La photométrie à fibre est une technique de pointe qui capture en temps réel l'activité cérébrale in vivo chez les animaux de laboratoire. Souvent alignée sur les données comportementales enregistrées par vidéo, la photométrie par fibre permet aux scientifiques d'associer directement le comportement observé et la signalisation cérébrale. Bien que la photométrie à fibre soit utile pour de nouvelles expériences comportementales, chaque étape expérimentale (collecte de données, traitement, analyse) introduit un risque d'erreur. Il est donc essentiel de garantir la reproductibilité de la recherche, mais la taille des ensembles de données (jusqu'à 0,25 gigaoctets) rend le contrôle qualité une tâche fastidieuse.
JMP Graph Builder fournit une excellente interface pour identifier de manière dynamique et efficace les problèmes de contrôle qualité. Dans un projet utilisant la photométrie par fibre pour comprendre comment la signalisation de la noradrénaline accompagne le comportement de peur chez les rongeurs, nous avons utilisé JMP pour détecter un désalignement entre les données comportementales suivies par Ethovision XT et les données de photométrie par fibre, afin de permettre une identification facile des perturbations du suivi comportemental et de garantir que des modèles étaient présents. Ces contrôles de qualité ont permis de comprendre, d'intervenir et de corriger en temps opportun l'ensemble de données, favorisant ainsi l'intégrité de la recherche. De plus, les tracés de contrôle qualité ont donné aux scientifiques une manière nouvelle et perspicace de comprendre leurs expériences.
Graph Builder a fourni des contrôles de qualité des données pour une analyse solide via la plateforme de modélisation de JMP. Les scientifiques ont également pu utiliser des scripts JMP et ont été motivés à apprendre eux-mêmes à utiliser JMP grâce à ce processus. Dans cette présentation, nous présentons le problème du contrôle qualité pour des ensembles de données volumineux et complexes, comme en témoigne la photométrie à fibre, et comment les capacités graphiques de JMP nous ont permis de garantir des données de qualité et des recherches reproductibles.
