Previsione mediante PLS dei dati dello spettro (dati del metabolismo) monitorati da Raman in un bioreattoreMi sono imbattuto in un breve documento allegato relativo alla previsione di dati spettrali in tempo reale ottenuti da un dispositivo Raman all'interno di un bioreattore utilizzando PLS (minimi quadrati parziali). Ho anche allegato i dati grezzi che possono essere utilizzati a questo scopo. Questi dati grezzi provengono da un potenziale utente di Thermofisher Scientific Korea.
È possibile prevedere dati spettrali come questi in JMP? Spesso incontro ricercatori USP in ambito biofarmaceutico che mostrano un forte interesse nell'uso dei dati Raman. e questi dati e questo articolo ne sono un ottimo esempio.
Ho taggato Chris ( @Chris_Kirchberg ) e Ben ( @Ben_BarrIngh @Bingh94 ), che potrebbero darmi preziosi consigli in merito.
Oggetto: Previsione mediante PLS dei dati dello spettro (dati del metabolismo) monitorati da Raman in un bioreattoreCiao @HyeWonJung ,
Darò un'occhiata al PDF allegato per saperne di più, ma inizialmente sembra una previsione in tempo reale? Quindi, mentre la sonda misura i valori, sta facendo una previsione di quale sarà il punto successivo? Sembra una previsione/serie temporale come dati con un modello che si aggiorna man mano che riceve nuovi dati.
Probabilmente avrò più domande/risposte una volta letto il PDF
Oggetto: Previsione mediante PLS dei dati dello spettro (dati del metabolismo) monitorati da Raman in un bioreattoreCiao @HyeWonJung Ho dato un'occhiata veloce ma sembra che i dati siano incompleti. Ad esempio, il documento mostra grafici con valori dell'asse x del 2022 ma i timestamp della tabella rama results.jmp sono tutti del 2023. Inoltre, sembra che non abbiamo i dati "offline".
Da dove hai preso i dati? Ce ne sono altri disponibili? C'è del codice che mostra come hanno adattato i loro modelli PLS e le statistiche di previsione calcolate? Quali X e Y hanno usato?
Molto probabilmente possiamo riprodurre ciò che hanno fatto loro e probabilmente migliorare i risultati delle previsioni utilizzando metodi più moderni del PLS, ma dobbiamo partire dallo stesso punto da cui hanno iniziato loro.
Oggetto: Previsione mediante PLS dei dati dello spettro (dati del metabolismo) monitorati da Raman in un bioreattoreSi tratta di dati pubblici? Se lo sono, allora possiamo usarli e dobbiamo indicarne la fonte. Se si tratta di dati dei clienti non pubblici, dobbiamo eliminarli immediatamente e sfortunatamente non possiamo usarli. E come ha detto Russ, avremmo bisogno dei dati offline per creare un modello predittivo usando la verità di base (le etichette). Dopo aver letto il documento, sembra che il modello sia stato creato per scopi di calibrazione in modo che possa visualizzare correttamente i valori. I dati nella tabella dei dati sembrano valori previsti in unità del metabolita. Avremmo bisogno anche degli spettri originali per creare il modello predittivo.
Oggetto: Previsione mediante PLS dei dati dello spettro (dati del metabolismo) monitorati da Raman in un bioreattore@russ_wolfinger @Chris_Kirchberg Mi scuso per non essere stato chiaro nella mia domanda precedente. I dati e il documento a cui ho fatto riferimento non sono correlati. I dati sono privati e mi sono stati forniti da un potenziale cliente di Thermofisher Scientific Korea. (Come consigliato da Chris, ho eliminato i dati.)
Il potenziale cliente mi ha inviato dati Raman in tempo reale e ha chiesto come potessero essere utilizzati all'interno di JMP. Non ha specificato esattamente come desidera utilizzare questi dati.
Ho ottenuto il PDF tramite un canale personale per trovare modi per utilizzare i dati Raman. Dopo aver esaminato i materiali, ho intuito cosa potessero cercare.
In ogni caso, chiederò specificatamente al cliente cosa vuole ottenere e cosa si aspetta da questi dati.
Re: Previsione mediante PLS dei dati dello spettro (dati del metabolismo) monitorati da Raman in un bioreattore@russ_wolfinger @Chris_Kirchberg Lui (il mio potenziale cliente) ha i dati, ma non sa davvero come utilizzarli in modo efficace. È una persona lontana dall'analisi dei dati. Quindi ho cercato in pdf casi di utilizzo pratico con Raman per mostrargli casi pratici in un incontro di prevendita. Tuttavia, penso che sarebbe meglio chiedere al cliente in modo specifico cosa vuole ottenere. E... Se hai delle buone idee relative all'utilizzo dei dati Raman, sentiti libero di condividerle.
Oggetto: Previsione mediante PLS dei dati dello spettro (dati del metabolismo) monitorati da Raman in un bioreattore@HyeWonJung Grazie mille per la precisazione, ora ha senso! Sono stato attratto dal problema della modellazione predittiva come nel titolo e nel documento Thermo-Fisher e mi piacerebbe molto mettere le mani su quei dati. Per i dati dei tuoi clienti, sembra che un punto di partenza molto migliore sarebbe un approccio più esplorativo e di scoperta di modelli.
JMP è molto efficace in questo caso, offrendo numerose possibilità: Multivariato, Esplora valori anomali, Esplora dati funzionali, Generatore di grafici di controllo.
Se la conversazione evolve verso la modellazione predittiva, dovremmo impostare input (X) e output (Y) ragionevoli. Ciò apre un'intera nuova serie di possibilità e rimaniamo altrettanto potenti, e abbiamo persino approcci intelligenti come la conversione di dati batch in immagini.
Oggetto: Previsione mediante PLS dei dati dello spettro (dati del metabolismo) monitorati da Raman in un bioreattoreDiscuterò i dettagli con il cliente e, se dovessi incontrare delle difficoltà, ti contatterò per chiedere aiuto. Grazie!
