使用 PLS 对生物反应器中拉曼监测的光谱数据(代谢物数据)进行预测我偶然发现了一篇附件中的短文,它涉及使用 PLS(偏最小二乘法)预测从生物反应器内的拉曼设备获得的实时光谱数据。我还附上了可用于此目的的原始数据。这些原始数据来自 Thermofisher scientific Korea 的潜在用户。
是否有可能在 JMP 中预测这样的光谱数据?我经常遇到生物制药领域的 USP 研究人员,他们对使用拉曼数据表现出浓厚的兴趣。这些数据和论文就是很好的例子。

我已标记 Chris ( @Chris_Kirchberg ) 和 Ben ( @Ben_BarrIngh @Bingh94 ),他们可能对此有宝贵的见解。
回复:使用 PLS 对生物反应器中拉曼监测的光谱数据(代谢物数据)进行预测嗨@HyeWonJung ,
我将查看附件 PDF 以了解更多信息,但乍一看这听起来像是实时预测?所以当探测器测量值时,它会预测下一个点是什么?这听起来像是使用模型进行预测/时间序列数据,该模型在获取新数据时会进行更新。
阅读 PDF 后,我可能会有更多的问题/答案
回复:使用 PLS 对生物反应器中拉曼监测的光谱数据(代谢物数据)进行预测嗨@HyeWonJung我快速浏览了一下,但似乎数据可能不完整。例如,论文显示了 2022 年 x 轴值的图表,但 rama results.jmp 表时间戳都是 2023 年。此外,看起来我们没有“离线”数据。
您从哪里获得数据?还有更多可用数据吗?有没有代码显示他们如何拟合 PLS 模型并计算预测统计数据?他们使用了哪些 X 和 Y?
我们很可能可以重现他们所做的事情,并可能使用比 PLS 更现代的方法来改进预测结果,但我们需要从他们所做的事情的同一地方开始。
回复:使用 PLS 对生物反应器中拉曼监测的光谱数据(代谢物数据)进行预测这是公开数据吗?如果是,那么我们可以使用它,但需要提供其来源。如果是非公开的客户数据,我们必须立即删除它,很遗憾不能使用它。正如 Russ 所提到的,我们需要离线数据来使用基本事实(标签)构建预测模型。阅读论文后,看起来该模型是为了校准目的而构建的,因此它可以正确显示值。数据表中的数据看起来像以代谢物为单位的预测值。我们还需要原始光谱来构建预测模型。
回复:使用 PLS 对生物反应器中拉曼监测的光谱数据(代谢物数据)进行预测@russ_wolfinger @Chris_Kirchberg我很抱歉我之前的问题没有回答清楚。我提到的数据和论文没有关系。这些数据是私密的,是 Thermofisher scientific Korea 的一位潜在客户提供给我的。(正如 Chris 所建议的,我删除了这些数据。)
潜在客户给我发了实时拉曼数据,并询问如何在 JMP 中使用这些数据。他没有具体说明他们想如何使用这些数据。
我通过私人渠道获得了 PDF 文件,以寻找利用拉曼数据的方法。在查看了材料后,我猜到了他们可能在寻找什么。
无论如何,我会具体询问客户他们想要实现什么以及他们期望从这些数据中得到什么。
回复:使用 PLS 对生物反应器中拉曼监测的光谱数据(代谢物数据)进行预测@russ_wolfinger @Chris_Kirchberg 他(我的潜在客户)有数据,但他并不真正知道如何有效地利用它。他离数据分析还很远。所以我在 pdf 上搜索了拉曼的实际用例,以便在售前会议上向他展示实际案例。但是,我认为最好具体询问客户他们想要实现什么。并且……如果您有任何与拉曼数据的利用相关的好主意,请随时分享。
回复:使用 PLS 对生物反应器中拉曼监测的光谱数据(代谢物数据)进行预测@HyeWonJung非常感谢您的澄清——现在说得通了!我被标题和 Thermo-Fisher 论文中的预测建模问题所吸引,并希望能够获得这些数据。对于您的客户数据,看起来更好的起点是更具探索性和模式发现性的方法。
JMP 在这里非常强大,具有众多可能性:多元变量、探索异常值、功能数据探索器、控制图生成器。
如果讨论转向预测模型,我们需要设置合理的输入 (X) 和输出 (Y)。这开辟了一系列全新的可能性,我们仍然保持强大,甚至有巧妙的方法,例如将批量数据转换为图像。
回复:使用 PLS 对生物反应器中拉曼监测的光谱数据(代谢物数据)进行预测具体情况我会跟客户商量,如果遇到困难,会找你帮忙,谢谢!