-ce que contribuant la plupart à le variation dans corail couverture.
Et I pense a vraiment bien chemin à obtenir à ce vraiment simplement comme a d'abord aller,
est à prédire ton écran.
Dans ce analyse, le Y est en allant à être mon en direct corail couverture,
et I vouloir à regarder à ces onze environnemental paramètres que I pense
pourrait influence corail couverture dans le Salomon Îles.
Je suis en allant à mettre eux ici comme mon X.
Droite désactivé le un, toi peut voir profondeur.
C'est contribuant à à propos 40% de le variation dans le corail couverture.
À a marin biologiste ou a corail biologiste,
ce est pas en allant à être a surprenant trouver,
nous savoir différent parties de le monde, coraux préférer différent profondeurs.
La plupart de le la plupart luxuriant corail récifs tu es en allant à voir
sont depuis à propos 2 mètres vers le bas à à propos 30 mètres.
Allons-y voir où nous trouver le la plupart coraux dans le Salomon Îles.
Avec ce choisi, I ne le faites pas même avoir à aller dos à mon colonnes.
I peut juste aller directement dans ajuster Y par X, se déplacer le en direct corail couverture dans le ET.
Allons-y juste faire a simple Analyse de variance.
I en fait avoir mon profondeur comme poubelles, bien que J'ai a obtenu le continu données quelque part.
Nous voir depuis faire ce analyse de variance
a vraiment fort effet à travers ces quatre profondeur poubelles,
et étaient vision de manière significative plus haut corail couverture
dans le huit à douze mètre fenêtre.
Nous peut en fait regarder à ces deux Clés poste hoc test
et nous voir que huit à 12 avoir sur 50% corail couverture.
Une santé récif peut gamme depuis 20, 40,
50% est étonnamment impressionnant corail couverture,
tu es pas en allant à voir ce gentil de corail couverture dans beaucoup de le monde.
Mais pour maintenant c'est important à savoir que,
dans le Salomon Îles huit à 12 mètres est où toi trouver le la plupart corail.
Mais à moi que pourrait être bien pour a publication,
mais c'est pas vraiment que intéressant.
Donc si J'ai a obtenu collègues ou marin parc gestionnaires
OMS sont fonctionnement dans le Salomon Îles et ils dire,
Nous ne peut pas aller dehors là et enquête tous ces récifs.
I signifier, ce est a énorme zone. Quoi nous sondé était a baisse dans le seau.
Nous vouloir à faire prédictions à propos récifs nous n'a pas visite
que pourrait aussi avoir a parcelle de corail, que pourrait être important pour conservation.
Haut corail couverture récifs aussi où toi voir plus poisson et autre invertébrés.
Ce pourrait être important pour personnes que vouloir à était perspectives, pour exemple.
Maintenant quoi Je suis en allant à faire est Je suis en allant à faire quelque chose similaire,
mais plutôt que juste faire a simple prédicteur écran de corail couverture,
Je suis en allant à faire a modèle écran,
lequel I essayer à construire a simple prédictif modèle de corail couverture.
Allons-y aller dos dans JMP Pro 17.
Ce était a nouvellement- disponible fonctionnalité dans JMP Pro 16, I croire,
et est sans doute mon préféré fonctionnalité dans le entier emballer.
Quoi tu es en allant à voir ici,
Je suis en allant à ensemble ce en haut exactement le même chemin I a fait avant.
En direct corail couverture est mon ET,
et puis nous avons a obtenu notre 11 environnemental potentiel prédicteurs ici.
I avait JMP faire moi devant de temps a validation colonne
parce que c'est en allant à être important à valider ce.
Toi voir vers le bas ici a liste de tous le différent prédictif modèles toi peut test.
I vouloir à inclure tous de eux.
I vouloir à regarder à deux- chemin interactions comme Bien comme équations du second degré.
Je suis pas en allant à faire validation croisée k-fold
parce que I avoir a validation colonne.
Allons-y laisser ce courir.
C'est en allant à être regarder à ce assez grand ensemble de données.
C'est pas énorme. I pense beaucoup de toi fonctionnement dans industrie,
ce volonté en fait être a joli chétif données ensemble, mais c'est en allant à test il
avec tous ces différent modélisation types et c'est en allant à donner moi
ce bon résumé sortir.
I peut voir droite ici OMS gagné ce particulier bataille.
A généralisé régression avec avant sélection en utilisant a joli avancé
c'est regarder à équations du second degré, c'est regarder à factorielle combinaisons.
Il considéré a parcelle de différent paramètres dans le 68 échantillons
que étaient signalé comme validation.
Nous ne le faites pas en fait même avoir à aller dans ajuster modèle maintenant et essayer à rediffusion ce.
Nous peut courir il droite dehors de le modèle écran.
Il y a a parcelle de données, étaient pas en allant à tamiser à travers
tous de ce parce que, à être honnête,
ce était quelque chose I a fait sur le voler par conception.
J'ai jamais courir ce particulier modèle avant, juste parce que I pense que vraiment
souligne comment facile il est à plonger dans et commencer interprétation.
Il y a autre manières à obtenir à ce, mais Je suis paresseux,
donc I vouloir à voir quoi sont le la plupart important prédicteurs
que ce généralisé régression modèle trouvé.
Profondeur. Étaient pas surpris à voir profondeur là
parce que nous juste scie depuis le prédicteur écran que est important
dans conduite tendances dans corail couverture sur le Salomon Îles.
Récif taper fois latitude interaction, c'est peut être a petit peu Plus fort
à envelopper notre têtes autour.
Mais allons aller dans le profileur et voir quoi nous peut apprendre
dans plus détail à propos ce.
Le profileur est ici.
Laisser moi fermer quelques de ces des choses donc nous obtenir a petit peu plus chambre.
Agrandir ce. Le profileur est pas montrant moi
le récif taper fois latitude interaction sur le même parcelle par avec.
Mais montre quoi donc si toi juste regarder à récif taper dans isolement,
nous avons une barrière récifs, franges récifs, correctif récifs,
et ces autre lequel tendre à être ces pinacles
que viens en haut dehors de le océan profondeurs.
Nous ne le faites pas voir beaucoup différence dans corail couverture,
mais regarder comment le latitude doubler changements.
Ce est soulignant que latitude fois récif taper interaction.
Sur ici, étaient vision a très similaire parcelle
comme quand nous a fait le [inaudible 00:23:59] dans le ajuster Y par X.
Étaient vision 8- 12 mètres comme être le doux place
pour trouver le la plupart corail.
Mais quoi I pense est cool est à aller un étape plus loin
et faire ce désirabilité analyse.
Quoi Je suis en allant à faire, I pense c'est probablement en allant à souviens-toi
mon préréglages, mais allons juste commencer il depuis gratter.
I vouloir à dire JMP à donner moi le scénario
que serait résultat dans le le plus élevé en direct corail couverture,
parce que ce est quoi a marin biologiste est en allant à vouloir à savoir.
Droite ici, mon réponse but est à maximiser en direct corail couverture,
donc I vouloir à avoir haut désirabilité valeurs pour mon haut corail couverture niveaux.
I frapper d'accord, alors I aller dos dans ici et I dire Maximiser Désirabilité.
Sans surprise, ils rester le même, 8-12 mètres est où nous vouloir à
aiguiser dans sur notre recherche.
Mais ce pourrait être plus intéressant
à personnes que sont embarquement sur a champ voyage.
"Hé, nous avons a obtenu a semaine dans le pays,
nous vouloir à trouver riche haut corail couverture récifs
où devrait nous aller?" Bien, I pense toi devrait aller
à ce plus loin jeté îles dehors et plus loin loin depuis le équateur.
Comme tu vas voir plus tard, ces sont le plus
télécommande, peu- peuplé parties de le pays,
lequel est probablement où toi attendre à trouver plus corail.
A bien que c'est très similaire à le barrière récif,
tu ferais probablement vouloir à se concentrer sur ces autre types de récifs et barrière récifs,
si toi avoir le choix, contre franges récifs et correctif récifs.
I pense faire ce gentil de analyse
pourrait être important pour conservation et pour planification champ voyages.
Mais sans doute, ce est a petit peu de un de côté,
et nous avoir pas encore atteint le réel but à ce temps. C'est à venir en haut.
Tous droite, nous avons fait ces deux démos,
allons aller dos dans Présentation PowerPoint.
I vraiment souhait I avait plus temps pour ce, mais I juste savoir I ne le faites pas
et I sentir donc mauvais pour tous le développeurs et personnes que travail donc dur sur ce,
mais I prendre complet avantage de le multivarié plate-forme
et ce est en allant à être vraiment important parce que même cependant dans ce passé démos,
I juste regardé à en direct corail couverture, singulier ET.
Dans réalité, c'est complètement rabaissant le complexité de ces écosystèmes.
Il y a des centaines de des choses vie sur le mer sol.
Toi vraiment besoin à faire a multivarié analyse
où tu as a obtenu multiple Oui, multiple Xs.
Étaient parler à propos des choses comme principal composants analyse,
multi- dimensionnel mise à l'échelle, faire ces tous les jours dans JMP Pro.
Vraiment comme discriminant analyse.
Pour exemple, droite ici, ce a pris moi 1 minute.
I peut rapidement voir que récifs de Nous avons grandi. dans un multivarié échelle
sont très différent depuis ceux de le repos de le pays.
Si toi étaient à aller à le Salomon Îles, toi serait savoir,
ce est parce que ces sont récifs croissance à le base de un actif volcan.
Ils regarder très différent, ils se comporter très différemment.
Le multivarié benthique données corroborer ce.
De la même manière, nous voir ce bon effet. J'ai couleur- codé le récif sites
par exposition, si ils étaient protégé ou exposé à le flots ou intermédiaire.
Et toi peut voir joli bon analyse par exposition dans ce discriminant analyse.
Je suis a grand ventilateur de ces algorithmes et partiellement carrés dans particulier,
et J'ai a obtenu quelques caché diapositives et quelques scripts dans le données tableau
que Je vais faire publiquement disponible. Donc si toi vouloir à obtenir plus détail
à propos le beaucoup ariat analyse, tu es certainement accueillir à télécharger.
Mais quoi I vouloir à dépenser le repos de le parler sur
est le santé de le coraux eux-mêmes.
T a était regarder à le bento, le récif comme a entier.
Je suis a physiologiste, I vouloir à savoir qu'est-ce que en allant sur dans le coraux,
et I mesuré donc beaucoup différent des choses dans ces coraux sur le années
que I récemment créé quoi I appel le Indice de santé des coraux pour le arbre.
Ce est essentiellement un fusion de a bouquet de différent réponse variables
que I savoir depuis mon passé recherche échelle avec corail résilience.
Quoi J'ai fait est essayé à simplifier des choses à où si ton Corail Santé Indice
score est zéro, ce moyens tu es à propos à coup le seau.
Cinq moyens tu es immortel.
Anecdotes est [inaudible 00:28:25] comme coraux et méduse techniquement sont immortel
si gauche leur propre appareils et Non stresser, ils peut continuer à régénérer pour toujours
mais de cours, dans réalité, il y a toujours en allant à être quelques limitation.
Ils sont en allant à atteindre le surface, le eau est en allant à obtenir aussi froid,
mais ils peut en fait en direct pour toujours.
De toute façon, étaient pas en allant à voir n'importe lequel coraux leur cinq.
Ce essentiellement suit a cloche courbe donc étaient en allant à trouver la plupart de notre coraux,
leur santé indices sont dans ce 2-3 fenêtre.
Avec le aide de John Powell, il fait ces vraiment bon personnalisé à graphiques.
I adapté ce depuis quelques... Ils sont appelé ces vraiment
super corail récif rapport cartes. Ils sont développé par un ONG appelé AGRA.
I dit, I amour que visuel.
I vouloir à adapter il, mais se concentrer sur corail échelle.
Quoi ce est est chaque de ces extérieur quatre widgets,
lequel toi peut voir le détails ici,
le intérieur est essentiellement montrant toi le moyenne de le quatre widgets.
A s toi peut voir, étaient vision valeurs comme faible comme 1.5.
coraux et Lagon de Nono sembler à être le moins résilient.
La plupart de le personnes dans le Salomon Îles en direct fermer à le capital de Honiara.
Nous probablement serait attendre ce gentil de Ouest- est pente.
Nous tendre à voir plus haut Indice de santé des coraux valeurs
sur ici dans le provinces et le Îles récifales et Monte Carlo.
Ce est pas surprenant. Ce carte était fait avec Graphique Constructeur.
Allons-y voir. I pense I avoir assez temps.
Je suis pas en allant à essayer à reproduire ce carte
parce que I pense ce carte,
même cependant I amour il, I pense c'est toujours aussi compliqué pour a directeur.
Ils ne le faites pas vouloir à voir tous ces à widgets.
Ils vouloir a célibataire nombre.
I vouloir à montrer toi a vraiment cool astuce.
Il y a super webinaires à propos comment à parcelle données sur a carte sur le JMP site web
mais Je suis en allant à faire quelque chose que était nouveau à moi
et il pourrait en fait être utile à a parcelle de toi.
C'est prise il un étape plus loin.
Étaient en allant à faire il dans JMP Pro 16
parce que I vouloir à être capable à publier ce en ligne.
C'est pas encore a fonctionnalité dans JMP Pro 17 parce que c'est toujours le bêta version.
I vouloir à parcelle le Corail Santé Indice sur a carte.
Ce est en allant à être terriblement facile dans un graphique Constructeur.
Juste en allant à traîner mon latitude et longitude sur JMP nez
à traiter ces comme tel.
I ne le faites pas vouloir ce doubler.
Droite maintenant c'est juste montrant moi essentiellement le emplacement de mon plonger sites.
I vouloir à ajouter a arrière-plan carte.
Ce est le détaillé Terre. Allons-y faire il plus gros.
Nous voir le Salomon Îles maintenant.
Obtenir plus proche. I vouloir à recouvrir mon Corail H santé Indice
sa couleur.
Toujours pas là encore. I vouloir à convertir ce à a chaleur carte,
mais I vouloir a plus fin échelle de résolution
et ce est le astuce que I savant que I pense est en allant à être vraiment utile
parce que I était en fait faire ce ArcGIS avant, lequel est a PC- seulement programme.
Je suis sur a Mac, coût des milliers de dollars.
I dit, pourquoi ne peut pas I faire ce dans JMP? Et il tours dehors que I peut.
Quoi I vouloir à faire est I vouloir à forcer a plus petit grille sur ce carte
parce que I vouloir ces cellules à être beaucoup plus petit.
I vouloir eux à être 0,5 par 0,5 degrés.
Comme long comme toi tourner le grille lignes sur, c'est en allant à donner toi un moyenne
de le Corail Santé Indice dans chaque de ces 0,5 par 0,5 décimal degré boîtes.
C'est quoi I vouloir.
I en fait préférer à utiliser a vert à rouge, et le défaut est à avoir rouge être haut.
Si toi souviens-toi le image de le Corail Santé Indice,
I en fait avoir vert comme le haut valeur, donc Je suis en allant à changer il comme tel.
I en fait vouloir il à portée le entier gamme,
même cependant I ne le faites pas avoir beaucoup zéros ou cinq.
Je suis en allant à faire ce, traîner ce ici,
et maintenant I pense c'est regarder bien, mais c'est toujours aussi occupé.
Je suis en allant à tourner le grille lignes dos désactivé.
Il volonté garder le cellule formes que I vouloir.
Voilà, dans mon avis, ce est exactement
comment I vouloir à voir ces Corail Santé données représenté.
Mais Je suis en allant à prendre il encore un autre étape plus loin.
Je suis en allant à dire, "Hé, regarder, mon amis que avoir jamais vu
ces données, ils peut vouloir à jouer autour
avec le différent environnemental variables et voir comment ces changement
selon sur le taper de récif, le température et étagère.
Je suis en allant à ajouter ce locale données filtre.
En allant à donner ce a nom.
Toujours pas fait encore, cependant.
I vouloir à en fait partager ce avec mon amis.
Quoi Je suis en allant à faire, Je vais publier à JMP Publique.
Ce peut prendre a minute parce que I peut pas être connecté dans,
mais allons-y juste voir. Je suis en allant à créer a nouveau poste.
I vouloir à partager il avec tout le monde.
I peut ajouter un image si I vouloir.
Je suis juste en allant à partir tous ces valeurs par défaut comme est pour maintenant, et Bien publier il.
C'est en allant à prendre a peu secondes.
Avec un peu de chance il travaux Bien.
C'est en allant à émigrer moi sur à le site web,
et Je vais montrer toi, comme c'est fonctionnement, quoi toi peut alors faire une fois il publie.
Tous droite, ici nous aller.
Allons-y aller devant et vérifier il dehors en ligne d'abord.
Ce est quoi I peut partager avec mon amis donc ils peut dire,
"Hé, regarder, I seulement soins à propos récifs sur ... Je suis seulement en allant à être capable à aller
à le occidental partie de le pays pour mon champ voyage.
I ne le faites pas soins à propos ceux récifs dans le est.
Donc laisser moi juste tourner eux désactivé.
Alors c'est en allant à rafraîchir.
Alors toi peut aiguiser dans ton recherche ici.
Toi pourrait regarder à le différent récif types.
Un autre chose toi peut faire,
lequel I faire tous le temps, est toi peut en fait prendre le intégrer code
ou le intégrer carte, copie il, et mettre il dans ton personnel site web.
Parce que de le chemin mon sites Web ensemble en haut,
I avoir donc beaucoup rembourrage ici, c'est pas en fait en allant à montrer le carte très Bien.
C'est mieux pour moi à simplement faire quoi ils appel a carte
où J'ai a obtenu a schématique de il ici, et alors si personnes vouloir plus détails,
ils peut cliquez sur il et alors aller dos à JMP publique.
Ce est a super cool fonctionnalité que I pense personnes avec accéder à JMP
devrait être prise avantage de.
Ce est juste montrant toi comment toi peut
essentiellement même intégrer il dans ton site web, dans a présentation.
Mais I ne le faites pas pense nous besoin à entrer dans que.
A gagner, c'est un autre de côté, étaient enfin obtenir à le bien truc.
Ce est quoi J'ai a été vouloir à faire.
Ce est le but de ce entier analyse. Alors nous sommes presque à le finition doubler.
Ce est en utilisant le JMP Pro suite à essayer à trouver le climat- résilient coraux
que nous n'ont pas trébuché sur encore.
Nous généralement trouver climat résilient coraux
soit à travers expériences, à travers enquêtes.
Nous avons perdu ce temps fenêtre. Nous ne le faites pas avoir temps
à faire tous ces expériences, nous ne le faites pas avoir le argent.
Corail récifs sont dans mauvais forme.
Nous besoin a chemin à vitesse en haut le recherche pour le résilient coraux
que nous peut vouloir à utiliser pour restauration.
Le ceux nous peut vouloir à protéger, acheter ou préserver.
Quoi étaient en allant à faire est étaient en allant à faire a prédictif modèle
de le Corail Santé Indice nous factorisons dans tous le différent enquête données nous avons collecté.
Il sons intimidant, mais I pense tu vas voir ce est en fait
quelque chose que pourrait être fait relativement rapidement.
Dans ce cas, Je suis en allant à aller à un autre données tableau
c'est a obtenu mon corail physiologique données
et que est quelque part ici.
Ce est 110 rangées. Plutôt de plonger sites maintenant,
ces sont corail échantillons.
Ce est le écologique données. Le Corail Santé Indice est ici.
Étaient en allant à aller sur à mon bien-aimé modèle écran encore.
I probablement pourrait utiliser rappel,
mais juste à être sûr, étaient en allant à prendre 50 benthique catégories.
Ces sont le poubelles de des choses que en direct sur le récif.
Se déplacer eux ici.
Monde Santé Indice est quoi nous vouloir à prédire.
Étaient en allant à prendre ce validation colonne ici.
Étaient en allant à utiliser le même paramètres comme dernier temps.
Il apparence a petit peu différent parce que Je suis maintenant faire ce dans JMP Pro,
mais c'est fonctionnement très de la même manière.
I vouloir à faire le supplémentaire méthodes avec équations du second degré.
I pense ce volonté courir assez rapidement, et en effet il a fait.
Dans ce cas, a neural réseau que était boosté rose à le haut.
Validation R quadrillé de environ 0. 49,
c'est pas mauvais, allons courir il.
C'est en allant à être différent parce que de le chemin neural réseaux travail.
Ils peut varier en fait assez de façon spectaculaire
depuis courir à courir, en particulier quand toi avoir relativement plus petit données tailles comme le mien.
Mais étaient toujours dans le stade de baseball, 0,52.
Mais si toi savoir à propos neural réseaux, toi savoir, il y a tonnes de différent
modélisation paramètres que toi peut bricoler et peaufiner.
C'est pourquoi ce vraiment brillant annonce- dans depuis Dietrich Schmidt
a a été un absolu jeu changeur pour mon recherche.
Il créé a bon interface graphique c'est en allant à laisser moi regarder à potentiellement des milliers
de différent factorielle combinaisons de modélisation paramètres.
Mais aujourd'hui, pour le intérêt de temps, Je suis juste en allant à faire quatre.
I saisir le modèle exactement comme I a fait dans Modèle Écran,
mais maintenant tu vas voir ces options que sont spécifique à le neural réseau plate-forme.
I vouloir à juste regarder à, toi savoir quoi, Je suis en allant à expliquer ce
alors que c'est en cours d'exécution parce que il pourrait prendre a deuxième à courir
et étaient en cours d'exécution faible sur temps.
Je suis en allant à avoir à construire quatre modèles pour moi.
I pense tout est dans là comme I vouloir.
D'accord, maintenant laisser moi expliquer ce alors que c'est en cours d'exécution.
I pense I saisir quelque chose faux.
S'excuser pour que.
Allons-y voir, laisser moi redémarrage ce saisir ce année.
Ce est tous correct. I vouloir ces à varier.
I pense peut être ce était aussi faible.
Allons-y essayer il encore.
C'est essentiellement en allant à commencer en cours d'exécution ces modèles.
C'est en allant à utiliser le JMP défaut.
J'ai entendu, essentiellement il à effet de levier le pouvoir de conception de expériences
à essentiellement avoir le nombre de sigmoïde, linéaire,
et radial activation nœuds portée 0-4.
Nous peut avoir en haut à 20 booster. Je suis permettant le covariance à soit être
transformé ou non transformé, soit avec ou sans a robuste ajuster.
Parce que I vouloir à aller avec le minimum nombre de potentiel facteurs,
I vouloir à utiliser a poids pourriture algorithme.
Il donne moi ce bon sortir.
Allons-y voir si le R au carré de le validation modèles
a fait n'importe lequel mieux que le JMP défaut.
La plupart de le temps ils faire.
Dans ce cas, c'est pas chemin aussi beaucoup différent.
À propos 0,55
Nous peut courir il, il volonté demander moi à sauvegarder le sortir
et dans le en attendant c'est en allant à courir ce modèle
lequel peut fin en haut en fait être très similaire à le JMP défaut un.
Mais alors une fois il crache il dehors,
étaient en fait en allant à, peu importe donne nous, étaient en allant à aller avec il.
Je suis en allant à montrer toi,
supposant il était notre carré
ou un autre modélisation référence, que tu es heureux avec
quoi toi pourrait alors faire avec le analyse.
C'est en allant à être en allant dos dans le Désirabilité analyse.
Si toi juste ours avec moi un autre peu secondes, il devrait finition.
Quoi étaient en allant à faire est
étaient essentiellement en allant à aller dans le Profileur,
et Je suis en allant à dire le Profileur,
Hé, I vouloir à trouver le conditions, le environnemental conditions,
et le benthique conditions que plomb à le le plus élevé Corail Santé Indice notes.
Parce que c'est où I pourrait vouloir à se concentrer mon efforts pour conservation,
pour en essayant à trouver brésilien coraux.
Toi peut voir dans ce cas nous a obtenu a équitable peu plus haut notre quadrillé.
Allons-y aller dans le Profileur.
C'est probablement en allant à souviens-toi mon paramètres, juste sécurité,
allons aller, ensemble Désirabilité.
I vouloir à maximiser le Corail Santé Indice, donc il se souvient il.
Maintenant I vouloir à maximiser Désirabilité.
C'est en allant à dire moi le conditions
dans lequel Je suis en allant à trouver le coraux avec le le plus élevé Corail Santé Indice scores
Nous ne le faites pas avoir temps à aller dans tous ces, mais ce est en allant à être super utile
pour personnes que sont embarquement sur champ voyages, et à gestionnaires.
Ils sont en allant à dire, regarder, si I vouloir à trouver
le la plupart résilient coraux dans le Salomon Îles,
Je suis meilleur collage à intermédiairement exposé franges récifs, dans le lagune,
submergé récif types.
Quelques de ces peut pas faire comme beaucoup sens,
le temps de jour, température, toi peut pas avoir que luxe.
Des choses comme profondeur, toi vouloir à se concentrer sur peu profond coraux, dans ce exemple.
Ces sont en allant à être super utile données que sont en allant à permettre nous
à trouver résilient coraux sur a beaucoup plus rapide temps échelle.
Le important chose à note ici est
un chose à note est ces ne sont pas nécessairement le conditions
dans lequel toi trouver le la plupart coraux,
parce que, souviens-toi, plus est pas nécessairement plus sain,
mais ces sont des choses que sont bon marché à mesure.
Latitude, longitude, toi juste besoin a téléphone intelligent.
Température, toi besoin a thermomètre.
Toi ne le faites pas besoin à faire ces fantaisie, cher moléculaire analyse
par Doctorat scientifiques.
Toi peut former a haut école étudiant à aller dehors là et collecter ces données
que sont en allant à être vraiment informatif pour corail santé.
Mon idée est I avoir tous ces similaire données ensembles depuis tous sur le monde.
I peut commencer bâtiment quoi Je suis appel ce Corail Santé Atlas.
I peut utiliser Graphique Constructeur à faire ces bon parcelles
où Je suis montrant personnes où résilient coraux sont probable à être trouvé.
Ce est en allant à aide nous,
dans concert avec ces température basé modèles depuis Noé,
imaginer quoi le avenir récifs sont en allant à regarder comme,
où étaient en allant à trouver coraux dans le avenir,
lequel coraux sont en allant à en direct là.
Depuis étaient en cours d'exécution dehors de temps,
ne le faites pas inquiétude, Je suis pas en allant à lire désactivé ce liste.
Mais ce était pas complètement fait dans isolement.
I a fait évidemment bénéficié considérablement depuis le JMP Pro logiciel elle-même,
mais a parcelle de ces personnes derrière le scènes prêté leur soutien.
Quelques de toi ne le fera pas être surpris à voir ton nom là,
quelques de toi pourrait être surpris,
et c'est il était probablement parce que toi a donné a webinaire ou toi a écrit a blog
ou quelque chose que était vraiment inspirant à moi.
I espoir tu es heureux à voir ton nom en haut là.
I vraiment vouloir à donner a crier dehors à Diedrich Schmidt si il est sur,
pour développement que vraiment excellent auto- réglage ajouter- dans
c'est considérablement bénéficié mon recherche.
I aussi vouloir à donner a crier dehors à John Powell,
pas juste pour portion moi faire ceux chiffres,
mais parce que il était le personne que vraiment convaincu moi
que JMP est plus que juste a logiciel emballer.
Vous avez a obtenu ce réseau de vraiment talentueux individus derrière le scènes
que sont disposé et capable à aide toi le long de le chemin.
I vraiment apprécier John et tout le monde celui de quelqu'un d'autre soutien.
Donc avec que, Je vais fin mon parler
et Je suis probablement sur ici furieusement répondre des questions.
Si nous sont à n'importe lequel temps gauche, Je suis heureux à champ plus.
Bien, merci a parcelle.
