如何利用反應篩選中的平均值差異製作差異基因表現火山圖尊敬的專家們,
我正在嘗試製作一個差異基因火山圖,顯示與 JMP17.2 的平均值差異。我使用了響應篩選並使用列資訊設定了一個控件,但我找不到在哪裡應用“均值差”選項。到目前為止,我得到的圖表只是透過效應大小、Rsqured 或斜率來顯示 FDR 對數沃斯,我無法透過平均差來獲得 FDR 對數沃斯。在結果表中,我也看不到「平均值差異」。我在 JMP Pro YouTube 上關注了 JMP 學術:基因組學研究,但它沒有顯示均值差異是如何獲得的。
有人可以讓我知道如何解決這個問題嗎?多謝!
劉
基礎資料分析與建模回覆:如何利用反應篩選中的平均值差異製作差異基因表現火山圖嗨克里斯,
非常感謝您的幫忙!這很有幫助。我現在可以產生平均差的火山圖。
謝謝你!
劉
回覆:如何使用反應篩選中的平均值差異製作差異基因表現火山圖嗨@xliu ,
使用「分析」>「篩選」>「反應篩選」中的「反應篩選」時,有兩種方法可以顯示火山圖和平均差異表:
- 在執行「回應篩選」之前的對話方塊中,您可以勾選「通用 Y 比例」方塊。這假設所有回應都標準化為相同的比例。



現在,您將看到火山圖作為最後一個選項卡以及下面的平均差表。
希望有幫助,