如何在反应筛选中利用均值差绘制差异基因表达火山图尊敬的各位专家:
我正在尝试使用 JMP17.2 制作显示均值差异的差异基因火山图。我使用了响应筛选并使用列信息设置了控制,但我找不到在哪里应用“均值差异”选项。到目前为止,我得到的图表只有按效应大小、按 Rsqured 或按斜率的 FDR 对数,我无法获得按均值差异的 FDR 对数。并且在结果表中,我也看不到“均值差异”。我关注了 JMP Academic:JMP Pro YouTube 中的基因组学研究,但它没有显示如何获得均值差异。
有人能告诉我如何解决这个问题吗?非常感谢!
刘
基础数据分析与建模回复:如何利用反应筛选中的均值差异绘制差异基因表达火山图嗨,克里斯,
非常感谢您的帮助!这很有帮助。我现在可以生成均值差的火山图了。
谢谢你!
刘
回复:如何利用反应筛选中的均值差异绘制差异基因表达火山图嗨@xliu ,
使用“分析”>“筛选”>“响应筛选”中的“响应筛选”时,有两种方法可以显示火山图和平均差异表:
- 在运行“响应筛选”之前的对话框中,您可以选中“通用 Y 尺度”复选框。这假定所有响应都标准化为同一尺度。



现在,您将拥有火山图作为最后一个选项卡,以及下面的均值差异表。
希望有帮助,