반응 스크리닝에서 평균 차이를 사용하여 차등 유전자 발현 화산 플롯을 만드는 방법전문가 여러분,
저는 JMP17.2를 사용하여 평균 차이를 보여주는 차등 유전자 화산 플롯을 만들려고 합니다. 저는 반응 스크리닝을 사용하고 열 정보를 사용하여 제어를 설정했지만 "평균 차이" 옵션을 적용할 곳을 찾을 수 없었습니다. 지금까지 얻은 그래프는 효과 크기, Rsqured 또는 기울기에 따른 FDR 로그 가치만 있고, 평균 차이에 따른 FDR 로그 가치를 얻을 수 없었습니다. 그리고 결과 표에서도 "평균 차이"를 볼 수 없었습니다. 저는 JMP Pro YouTube에서 JMP Academic: Genomics Research를 따랐지만 평균 차이가 어떻게 얻어지는지 보여주지 않았습니다.
누가 이 문제를 해결하는 방법을 알려줄 수 있나요? 정말 고맙습니다!
류
기본 데이터 분석 및 모델링Re: 반응 스크리닝에서 평균 차이를 사용하여 차등 유전자 발현 화산 플롯을 만드는 방법안녕 크리스,
도와주셔서 정말 감사합니다! 도움이 되었습니다. 이제 평균 차이로 화산 플롯을 생성할 수 있게 되었습니다.
감사합니다!
류
Re: 반응 스크리닝에서 평균 차이를 사용하여 차등 유전자 발현 화산 플롯을 만드는 방법안녕하세요 @xliu 님 ,
분석>스크리닝>응답 스크리닝에서 응답 스크리닝을 사용할 때 Volcano 플롯과 평균 차이 표를 표시하는 방법은 두 가지가 있습니다.
- Response Screening을 실행하기 전에 대화 상자에서 Common Y Scale 상자를 체크할 수 있습니다. 이는 모든 Response가 동일한 스케일로 정규화되었다고 가정합니다.
- 보고서의 빨간색 삼각형으로 이동하여 평균 차이 표시를 선택하세요.
- 아래와 같은 창이 나타납니다. 계속을 클릭하세요.
이제 마지막 탭에 화산 플롯이 있고 그 아래에 평균 차이 표가 있습니다.
도움이 되길 바랍니다.
