So erstellen Sie ein Vulkandiagramm der differentiellen Genexpression unter Verwendung von Mittelwertunterschieden beim ReaktionsscreeningLiebe Expertinnen und Experten,
Ich versuche, ein Differentialgen-Vulkandiagramm zu erstellen, das die Mittelwertdifferenz mit JMP17.2 zeigt. Ich habe eine Antwortüberprüfung verwendet und eine Kontrolle mithilfe der Spalteninformationen festgelegt, konnte aber nicht finden, wo ich die Option „Mittelwertdifferenz“ anwenden kann. Die Diagramme, die ich bisher erhalten habe, haben nur FDR-Logworth nach Effektgröße, nach Rsqured oder nach Steigung, ich konnte keinen FDR-Logworth nach Mittelwertdifferenz erhalten. Und in der Ergebnistabelle konnte ich die „Mittelwertdifferenz“ auch nicht sehen. Ich habe mir das YouTube-Video „JMP Academic: Genomics Research in JMP Pro“ angesehen, aber es wurde nicht gezeigt, wie die Mittelwertdifferenz ermittelt wurde.
Kann mir jemand sagen, wie ich dieses Problem lösen kann? Vielen Dank!
Liu
Grundlegende Datenanalyse und ModellierungBetreff: So erstellen Sie ein Vulkandiagramm der differentiellen Genexpression unter Verwendung von Mittelwertunterschieden beim ReaktionsscreeningHallo Chris,
Vielen Dank für die Hilfe! Sie war hilfreich. Ich konnte jetzt das Vulkandiagramm mit Mittelwertdifferenz erstellen.
Danke schön!
Liu
Betreff: So erstellen Sie ein Vulkandiagramm der differentiellen Genexpression unter Verwendung von Mittelwertunterschieden beim ReaktionsscreeningHallo @xliu ,
Es gibt zwei Möglichkeiten, das Vulkandiagramm und die Tabelle mit den mittleren Unterschieden anzuzeigen, wenn Sie die Antwort-Screening-Funktion unter Analysieren > Screening > Antwort-Screening verwenden:
- Im Dialogfeld vor dem Ausführen der Antwortüberprüfung können Sie das Kontrollkästchen Gemeinsame Y-Skala aktivieren. Dies setzt voraus, dass alle Antworten auf dieselbe Skala normalisiert sind.
- Gehen Sie zum roten Dreieck im Bericht und wählen Sie Mittelwertunterschiede anzeigen
- Sie werden in einem Fenster wie unten angezeigt aufgefordert. Klicken Sie auf Weiter
Sie sehen nun als letzte Registerkarte das Vulkandiagramm und darunter die Mittelwertdifferenztabelle.
Hoffe, das hilft,
