使用生物反應器中拉曼監測的光譜數據(代謝物數據)的 PLS 進行預測我發現了一篇附帶的短論文,涉及使用 PLS(偏最小二乘法)預測從生物反應器內的拉曼設備獲得的即時光譜數據。我還附上了可用於此目的的原始資料。該原始數據來自 Thermofisher 科學韓國的潛在用戶。
是否可以在 JMP 中預測這樣的頻譜資料?我經常遇到生物製藥領域的 USP 研究人員,他們對使用拉曼數據表現出濃厚的興趣。這個數據和論文就是一個很好的例子。

我已經標記了 Chris ( @Chris_Kirchberg ) 和 Ben ( @Ben_BarrIngh @Bingh94 ),他們可能對此有寶貴的見解。
回覆:使用生物反應器中拉曼監測的光譜數據(代謝物數據)的 PLS 進行預測嗨@HyeWonJung ,
我將查看隨附的 PDF 以了解更多相關信息,但它最初聽起來像是即時預測?那麼,當探測器測量值時,它會預測下一個點是什麼?這聽起來像是預測/時間序列之類的數據,其模型會在獲取新數據時更新。
閱讀 PDF 後我可能會有更多問題/答案
回覆:使用生物反應器中拉曼監測的光譜數據(代謝物數據)的 PLS 進行預測嗨@HyeWonJung,我快速瀏覽了一下,但看起來數據可能不完整。例如,本文顯示的圖表的 x 軸值為 2022 年,但 rama results.jmp 表時間戳均為 2023 年。
你從哪裡得到數據?還有更多可用嗎?是否有任何程式碼顯示他們如何擬合 PLS 模型和計算的預測統計數據?他們使用了什麼 X 和 Y?
我們很可能可以重現他們所做的事情,並可能使用比 PLS 更現代的方法來改進預測結果,但我們需要從他們所做的相同的地方開始。
回覆:使用生物反應器中拉曼監測的光譜數據(代謝物數據)的 PLS 進行預測這是公開數據嗎?如果是,那麼我們就可以使用它,但需要給出它的來源。如果是不公開的客戶數據,我們必須立即刪除它,並且不幸的是不能使用它。正如 Russ 所提到的,我們需要離線資料來使用基本事實(標籤)建立預測模型。閱讀論文後,該模型似乎是為了校準目的而構建的,因此可以正確顯示值。數據表中的數據看起來像是以代謝物為單位的預測值。我們還需要原始光譜來建立預測模型。
回覆:使用生物反應器中拉曼監測的光譜數據(代謝物數據)的 PLS 進行預測@russ_wolfinger @Chris_Kirchberg我很抱歉沒有清楚地回答我之前的問題。我提到的數據和論文無關。這些數據是私人數據,由 Thermofisher 韓國科學公司的一位潛在客戶提供給我。 (正如克里斯建議的那樣,我已經刪除了數據。)
潛在客戶向我發送了即時拉曼數據,並詢問如何在 JMP 中使用它。他沒有具體說明他們希望如何利用這些數據。
我透過個人管道獲得了PDF,以尋找利用拉曼數據的方法。查看材料後,我猜測他們可能在尋找什麼。
無論如何,我會具體詢問客戶他們想要實現什麼以及他們對這些數據的期望。
回覆:使用生物反應器中拉曼監測的光譜數據(代謝物數據)的 PLS 進行預測@russ_wolfinger @克里斯_基希伯格 他(我的潛在客戶)擁有數據,但他並不真正知道如何有效地利用它。他是一個遠離數據分析的人。所以我在pdf中搜尋了拉曼的實際用例,以便在售前會議上向他展示實際案例。不過,我認為最好具體詢問客戶他們想要實現什麼。並且..如果您對拉曼數據的利用有任何好的想法,請隨時分享。
回覆:使用生物反應器中拉曼監測的光譜數據(代謝物數據)的 PLS 進行預測@HyeWonJung非常感謝您的澄清——現在有意義了!我被標題和 Thermo-Fisher 論文中的預測建模問題所吸引,並且很想獲得這些數據。對於您的客戶數據,看起來更好的起點是更具探索性和模式發現的方法。
JMP 在這裡非常強大,具有多種可能性:多變量、探索離群值、功能資料瀏覽器、控制圖產生器。
如果對話發展為預測建模,我們將需要設定合理的輸入 (X) 和輸出 (Y)。這開啟了一系列全新的可能性,我們仍然保持強大,甚至擁有巧妙的方法,例如將大量資料轉換為影像。
回覆:使用生物反應器中拉曼監測的光譜數據(代謝物數據)的 PLS 進行預測我會和客戶討論具體細節,如果遇到任何困難,我會向您尋求協助。謝謝你!