La herramienta de mapeo de datos clínicos de JMP es un complemento que se instala con JMP Clinical 18 y que permite asignar nombres de columnas en diversos tipos de archivos, como .sas7bdat, .xls/.xlsx, .csv, .txt o .jmp, que podrían no cumplir con el estándar CDISC, a nombres de variables de SDTM y guardarlos con los nombres y extensiones de archivo adecuados (.jmp) para los diferentes conjuntos de datos utilizados por JMP Clinical. Este video ofrece una descripción general de los componentes de la herramienta.
Haga clic aquí para acceder a la documentación del complemento de la herramienta de mapeo de datos clínicos de JMP.
Transcripción:
Este vídeo ofrece una descripción general de la herramienta de mapeo de datos en JMP Clinical 18. Esta herramienta permite preparar datos que podrían no cumplir con el estándar CDISC, asignando nombres de columnas de diversos tipos de archivo a nombres de variables de SDTM y guardando los archivos para que JMP Clinical pueda utilizarlos. Puede guardar la configuración como plantilla para abrirla y ejecutarla automáticamente cada vez que reciba un nuevo fragmento de datos.
La herramienta de mapeo de datos está disponible en el menú Complementos. La forma más sencilla de acceder a este menú es haciendo clic en el icono de JMP en la ventana principal de JMP Clinical .
Seleccionaré la herramienta JMP Clinical Data Mapping Tool en el menú Complementos y luego podré cerrar esta ventana. La herramienta consta de cuatro componentes: Requisitos del informe, Datos de entrada del estudio, Datos de salida del estudio y Agregar, actualizar o modificar el estudio. Analizaremos brevemente cada componente en este video.
Expandiré la sección Requisitos del informe haciendo clic en el icono de expansión. Esta sección está contraída por defecto, ya que normalmente no se modifica nada aquí. Pero si desea ver los dominios y las variables que la herramienta considera, e intenta crear si no existen, puede expandir la sección Resumen.
En la segunda sección, especificas dónde encontrar tus datos de entrada. En el caso más sencillo, trabajarás directamente con una carpeta de datos de entrada. Pero si tus datos no están prácticamente listos (es decir, si requieren muchas transformaciones antes de poder utilizarlos en JMP Clinical), tienes la opción de especificar o grabar un flujo de trabajo que creará los archivos de la carpeta de entrada.
En la sección Datos de salida del estudio, puede especificar si desea que la herramienta de mapeo cree únicamente las variables necesarias que no existían, o si desea crear variables opcionales adicionales. Si elige esta opción, puede hacer clic en el botón Agregar para seleccionar las variables que la herramienta considerará para su creación.
Puedes especificar la carpeta de salida, donde la herramienta guardará los archivos resultantes del proceso de mapeo. Hay una sección de vista previa para cada dominio, que te indicará qué variables se crearán, y otra sección que te permite especificar las fuentes de datos de entrada para las nuevas columnas de salida.
En la cuarta sección, puede configurar la herramienta para que agregue, actualice o renueve automáticamente un estudio, utilizando la carpeta de salida de esta herramienta como carpeta de entrada para dicho estudio. Puede escribir un nuevo nombre para el estudio o seleccionar el nombre de uno existente. Al hacer clic en el botón Agregar, Actualizar o Renovar estudio, se inicia la operación de gestión de estudio correspondiente.
Finalmente, una vez que hayas configurado todos los ajustes y comprobado que funcionan correctamente, puedes guardar una plantilla que conserve dicha configuración y que puedas abrir en la herramienta de mapeo en el futuro para ahorrarte tiempo. Además, como parte de la plantilla, puedes especificar las tareas que se ejecutarán al cargarla. Por ejemplo, puedes configurar la plantilla para que ejecute automáticamente un flujo de trabajo de entrada y se detenga ahí.
Para obtener más detalles sobre los diferentes componentes de la herramienta de mapeo de datos en JMP Clinical, consulte la documentación que aparece en esta página.
